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Comprehensive virus detection by high-performance homology search and deep sequencing

Comprehensive virus detection by high-performance homology search and deep sequencing
通过高性能同源搜索和深度测序进行全面病毒检测
批准号：
24580430
负责人：
ENDOH Daiji
金额：
$3.49万
依托单位：
Rakuno Gakuen University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2012
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2012-04-01 至 2015-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24580430/
关键词：
次世代シーケンサー縮重プライマーバイオインフォマティクス網羅的ウイルス検出網羅的細菌検出高速相同性検出プライマーの自動設計糞便微生物解析縮重塩基プライマー次世代シーケンスプライマー設計プログラムグリーディーアルゴリズム高速塩基配列整列高速塩基配列相同性検索糞便DNA高速相同性検索

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新規遺伝子型トリボルナウイルス（ABV-BF）の解析
新基因型禽博纳病毒（ABV-BF）分析
DOI： --
发表时间： 2014
期刊：
影响因子： --
作者： [佐々 悠木子, 堀江 真行, 鈴木 研太, 加藤 真樹, 香川 紘子, 鈴木 和彦, 渋谷 淳, Chanathip Thammakarn, 竹原 一明, 古谷 哲也, 本田 知之, 朝長 啓造, 岡ノ谷 一夫, 水谷 哲也]
通讯作者： 水谷 哲也
G 15P［14］遺伝子型A群ロタウイルス（RVA）による搾乳牛の下痢症
G 15P [14] A 基因型轮状病毒 (RVA) 引起的奶牛腹泻
DOI： --
发表时间： 2014
期刊：
影响因子： --
作者： [増田恒幸, 山里比呂志, 水谷 哲也, 長井 誠, 片山 和彦]
通讯作者： 片山 和彦
Identification of novel bovine group A rotavirus G15P[14] strain from epizootic diarrhea of adult cows by de novo sequencing using a next-generation sequencer.
DOI： 10.1016/j.vetmic.2014.03.009
发表时间： 2014-06-25
期刊： Veterinary microbiology
影响因子： 3.3
作者： [Masuda T, Nagai M, Yamasato H, Tsuchiaka S, Okazaki S, Katayama Y, Oba M, Nishiura N, Sassa Y, Omatsu T, Furuya T, Koyama S, Shirai J, Taniguchi K, Fujii Y, Todaka R, Katayama K, Mizutani T]
通讯作者： Mizutani T
EPIC-PCRによる北海道のネズミ類の種判別法の開発
开发利用 EPIC-PCR 鉴定北海道啮齿类动物种类的方法
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： [西村直人, 上春浩貴, 西 原大翔, 樋口雅司, 吉田彩舟, 加藤たか子、加藤幸雄., 高橋昌志, 小山内佑太，遠藤大二，浅川満彦，長雄一，藤井啓，大沼学]
通讯作者： 小山内佑太，遠藤大二，浅川満彦，長雄一，藤井啓，大沼学
Construction of microbiologies in wild-life animals or its parasites using genomic signature
  • 批准号：
    20380163
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.65万
  • 财政年份：
    2008
  • 负责人：
    ENDOH Daiji
  • 依托单位：
    Rakuno Gakuen University
Identification of pathogenic genes in very virulent herpesviruses by analysis on single-nucleotide polymorphism.
  • 批准号：
    12660289
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $1.41万
  • 财政年份：
    2000
  • 负责人：
    ENDOH Daiji
  • 依托单位：
    Rakuno Gakuen University
In situ analysis of latency-associated transcripts as an indicator of latent infection of Marek's disease virus.
  • 批准号：
    08660354
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $1.54万
  • 财政年份：
    1996
  • 负责人：
    ENDOH Daiji
  • 依托单位：
    HOKKAIDO UNIVERSITY