Structure determination and Characterization of proline-specific aminopeptidases

脯氨酸特异性氨肽酶的结构测定和表征

• 批准号: 24790057
• 负责人: NAKANO Hiroaki
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Hyogo University of Health Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24790057/
• 关键词: X線結晶解析; X線溶液散乱; 宇宙実験; タンパク質; コラーゲン; 基質認識; 地球環境; CD

Proline-specific aminopeptidases are critical to the degradation of proline-rich peptides and proteins, such as collagen and its denatured form, gelatin. Collagens are the largest components in animal tissues and the most major hard-to-degrade proteins because of their unique fibrils composed of triple helical wound polypeptides. In this study, we crystallized three of the recombinant enzymes (Pz-A, Pz-B, and AM-1), and performed its preliminary X-ray crystallographic analysis. We have determined the entire structure of the these aminopeptidases, found a very unique apical domain sharing the interface with a domain containing a main active site and described about the characteristic structure and mechanism for the substrate recognition for proly peptides.

脯氨酸特异性氨肽酶对富含脯氨酸的肽和蛋白质（如胶原及其变性形式明胶）的降解至关重要。胶原蛋白是动物组织中最大的组分，也是最主要的难降解蛋白质，因为其独特的原纤维由三螺旋缠绕多肽组成。在这项研究中，我们结晶三个重组酶（Pz-A，Pz-B和AM-1），并进行了初步的X射线晶体学分析。我们确定了这些氨肽酶的全部结构，发现了一个非常独特的顶端结构域，该结构域与一个含有主要活性位点的结构域共享界面，并描述了其特征结构和对脯氨酸肽的底物识别机制。

项目成果

既存プロリダーゼとは異なるGly-Pro 分解性システインペプチダーゼの生化学的解析と結晶化

Gly-Pro降解半胱氨酸肽酶的生化分析和结晶，与现有的脯氨酸酶不同

• 发表时间: 2014
• 作者: 河野 良輔;坂本 琢馬;中野 博明;渡部 邦彦
• 通讯作者: 渡部 邦彦

タンパク質結晶の最前線

蛋白质晶体的前沿

• 发表时间: 2013
• 作者: A. Ando;T. Takeda;H. Kondo;K. Ishikawa;M. Sekine T. Ohta;M. Ito;M. Hiramatsu;H. Kano;M. Hori;西澤 典彦，松村 浩由
• 通讯作者: 西澤 典彦，松村 浩由

Study of a peptidase-associated domain of an aminopeptidase from thermophilic Aneurinibacillus sp. AM-1

嗜热动脉神经杆菌属氨肽酶肽酶相关结构域的研究。

• 发表时间: 2013
• 作者: 田川龍治;中野博明;渡部邦彦
• 通讯作者: 渡部邦彦