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細菌細胞壁ペプチドグリカン部分構造ライブラリ構築と網羅的な被認識構造・機能の解析

细菌细胞壁肽聚糖子结构库的构建及已识别结构和功能的综合分析

基本信息

批准号：
11J01965
负责人：
王ニン
金额：
$ 0.83万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11J01965/
关键词：
peptidoglycan microarray recognition proteins fluorescent Innate immunity chemical synthesis glycosylation

项目摘要

細菌細胞壁ペプチドグリカン(PGN)は、免疫刺激活性を持つことが知られており、自然免疫受容体であるNod1,Nod2により認識され免疫系が活性化されるとともに、ペプチドグリカン認識タンパク質(PGRP)による認識、あるいは他の分解酵素、レクチンによる認識が知られている。しかしながら、その被認識構造の詳細は一部を除き詳細が明らかになっていない。そこで、PGNのフラグメント構造について、特に二糖、四糖を中心とした天然型の種々のペプチド含有構造についての合成法を確立しライブラリ構築を行った。また、比較的長鎖の糖鎖を認識する認識タンパク質についての検討については、まず、八糖構造を用いたペプチドグリカン認識タンパク質の認識ドメインでの認識部位における解析を行う事とし、八糖構造を持つPGNフラグメントの合成法検討を行うとともに、八糖ヘプタペプチド構造合成に成功した。一方、以上で合成した種々の部分構造について、認識タンパク質、受容体タンパク質の活性化を介した生物活性解析を行い、特有の活性を見出している。我々はさらにPGNフラグメント・ライブラリ構築について、リンカー導入法構築に成功し、遊離アミノ基を持つリンカーを用い、カルボン酸結合型のプレートを用いたアレイ化に成功した。また、作成したアレイを用い、既知のタンパク質-PGNの結合強度を再現した結果を得るとともに、数種のタンパク質との網羅的解析に成功し、いくつかの新規な相互作用に関する情報を得ることに成功した。

Bacterial cell wall ペプチドグリカン(PGN)は, immunostimulatory activity をhold つことがknow られており, natural immune receptor であるNod1, Nod2 によりknow されimmunity System activated されるとともに, ペプチドグリカン recognition タンパク性(PGRP)によるKnowing, あるいは他のcatalytic enzyme, レクチンによるKnowing が知られている.しかしながら, その是cognized structure のDetails は一一を出きが明らかになっていない. It is natural Typeのkind々のペプチドContains structureについての synthesis methodをestablishedしライブラリconstructionを行った.また、Comparative long lock のsugar lock をKnowing するKnowing タンパク之quality についての検question については, まず, Hachisaccharide structure を Use いたペプチドグリカンknow タンパクquality のknowドメインでのcognition partsにおけるanalyticsを行う事とし, eight sugar structuresをholdつPGNフラグメThe synthesis method of ントのをを行うとともに, and the eight sugar ヘプタペプチド structural synthesis were successful. On the one hand, the above-mentioned synthetic part of the structure of the species, recognition of the substance, receptor substance of the activation of the substance, bioactivity analysis of the line, unique activity of the see out. I am using PGN フラグメント・ライブラリbuild について, リンカー introduction method to build にsuccessし, game Isolated アミノbased を holding つリンカーをい, カルボン acid-bound type のプレートをいたアレイ化にした.また, make the したアレイを Use い, the known のタンパクquality-PGN のbonding strength をreproduce the したresult るとともに, the number The analysis of the nature of the net and the success of the net, the interaction of the new rules and the information of the net, the success of the net.