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Ultra-fast RNA structural alignments with pseudoknots

Ultra-fast RNA structural alignments with pseudoknots
利用假结进行超快速 RNA 结构比对
批准号：
25330348
负责人：
Sato Kengo
金额：
$3.08万
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2013
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2013-04-01 至 2017-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25330348/
关键词：
RNA二次構造構造アラインメント期待精度最大化双対分解整数計画法マルチプルアラインメントバイオインフォマティクス

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Accurate prediction of RNA-RNA interactions from sequence data incorporating interaction site accessibility
根据结合相互作用位点可访问性的序列数据准确预测 RNA-RNA 相互作用
DOI： --
发表时间： 2016
期刊：
影响因子： --
作者： [Yuki Kato, Tomoya Mori, Kengo Sato, Shingo Maegawa, Hiroshi Hosokawa and Tatsuya Akutsu]
通讯作者： Hiroshi Hosokawa and Tatsuya Akutsu
機械学習を用いたタンパク質とRNAのコンタクト予測
使用机器学习预测蛋白质-RNA 接触
DOI： --
发表时间： 2014
期刊：
影响因子： --
作者： [前田佳孝, 鈴木聡, 他, 佐藤健吾，柏木駿也，榊原康文]
通讯作者： 佐藤健吾，柏木駿也，榊原康文
Prediction of Gene Structures from RNA-seq Data Using Dual Decomposition
使用对偶分解从 RNA-seq 数据预测基因结构
DOI： 10.2197/ipsjtbio.9.1
发表时间： 2016
期刊： IPSJ Transactions on Bioinformatics
影响因子： --
作者： [Inatsuki, T, Sato, K., Sakakibara, Y.]
通讯作者： Y.
統計的検定結果に基づく高精度クラスタリングアルゴリズムの開発
基于统计测试结果的高精度聚类算法开发
DOI： --
发表时间： 2015
期刊：
影响因子： --
作者： [Kato, Y., Mori, T., Sato, K., Maegawa, S., Hosokawa, H., Akutsu, T., 青戸良賢，八谷剛史，奥村和弘， 長谷純崇，佐藤健吾，若林雄一，榊原康文]
通讯作者： 青戸良賢，八谷剛史，奥村和弘， 長谷純崇，佐藤健吾，若林雄一，榊原康文
共 10 条
    RNA secondary structure prediction using nanopore sequencers
    GenomeGAN: in silico genome design with generative adversarial networks
    • 批准号：
      19K22897
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额：
      $3.33万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      Sato Kengo
    • 依托单位：
      Keio University
    Investigation of new biomarker for atherosclerosis
    Improving the accuracy of RNA secondary structure prediction by machine learning based on next-generation sequencing data
    • 批准号：
      16K00404
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2016
    • 负责人：
      Sato Kengo
    • 依托单位：
      Keio University