患者死後脳の空間的発現解析とマウスモデルの融合アプローチによる精神疾患病態解明

通过对死后患者大脑和小鼠模型进行空间表达分析的融合方法阐明精神疾病的病理学

• 批准号: 22K15203
• 负责人: 吉永 怜史
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Jikei University School of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15203/
• 关键词: 統合失調症; 死後脳; 空間トランスクリプトミクス; 単一細胞核RNAシークエンス; 組織構築; トランスクリプトーム解析; 動物モデル

福島県立医大ブレインバンクから供与された統合失調症患者脳と対照脳(新鮮凍結サンプル)において、単一細胞核解析(single nucleus RNA sequencingについては患者脳と対照群2例ずつ、ATAC-seq + single nucleus RNA sequencing 4例ずつ)と空間トランスクリプトミクス手法であるVisium (6例ずつ)の解析を行った。このうち、Visiumでは、single nucleus RNA sequencingとの統合的解析を行い、4例ずつで高い品質の結果が得られている。脳を構成する多様な細胞やその組織学を正確に検出できた。この解析から、統合失調症でとりわけ変化している細胞群を同定した。こうした細胞群で有意に発現変動している遺伝子や、その生物学的意義について、重層的な解析を進めている。こうした空間的トランスクリプトミクスの所見は、免疫組織化学とRNA蛍光in situ hybridizationを用いて組織学的にその妥当性の検証を開始しており、これまでに行った検証では実際に所見が支持されたほか、その形態学的解析から新しい視点が得られており、さらにサンプル数を増やして検証を進めたい。また、プレリミナリな取り組みとして、この中で興味深いと考えられた1遺伝子について、ゲノム編集技術を用いてノックアウトマウスを作製した。いっぽう、これまでにブレインバンクから供与されたホルマリン固定パラフィンサンプル3例ずつについて、空間トランスクリプトミクス手法であるGeoMx Human Whole Transcriptome Atlasによるニューロンの発現解析を行い、その結果の検討を進めている。

Fuli Medical University was responsible for the diagnosis and treatment of patients with systemic dysphagia. The results were as follows: 1. Nuclear analysis (2 cases of single nucleus RNA sequencing patients, 4 cases of ATAC-seq + single nucleus RNA sequencing) and 6 cases of Visium (6 cases). The results of the analysis of the combination of Visium, Visium and single nucleus RNA sequencing tests, and the results of 4 cases of high quality tests were satisfactory. The results show that the histology of the cells is correct. The cell population is the same as that of the patients with dysfunctional aphasia. The population of human beings is interested in realizing the meaning of biology, the meaning of biology, and the analysis of heavy drugs. The equipment in the space has been tested in the laboratory, the RNA in Immunohistochemistry has been used in the laboratory, and the in situ hybridization has been used in the chemistry of pharmaceuticals. In the beginning of the test, the computer has been used to support the analysis of the computer in the international market, and the analysis of the morphology has been improved. In order to improve the quality of the system, the information system, the information system, the information There are three cases in which there are two types of equipment, namely, GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas and space, and the results show that the results are satisfactory.

项目成果

空間トランスクリプトームと精神疾患研究

空间转录组和精神疾病研究

• 发表时间: 2023
• 期刊: 臨床精神医学
• 作者: 吉永怜史;久保健一郎
• 通讯作者: 久保健一郎

空間トランスクリプトームで解明する統合失調症における分子変化(Unraveling the molecular signatures of schizophrenia with spatial transcriptomics)

通过空间转录组学揭示精神分裂症的分子特征

• 发表时间: 2023
• 作者: Satoshi Yoshinaga;Julio Leon;Mizuki Hino;Yoshinari Ando;Moody Jonathan;Atsuko Nagaoka;Ayako Kitazawa;Kanehiro Hayashi;Kazunori Nakajima;Chung Chau Hon;Yasuto Kunii;Jay Shin;Ken-ichiro Kubo
• 通讯作者: Ken-ichiro Kubo