二本鎖ＲＮＡ結合タンパク質ＴＲＢＰの遺伝子サイレンシングにおける機能

双链RNA结合蛋白TRBP在基因沉默中的作用

• 批准号: 11J08395
• 负责人: 高橋 朋子
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11J08395/
• 关键词: RNA interference; 二本鎖RNA結合タンパク質

The trans-activation response (TAR)-RNA binding protein (TRBP)は、ヒト免疫不全ウイルス(human immunodeficiency virus : HIV-1)の5'LTRにあるTARと呼ばれるステムループ型の二本鎖RNA領域に結合するタンパク質として同定された、二本鎖RNA結合タンパク質である。ヒトのTRBPは3つの二本鎖RNA結合ドメイン(double-stranded RNA binding domain : dsRBD)からなる。当研究室ではRNAi経路におけるsiRNAとタンパク質との相互作用を調べるために、siRNAを両末端から一塩基ずつ体系的にDNAに置換してRNAi活性を測定することで、siRNAガイド鎖の5'側1-8塩基目と、それと対合するパッセンジャー鎖の塩基をRNAi効果が減少することなく、DNAに置換することが出来ることを明らかにしている。ガイド鎖の5'側2-8塩基目はシードと呼ばれる領域で、ターゲットmRNAと塩基配列相補的に認識、対合する領域であるために、この領域はRNAi効果が減少することなく、DNAに置換することが出来ると考えられる。一方、シード以外の領域(非シード領域)はRNAi効果が減少することなくDNAに置換することが出来ないが、それは非シード領域がRNAであることが必須となる機能に関わる領域であると考えられた。そのような重要な機能として、二本鎖RNA結合タンパク質との相互作用が考えられた。本研究ではこの非シード領域とAgoやTRBPなどのRISCタンパク質との相互作用について検討した結果について考察した結果、この非シード領域は更に4つの領域(T, C, B, A)に分類できることを明らかにした。

The trans-activation response (TAR)-RNA binding protein (TRBP) ウ, ヒト immunodeficiency ウ ス(human immunodeficiency virus:) HIV - 1) の 5 'LTR に あ る TAR と shout ば れ る ス テ ム ル ー プ に の 2 lock RNA field combined with す る タ ン パ ク qualitative と し て with fixed さ れ た, 2 lock rna-binding タ ン パ ク qualitative で あ る. Youdaoplaceholder0 <s:1> TRBP ドメ 3 <s:1> <s:1> double-stranded RNA binding domain: dsRBD ドメ らなる. When laboratory で は RNAi 経 road に お け る siRNA と タ ン パ ク qualitative と の interaction を adjustable べ る た め に, siRNA を struck end か ら a salt base ず つ system に DNA に replacement し て RNAi determination of active を す る こ と で, siRNA ガ イ ド lock の 5 'side 1-8 salt base mesh と, そ れ と us seaborne す る パ ッ セ ン ジ ャ ー lock の salt base を RNAi unseen fruit が reduce す る こ と な く, DNA に replacement す る こ と が out る こ と を Ming ら か に し て い る. ガ イ ド lock の 5 'side 2-8 salt base mesh は シ ー ド と shout ば れ る で, タ ー ゲ ッ ト mRNA と salt base with column fill に know, polices す る field で あ る た め に, こ の field は RNAi unseen fruit が reduce す る こ と な く, DNA に replacement す る こ と が out る と exam え ら れ る. Outside the party, シ ー ド の areas (not シ ー ド) は RNAi unseen fruit が reduce す る こ と な く DNA に replacement す る こ と が out な い が, そ れ は non シ ー ド field が RNA で あ る こ と が must と な る function に masato わ る field で あ る と exam え ら れ た. そ の よ う な important function of な と し て, 2 lock rna-binding タ ン パ ク qualitative と の interaction が exam え ら れ た. This study で は こ の non シ ー と ド field line や TRBP な ど の RISC タ ン パ ク qualitative と の interaction に つ い て beg し 検 た results に つ い て investigation し た results, こ の non シ ー は ド field more に 4 つ の areas (T, C, B, A) に classification で き る こ と を Ming ら か に し た.

项目成果

「第3章RNAi実験の準備と実践2.修飾基のついたsiRNAとRNAi効果とその選択」実験医学別冊目的別で選べる遺伝子導入実験プロトコール

《第三章RNAi实验的准备与实践2.带有修饰基团的siRNA、RNAi效应及其选择》实验医学特刊可根据目的选择的基因转移实验方案

• 作者: 西賢二;高橋朋子;長沢達矢;程久美子
• 通讯作者: 程久美子

Two cooparative regions on non-seed region of DNA/RNA chimeric siRNA are associated with TRBP binding for effective RNA activity.

DNA/RNA 嵌合 siRNA 非种子区域上的两个协同区域与 TRBP 结合相关，以实现有效的 RNA 活性。

• 发表时间: 2013
• 作者: Takahashi T;Zenno S;Nishi K;Ui-Tei K
• 通讯作者: Ui-Tei K

Identification of small interfering RNA binding domains of TAR RNA binding protein (TRBP) and their molecular implication in RNA interference

TAR RNA 结合蛋白 (TRBP) 的小干扰 RNA 结合域的鉴定及其在 RNA 干扰中的分子意义

• 发表时间: 2011
• 作者: Tomoko Takahashi;Kenji Nishi;Shuhei Zenno;Kumiko Ui-Tei
• 通讯作者: Kumiko Ui-Tei

Efficient RNAi by DNA/RNA chimeric siRNA is associated with TRBP binding to the siRNA non-seed region.

DNA/RNA 嵌合 siRNA 的有效 RNAi 与 TRBP 与 siRNA 非种子区域的结合有关。

• 发表时间: 2013
• 作者: Takahashi T;Zenno S;Nishi K;Ui-Tei K
• 通讯作者: Ui-Tei K

Distinguishable In Vitro siRNA-Binding Mechanisms of TRBP and PACT

TRBP 和 PACT 的体外 siRNA 结合机制可区分

• 发表时间: 2012
• 作者: Matsumoto;J.;Satoh S.;Kubota;T.;Kuraji;K.;Takahashi;G. H.;Kanamori;H.;Kamimera;H.;高野和良;Tomoko Takahashi
• 通讯作者: Tomoko Takahashi