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Fast RNA-RNA interaction prediction considering higher order structure

Fast RNA-RNA interaction prediction considering higher order structure
考虑高阶结构的快速 RNA-RNA 相互作用预测
批准号：
24700296
负责人：
KATO Yuki
金额：
$2.83万
依托单位：
Kyoto University (2014)Nara Institute of Science and Technology (2012-2013)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2012
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2012-04-01 至 2015-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24700296/
关键词：
RNA間相互作用アクセシビリティ数理計画法無細胞系実験国際情報交換デンマークRNA２次構造RNA構造アラインメント整数計画法

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Rtips: fast and accurate tools for RNA 2D structure prediction using integer programming.
DOI： 10.1093/nar/gks412
发表时间： 2012-07
期刊： Nucleic acids research
影响因子： 14.9
作者： [Kato Y, Sato K, Asai K, Akutsu T]
通讯作者： Akutsu T
Evaluating effectiveness of accessibility to infer RNA-RNA interactions
评估推断 RNA-RNA 相互作用的可及性的有效性
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [Yuki Kato, Tomoya Mori, Kengo Sato, Shingo Maegawa, Hiroshi Hosokawa and Tatsuya Akutsu]
通讯作者： Hiroshi Hosokawa and Tatsuya Akutsu
RNA structural alignment using dual decomposition
使用对偶分解进行 RNA 结构比对
DOI： --
发表时间： 2012
期刊：
影响因子： --
作者： [Kengo Sato, Yuki Kato, Tatsuya Akutsu, Kiyoshi Asai and Yasubumi Sakakibara, Chikara Furusawa, Yuki Kato]
通讯作者： Yuki Kato
Using hidden Markov models to investigate G-quadruplex motifs in genomic sequences.
DOI： 10.1186/1471-2164-15-s9-s15
发表时间： 2014
期刊： BMC genomics
影响因子： 4.4
作者： [Yano M, Kato Y]
通讯作者： Kato Y
共 6 条
    Study on the revival of shrine architecture in the early modern period
    • 批准号：
      17K14795
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $1.75万
    • 财政年份：
      2017
    • 负责人：
      KATO Yuki
    • 依托单位：
      Kyushu University
    The effects of amino acid intakes on prevention of sarcopenia -A longitudinal study based on individual differences in endocrine level and genetic factor-
    • 批准号：
      15K08763
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.16万
    • 财政年份：
      2015
    • 负责人：
      KATO Yuki
    • 依托单位：
      Aichi Shukutoku University
    Fast genome-wide detection of RNA genes using coarse-grained structural information
    Study of the safe and interesting museum display for all visitors focusing small children and aged people
    海外基金