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A omputational study on the intermolecular interaction between influenza virus hemagglutinin and a monoclonal antibody

A omputational study on the intermolecular interaction between influenza virus hemagglutinin and a monoclonal antibody
流感病毒血凝素与单克隆抗体分子间相互作用的计算研究
批准号：
23780305
负责人：
IGARASHI Manabu
金额：
$2.91万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2011 至 2012
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23780305/
关键词：
インフルエンザウイルス計算科学分子動力学抗体分子動力学シミュレーション分子間相互作用抗原変異フラグメント分子軌道法感染症生体生命情報学分子シミュレーション分子動力学計算

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Influenza A virus is a zoonotic pathogen that is transmitted from animals to humans. This virus has two surface glycoproteins, hemagglutinin (HA) and neuraminidase. The HA of human influenza virus is the major target of antibodies that neutralize viral infectivity. Some amino acid substitutions in the antigenic epitope on the HA could decrease the interaction between HA and antibodies, leading to generate the antigenic variants with a novel antigenic structure of HA. To understand how amino acid substitutions affect the changes of the HA antigenic structure, we computationally analyzed the three-dimensional structures of HA in complex with monoclonal antibody.
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Differential potential for envelope gycoprotein-mediated steric shielding of host cell surface proteins among filoviruses
丝状病毒之间包膜糖蛋白介导的宿主细胞表面蛋白的空间屏蔽的差异潜力
DOI： 10.1016/j.virol.2013.07.029
发表时间： 2013
期刊： Virology
影响因子： 3.7
作者： [Simulundu E, Nao N, Yabe J, Muto NA, Sithebe T, Sawa H, Manzoor R, Kajihara M, Muramatsu M, Ishii A, Ogawa H, Mweene AS, Takada A, Changula Katendi, Muramatsu M. et al., Noyori Osamu]
通讯作者： Noyori Osamu
Virus capsid coating of gold nanoparticles via cysteine-Au interactions and their effective cellular uptakes
通过半胱氨酸-Au相互作用对金纳米颗粒进行病毒衣壳涂层及其有效的细胞摄取
DOI： 10.1246/cl.2012.113
发表时间： 2012
期刊： Chemistry Letters
影响因子： 1.6
作者： [Keita Nagakawa, Keinchi Niikura, Tadaki Suzuki, Yasutaka Matsuo, Manabu Igarashi, Hirofumi Sawa, Kuniharu Ijiro]
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Single amino acid residue in the A2 domain of major histocompatibility complex class I is involved in the efficiency of equine herpesvirus-1 entry.
主要组织相容性复合体 I 类 A2 结构域中的单个氨基酸残基与马疱疹病毒 1 进入的效率有关。
DOI： 10.1074/jbc.m111.251751
发表时间： 2011
期刊： J Biol Chem.
影响因子： --
作者： [Sasaki M, Kim E, Igarashi M, Ito K, Hasebe R, Fukushi H, Sawa H, Kimura T]
通讯作者： Kimura T
An H5N1 highly pathogenic avian influenza virus that invaded Japan through waterfowl migration.
DOI： 10.14943/jjvr.59.2-3.89
发表时间： 2011-08
期刊： The Japanese journal of veterinary research
影响因子： --
作者： [M. Kajihara;Keita Matsuno;E. Simulundu;M. Muramatsu;O. Noyori;Rashid Manzoor;E. Nakayama;Manabu Igarashi;Daisuke Tomabechi;R. Yoshida;M. Okamatsu;Y. Sakoda;Kimihito Ito;H. Kida;A. Takada]
通讯作者： M. Kajihara;Keita Matsuno;E. Simulundu;M. Muramatsu;O. Noyori;Rashid Manzoor;E. Nakayama;Manabu Igarashi;Daisuke Tomabechi;R. Yoshida;M. Okamatsu;Y. Sakoda;Kimihito Ito;H. Kida;A. Takada
共 38 条
    Structural bioinformatics analysis of antigenic changes in influenza virus hemagglutinin
    • 批准号：
      21780272
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $3.0万
    • 财政年份：
      2009
    • 负责人：
      IGARASHI Manabu
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    A comprehensive computational analysis of antigenic properties of influenza virus hemagglutinin
    • 批准号：
      19780223
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $2.33万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      IGARASHI Manabu
    • 依托单位：
      Hokkaido University
    海外基金