Development of a novel integrated data mining that facilitates functional analysis in the post-genomic era -- Exploring novel gene coexpression --
Development of a novel integrated data mining that facilitates functional analysis in the post-genomic era -- Exploring novel gene coexpression --
开发一种新型集成数据挖掘，促进后基因组时代的功能分析——探索新型基因共表达——
批准号：
23700355
负责人：
HUKUSHIMA Atsushi
金额：
$1.83万
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2011 至 2012
中文摘要
翻译
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
We have investigated an integrated data mining that facilitates functional analysis to improve limits in gene coexpression approach for function prediction. We have developed the DiffCorr package, a simple method for identifying pattern changes between 2 experimental conditions in correlation networks, which builds on a commonly used association measure. Our method is suitable for the first step towards inferring causal relationships and detecting biomarker candidates.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Characterizing coexpression modules using graph clustering and differential coexpression approaches in Solanum lycopersicum
使用图聚类和差异共表达方法表征番茄中的共表达模块
使用图聚类和差异共表达方法表征番茄中的共表达模块
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[福島 敦史, 西澤 具子, 早雲 まり子, 彦坂 晶子, 斉藤 和季, 後藤 英司, 草野 都]
通讯作者：
草野 都
独立成分分析によるアントシアニン修飾関連配糖化酵素遺伝子の機能同定
独立成分分析法鉴定花青素修饰相关糖基转移酶基因的功能
独立成分分析法鉴定花青素修饰相关糖基转移酶基因的功能
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[榊原 圭子, 福島 敦史, 中林 亮, 花田 耕介, 松田 史生, 菅原 聡子, 井上 恵理, 黒森 崇, 伊藤 卓也, 篠崎 一雄, Wangwattana Bunyapa, 山崎 真巳, 斉藤 和季]
通讯作者：
斉藤 和季
DOI：
10.1104/pp.111.188367
发表时间：
2012-04-01
期刊：
PLANT PHYSIOLOGY
影响因子：
7.4
作者：
[Fukushima, Atsushi, Nishizawa, Tomoko, Kusano, Miyako]
通讯作者：
Kusano, Miyako
Transcriptome Independent Component Analysis Lead to the Identification of Two Glycosyltransferases Involved in Anthocyanin Modification in Arabidopsis thaliana
转录组独立成分分析鉴定出参与拟南芥花青素修饰的两种糖基转移酶
转录组独立成分分析鉴定出参与拟南芥花青素修饰的两种糖基转移酶
DOI：
--
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Keiko Sakakibara, Atsushi Fukushima, Ryo Nakabayashi, Kousuke Hanada, Fumio Matsuda, Satoko Sugawara, Eri Inoue, Takashi Kuromori, Takuya Ito, Kazuo Shinozaki, Bunyapa Wangwattana, Mami Yamazaki, Kazuki Saito]
通讯作者：
Kazuki Saito
Characterizing coexpression modules using graph clustering and differential correlation approaches in Solanum lycopersicum
使用图聚类和微分相关方法表征番茄中的共表达模块
使用图聚类和微分相关方法表征番茄中的共表达模块
DOI：
--
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Atsushi Fukushima, Tomoko Nishizawa, Mariko Hayakumo, Shoko Hikosaka, Kazuki Saito, Eiji Goto, Miyako Kusano]
通讯作者：
Miyako Kusano
共 14 条
海外基金