系統ゲノム学による頭足類の進化の統合的理解
系統ゲノム学による頭足類の進化の統合的理解
批准号:
12F02330
负责人:
遠藤 一佳
金额:
$1.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012-04-01 至 2015-03-31
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本研究の主な目的は、頭足類の進化を総合的に理解することである。目的を達成するためには、以下の二つのサブテーマで研究を進めて行く。1.頭足類オウムガイの貝殻基質タンパク質の同定本研究で,オウムガイ Nautilus pompilius の貝殻基質タンパク質の同定をした.具体的には,61個の貝殻基質水溶性タンパク質を同定した.そのうちの36タンパクについて,保存的機能ドメインの同定が出来た.また,ゲノム情報が報告された貝殻を持つ軟体動物(貝殻亜門)の3種のアコヤガイ,カサガイ,カキの情報と比較ゲノム学的解析を行った結果,同定された様々なドメインのうち,14個が4種の全て(オウムガイ,アコヤガイ,カサガイ,カキ)にあることがわかった.その結果をもとに,軟体動物における貝殻形成や生体鉱物関連遺伝子やタンパク質の進化について議論した.上記した結果についての中間報告を学会で3回報告した(2012バイオミネラルワークショップにポスター発,2013JPGU(地球惑星科学連合大会)及び2015バイオミネラルワークショップで口頭発表).研究が最終段階まで到達したため現在,すべての結果をまとめて文章に起こしており,今年の上半期には論文投稿する予定である.2.頭足類の系統ゲノム解析現在,HiSeq次世代シーケンサーによるトランスクリプトーム配列決定が終わり,そのシーケンスアセンブリーも終わった.これから,系統解析に有用な相同遺伝子マーカーを選び、次いで、系統解析や分岐年代推定を行う予定である.本研究の最終成果を27年度中に学術論文に報告することを目指している.
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DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shimizu K, Iijima M, Setiamarga DHE, Sarashina I, Kudo T, Asami T, Gittenberger E, Endo K, Setiamarga DHE and Endo K, Setiamarga DHE and Endo K]
通讯作者:
Setiamarga DHE and Endo K
Left-right asymmetric expression of dpp induces shell coiling in gastropods
dpp 左右不对称表达诱导腹足动物壳卷曲
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
BMC EvoDevo
影响因子:
--
作者:
[Shimizu K, Iijima M, Setiamarga DHE, Sarashina I, Kudo T, Asami T, Gittenberger E, Endo K]
通讯作者:
Endo K
Mitochondrial Phylogenomics Supports The Monophylies of Extant Amphibians and Batrachia
线粒体系统基因组学支持现存两栖动物和蛙类的单系性
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Setiamarga DHE, Machida, N, Setiamarga IHT, and Endo K]
通讯作者:
and Endo K
Genomic Exploration of the Nautilus’ Shell Matrix Hydrophilic Proteins: An Insight To Their Evolution in Mollusks
鹦鹉螺壳基质亲水蛋白的基因组探索:了解它们在软体动物中的进化
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shimizu K, Iijima M, Setiamarga DHE, Sarashina I, Kudo T, Asami T, Gittenberger E, Endo K, Setiamarga DHE and Endo K]
通讯作者:
Setiamarga DHE and Endo K
Paleoproteomic surveys
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批准号:23K17698
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2023
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负责人:遠藤 一佳
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依托单位:
太平洋域の放散虫類の分子系統、遺伝的多様性、生物地理
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批准号:11F01741
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2011
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负责人:遠藤 一佳
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依托单位:
陸生貝類の分子古生物学的研究:小笠原諸島のカタマイマイ類を例として
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批准号:15654070
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2003
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负责人:遠藤 一佳
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依托单位:
巻貝の殻はいかにして巻くか?:殻形成因子の探索
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批准号:09740386
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:遠藤 一佳
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依托单位:
生体硬組織に含まれるタンパク質の機能と起源の研究
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批准号:08740401
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:遠藤 一佳
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依托单位:
腕足動物の起源に関する分子系統学的研究
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批准号:06740399
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:遠藤 一佳
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依托单位:
海外基金