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琵琶湖深水層で優占する細菌系統ＣＬ５００－１１の生態解明

琵琶湖深水层优势菌株CL500-11生态学的阐明

基本信息

批准号：
15J00971
负责人：
岡嵜友輔
金额：
$ 1.79万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2015
资助国家：
日本
起止时间：
2015-04-24 至 2018-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年度までに実施した、全国10の大水深淡水湖の網羅的調査の成果をThe ISME journal誌に発表した。この研究では、これまでの琵琶湖における研究で見つかっていた深水層特異的な細菌系統が他の大水深淡水湖の深水層においても広く分布・優占することを明らかにし、有酸素深水層の生態系および物質循環が表水層とは異なる独自の細菌群集によって駆動されていることを示した。この結果は、有酸素深水層に焦点を当てたさらなる研究の必要性を明示しており、今後は各細菌系統の生理・生態学的な特性を解明し、有酸素深水層の生態系・物質循環プロセスにおけるその役割と重要性を明らかにすることが課題となる。そこで今年度は発展的な研究として琵琶湖微生物サンプルのメタゲノム・メタビローム解析を実施した。メタゲノム解析からは琵琶湖に生息する多数の細菌系統のMetagenome-assembled genomeが構築され、その生理・生態を紐解く情報が得られた。メタビローム解析では、これまでに180個以上の完全長ウイルスゲノム、さらに（完全長ではない）4000本以上のウイルスゲノム断片が得られ、その多くが未知のウイルス系統であったとともに、主要な細菌系統に感染するファージも特定された。これらの成果は、クロアチアで行われたSymposium on Aquatic Microbial Ecologyにて発表した。さらに湖沼の微生物生態学で著名な研究所であるスイス・チューリッヒ大学のLimnological Stationに2か月半滞在し、Lake Zurich, Lake Maggioreをはじめとする、複数のヨーロッパの大水深淡水湖にておいて比較環境ゲノム解析を実施するためのメタゲノムサンプルを収集した。

Last year, the results of the 10-year network of deep and fresh water lakes across the country were published in the The ISME journal report. The distribution of bacteria in deep water, deep water The results of the test, the focus of the deep-water cycle of acid, the need for the study of the environmental pollution test, the explanation of the characteristics of the physiology and physiology of each bacterial system in the future, and the identification of the biological properties of the acid-based deep-water microbiology. there is a clear understanding of the importance of in-service cutting. This year's exhibition focuses on the study of microbes in Lake Biwa. In Biwa Lake, most of the bacteria were tested by Metagenome-assembled genome, physiology and ecology. A total of more than 4000 full-length and full-length samples were analyzed, and the fragments of more than one hundred and eighty-thousand samples were obtained, the unknown samples were not known, and the main bacterial systems were infected with specific bacteria. "results", "results", "rows"Symposium on Aquatic Microbial Ecology"table". The famous research institute of microbiology and biology in lakes and marshes has been stranded in Limnological Station in February, Lake Zurich, Lake Maggiore in the first half of the year, and the number of complex figures in large water, deep freshwater lakes and freshwater lakes is much higher than that in the environment.