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Development of a complex structure prediction method between proteins using binding free-energy as a scoring function

使用结合自由能作为评分函数开发蛋白质之间的复杂结构预测方法

基本信息

批准号：
25440070
负责人：
Kamiya Narutoshi
金额：
$ 3.33万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research (2015)Osaka University (2013-2014)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2013
资助国家：
日本
起止时间：
2013-04-01 至 2016-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

In-vitro and in-silico studies of ligand binding to the nuclear receptor PPARgamma using FRET and MD

使用 FRET 和 MD 进行配体与核受体 PPARgamma 结合的体外和计算机内研究

DOI：
发表时间：
2015
期刊：
影响因子：
0
作者：
N. Kamiya;G.-J. Bekker;T. Shiraki;H. Nakamura
通讯作者：
H. Nakamura

抗原抗体ドッキングのデコイセット評価法

抗原抗体对接的诱饵集评估方法

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
榛葉　教子;神谷　成敏;中村　春木
通讯作者：
中村　春木

A comparison of 3D conformations of endothelin-1 analogs to find the pharmacophore model required for endothelin ligand

比较内皮素 1 类似物的 3D 构象，以找到内皮素配体所需的药效团模型

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
B. Ma;T. Kawabata;N. Kamiya;H. Nakamura
通讯作者：
H. Nakamura

Molecular dynamics simulations of dynein motor domain in explicit water

明确水中动力蛋白运动域的分子动力学模拟

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
N. Kamiya;T. Mashimo;Y. Takano;T. Kon;G. Kurisu;H. Nakamura
通讯作者：
H. Nakamura

溶媒を陽に考慮した全原子分子動力学シミュレーションから得られたダイニンの弾性

从明确考虑溶剂的全原子分子动力学模拟中获得的动力蛋白的弹性

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
N. Kamiya;T. Mashimo;Y. Takano;T. Kon;G. Kurisu;H. Nakamura
通讯作者：
H. Nakamura

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Kamiya Narutoshi其他文献

Dynamical Methods to Study Interaction in Proteins Facilitating Molecular Understanding of Cancer

研究蛋白质相互作用的动力学方法促进癌症的分子理解

DOI：
10.1007/978-981-15-4501-6_149-1
发表时间：
2021
期刊：
Handbook of Oxidative Stress in Cancer: Mechanistic Aspects
影响因子：
0
作者：
Dasgupta Bhaskar;Bekker Gert-Jan;Kamiya Narutoshi
通讯作者：
Kamiya Narutoshi

Cutinases from thermophilic bacteria (actinomycetes): From identification to functional and structural characterization

嗜热细菌（放线菌）的角质酶：从鉴定到功能和结构表征

DOI：
10.1016/bs.mie.2020.12.031
发表时间：
2021
期刊：
Methods in Enzymology
影响因子：
0
作者：
Oda Masayuki;Numoto Nobutaka;Bekker Gert-Jan;Kamiya Narutoshi;Kawai Fusako
通讯作者：
Kawai Fusako

癌ワクチンペプチドと免疫関連タンパク質の結合自由エネルギー計算による親和性予測

通过结合自由能计算预测癌症疫苗肽与免疫相关蛋白之间的亲和力

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Emori Miho;Numoto Nobutaka;Senga Akane;Bekker Gert‐Jan;Kamiya Narutoshi;Kobayashi Yuma;Ito Nobutoshi;Kawai Fusako;Oda Masayuki;神谷　成敏
通讯作者：
神谷　成敏

癌ワクチンの個別医療化に向けたMHC受容体と癌ワクチンペプチドの結合自由エネルギー計算による親和性予測

通过结合自由能计算预测MHC受体与癌症疫苗肽之间的亲和力以用于个性化癌症疫苗

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Emori Miho;Numoto Nobutaka;Senga Akane;Bekker Gert‐Jan;Kamiya Narutoshi;Kobayashi Yuma;Ito Nobutoshi;Kawai Fusako;Oda Masayuki;神谷　成敏;神谷　成敏
通讯作者：
神谷　成敏

ARSによる周期推定の高解像度化に関する検討

利用ARS提高周期估计分辨率的研究

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Higo Junichi;Kusaka Ayumi;Kasahara Kota;Kamiya Narutoshi;Hayato Itaya;Qilin Xie;Takahashi Takuya;Fukuda Ikuo;Mori Kentaro;Hata Yutaka;Fukunishi Yoshifumi;安江　汰騎，神谷幸宏
通讯作者：
安江　汰騎，神谷幸宏