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細菌細胞壁ペプチドグリカン部分構造ライブラリ構築と網羅的な被認識構造・機能の解析

細菌細胞壁ペプチドグリカン部分構造ライブラリ構築と網羅的な被認識構造・機能の解析
细菌细胞壁肽聚糖子结构库的构建及已识别结构和功能的综合分析
批准号:
11J01965
负责人:
王 ニン
金额:
$0.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2012

项目摘要

项目成果

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細菌細胞壁ペプチドグリカン(PGN)は、免疫刺激活性を持つことが知られており、自然免疫受容体であるNod1,Nod2により認識され免疫系が活性化されるとともに、ペプチドグリカン認識タンパク質(PGRP)による認識、あるいは他の分解酵素、レクチンによる認識が知られている。しかしながら、その被認識構造の詳細は一部を除き詳細が明らかになっていない。そこで、PGNのフラグメント構造について、特に二糖、四糖を中心とした天然型の種々のペプチド含有構造についての合成法を確立しライブラリ構築を行った。また、比較的長鎖の糖鎖を認識する認識タンパク質についての検討については、まず、八糖構造を用いたペプチドグリカン認識タンパク質の認識ドメインでの認識部位における解析を行う事とし、八糖構造を持つPGNフラグメントの合成法検討を行うとともに、八糖ヘプタペプチド構造合成に成功した。一方、以上で合成した種々の部分構造について、認識タンパク質、受容体タンパク質の活性化を介した生物活性解析を行い、特有の活性を見出している。我々はさらにPGNフラグメント・ライブラリ構築について、リンカー導入法構築に成功し、遊離アミノ基を持つリンカーを用い、カルボン酸結合型のプレートを用いたアレイ化に成功した。また、作成したアレイを用い、既知のタンパク質-PGNの結合強度を再現した結果を得るとともに、数種のタンパク質との網羅的解析に成功し、いくつかの新規な相互作用に関する情報を得ることに成功した。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Synthesis of peptidoglycan fragment library for analysis of receptor recognition
用于受体识别分析的肽聚糖片段库的合成
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [Ning Wang, Cheng-yuan Huang, Yukari Fujimoto. Koichi Fukase]
通讯作者: Yukari Fujimoto. Koichi Fukase
Synthesis of Peptidoglycan Fragments Library for Exploring Recognition Proteins
用于探索识别蛋白的肽聚糖片段库的合成
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [Ning Wang, Cheng-yuan Huang, Yukari Fujimoto, Koichi Fukase]
通讯作者: Koichi Fukase
国内基金
海外基金
基于标准样品的Microarray与RNA-seq噪声分析与消除
  • 批准号:
    31601085
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    郁颖
  • 依托单位:
用microarray技术和表达序列标签(EST)技术鉴定Bt水稻对稻田蜘蛛优势种群生存的影响
  • 批准号:
    31272339
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    81.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    王智
  • 依托单位:
TWIST2的抑癌基因功能研究
  • 批准号:
    31170755
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    赵昀
  • 依托单位:
调控动纤毛形成与功能的分子机制研究
  • 批准号:
    31171286
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    余娴文
  • 依托单位: