Characterization of novel regulatory mechanism for the catabolic genes of aromatic compound degradation

芳香族化合物降解分解代谢基因新调控机制的表征

• 批准号: 24780068
• 负责人: KASAI DAISUKE
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Nagaoka University of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24780068/
• 关键词: ビフェニル代謝系; 二成分制御系; IclR型転写制御因子; 2,6-ジヒドロキシ安息香酸; ビフェニル

In order to identify the regulatory mechanism for the transcription of biphenyl (BP) catabolic pathway genes in Rhodococcus jostii RHA1, an IclR-type transcriptional regulator gene, tsdR, whose transcription is controlled by two-component regulatory system of BP catabolism, was characterized. The results of the transcriptome analysis of tsdR deletion mutant grown with or without BP suggesting that the TsdR-regulated genes are involved in the BP catabolism. Electrophoretic mobility shift assays using purified TsdR and the promoter regions of 2,6-dihydroxybenzaote (26DHB) catabolic genes containing tsdB and tsdT revealed that the TsdR binds to the tsd promoter regions and the bindings are inhibited by the addition of 26DHB. These results indicate that TsdR acts as a repressor for the transcription of tsd genes and 26DHB interacts with TsdR as an effector molecule.

为了明确联苯（BP）分解代谢途径基因转录的调控机制，对一个IclR型转录调控基因tsdR进行了鉴定，该基因的转录受BP分解代谢双组分调控系统的调控。对在BP存在或不存在下生长的tsdR缺失突变体的转录组分析的结果表明，TsdR调节的基因参与BP催化。使用纯化的TsdR和含有tsdB和tsdT的2，6-二羟基苯甲酸酯（26 DHB）分解代谢基因的启动子区的电泳迁移率变动分析显示，TsdR结合到tsd启动子区，并且该结合被添加26 DHB抑制。这些结果表明，TsdR作为一个阻遏物的tsd基因的转录和26 DHB与TsdR相互作用的效应分子。

项目成果

Rhodococcus jostii RHA1株のγ-レゾルシン酸代謝酵素遺伝子群の転写制御機構の解明

阐明红球菌 RHA1 菌株 γ-间苯二甲酸代谢酶基因的转录控制机制

• 发表时间: 2013
• 作者: 吉川翔太;笠井大輔;荒木直人;政井英司;福田雅夫
• 通讯作者: 福田雅夫

Rhodococcus jostii RHA1株におけるスチレン分解機構の解明

阐明红球菌 jostii RHA1 菌株中苯乙烯的分解机制

• 发表时间: 2012
• 作者: 古澤裕樹;星あゆみ;田中良典;宮澤大輔;下平潤;笠井大輔;政井英司;福田雅夫
• 通讯作者: 福田雅夫

γ-Resorcylate catabolic enzyme system in Rhodococcus jostii RHA1

红球菌 RHA1 中的 γ-间苯二酚酸分解代谢酶系统

• 发表时间: 2012
• 作者: 笠井大輔;本井広太;荒木直人;政井英司;福田雅夫
• 通讯作者: 福田雅夫

Rhodococcus jostii RHA1株の硝酸と亜硝酸の利用システムの解明

红球菌 jostii RHA1 菌株硝酸盐和亚硝酸盐利用系统的阐明

• 发表时间: 2013
• 作者: 飯野藤樹;王勇;宮内啓介;笠井大輔;政井英司;藤井毅;小川直人;福田雅夫
• 通讯作者: 福田雅夫

Rhodococcus jostii RHA1の二成分制御系BphSTによる転写誘導機構の解明

双组分调控系统BphST阐明红球菌jostii RHA1的转录诱导机制

• 发表时间: 2012
• 作者: 下平潤;宮沢雄太;岸田康平;笠井大輔;宮内啓介;政井英司;福田雅夫
• 通讯作者: 福田雅夫