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Genome analysis of a unique strain of Vibrio cholerae O1 carrying the theird replicon
携带 therd 复制子的霍乱弧菌 O1 独特菌株的基因组分析
基本信息
- 批准号：24790414
- 负责人：
- 金额：$ 2.83万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份：2012
- 资助国家：日本
- 起止时间：2012-04-01 至 2014-03-31
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
In this study, we found three isolates TSY216, TSY241, and TSY421, of Vibrio cholerae O1 carrying a 0.9 Mb replicon (Ch3) in addition to the two circular chromosomes, 1 (Ch1; 3.0 Mb) and 2 (Ch2; 1.0 Mb). The genome of TSY216 carrying the Ch3 was compared with that of epidemic V. cholerae O1. The chromosomes 1 and 2 were very similar among TSY216 and other epidemic strains. However, the Ch3 did not share any conserved region with Ch1 and Ch2. Ch3 was found to encode 1,031 ORFs and 66 genes encoding tRNAs for 20 amino acids. The origin and function of Ch3 remain unidentifiable. The acquisition of a large-scale gene set of the third replicon may provide an opportunity to result in a new emerging form of V. cholerae O1.
在这项研究中，我们发现三个霍乱弧菌O 1分离株TSY 216，TSY 241和TSY 421除了携带两个环状染色体1（Ch 1; 3.0 Mb）和2（Ch 2; 1.0 Mb）外，还携带一个0.9 Mb的复制子（Ch 3）。将携带Ch 3的TSY 216的基因组与流行性霍乱弧菌O 1的基因组进行比较。TSY 216与其他流行株的1号和2号染色体非常相似。而Ch 3与Ch 1、Ch 2没有任何共同的保守区。Ch 3编码1,031个ORF和66个编码20个氨基酸的tRNA的基因。Ch 3的起源和功能仍然无法确定。获得第三复制子的大规模基因集可能提供产生新出现形式的霍乱弧菌O 1的机会。
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Roobthaisong A, Chantaroj S, Hamada S, Emergence of Vibrio cholerae O1 carrying a gigantic replicon in Thailand
Roobthaisong A、Chantaroj S、Hamada S，泰国出现携带巨大复制子的霍乱弧菌 O1
- DOI：
- 发表时间：2014
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Okada K;Natakuathung W;Na-Ubol M
- 通讯作者：Na-Ubol M
タイにおけるVibrio choleraeの疫学 : 分子生物学的-遺伝学的解析
泰国霍乱弧菌的流行病学：分子生物遗传分析
- DOI：
- 发表时间：2014
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Okada K;Roobthaisong A;Swaddiwudhipong W;Hamada S;Chantaroj S;岡田和久
- 通讯作者：岡田和久
Emergence of Vibrio cholerae O1 carrying a gigantic replicon in Thailand
泰国出现携带巨大复制子的霍乱弧菌 O1
- DOI：
- 发表时间：2014
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Okada K.;Natakuathung W.;Na-Ubol M.;Roobthaisong A.;Chantaroj S.;Hamada S.
- 通讯作者：Hamada S.
タイにおけるVibrio choleraeの疫学：分子生物学的-遺伝学的解析
泰国霍乱弧菌的流行病学：分子生物遗传分析
- DOI：
- 发表时间：2014
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Okada K;Natakuathung W;Na-Ubol M;岡田 和久
- 通讯作者：岡田 和久
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