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系統群ごとの有機物利用特性を用いた細菌群集組成と機能の決定メカニズムの解明

利用每个系统发育群的有机物利用特征阐明决定细菌群落组成和功能的机制

基本信息

批准号：
15J01065
负责人：
藤永承平
金额：
$ 1.09万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2015
资助国家：
日本
起止时间：
2015-04-24 至 2017-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15J01065/
关键词：
細菌淡水生態系微生物湖沼生態系

项目摘要

野洲川から琵琶湖にかけの細菌群集の動態を次世代シークエンサーを用いて解析した。細菌群集を粒子付着画分（> 5.0 マイクロメートル）、及び浮遊画分（0.2 - 5.0 マイクロメートル）に分けて解析した。細菌群集の多様性は粒子付着画分の方が浮遊画分に比べて高かった。河川から湖にかけて共通していた操作的分類群（OTU）の割合は粒子付着画分では平均14%、浮遊画分では平均18%であった。細菌群集の組成は浮遊画分と粒子付着画分では有意に異なった。浮遊画分においては河川と湖では細菌群集の組成は異なった。細菌群集の組成に影響を与える要因を分析すると、溶存態の窒素、リンが群集の非類似度と有意な相関を示した。次に、河川や湖に特異的な細菌が存在するのかを検証するために各OTUを検出された比率と頻度を基準に分類した。浮遊画分で検出されたOTUの内、河川でも湖でも優占していたのはBetaproteobacteria綱に属するOTUであった。そして、河川で比較的優占することの多い細菌にはBetaproteobacteria綱、及びBacteroidetes門に属するOTUが多く、湖で比較的優占することの多い細菌にはActinobacteria門、及びAlphaproteobacteria綱に属するOTUが多かった。平成27年度に採集した摩周湖の細菌群集について解析した。細菌の群集組成は水深により有意に異なり、群集の非類似度は水温躍層の方が深水層に比べて高かった。平成27年度に採集した全国15ヶ所の湖についても細菌の群集組成の分析は完了しており、今回調査した湖では比較的共通する細菌が優占することが明らかとなった。

Sichuan wild state から pipa lake にかけの bacterial colonization の dynamic を nextgen シークエンサーを with いて parsing した. Bacterial colonization を particle pay the picture points (> 5.0 マイクロメートル), and び planktonic draw points (0.2 5.0 マイクロメートル) に points けて parsing した. Bacterial clusters have <s:1> particle multiplicity が particle division <s:1> squared が floating division に is higher than べてった. Common rivers から lake にかけてしていた operation of taxa (OTU) の cut or pay the picture points では particles は an average of 14%, floating points では average 18% であった. Bacterial colonies are composed of <s:1> floating fractions と particles carrying fractions でで intentional に impurities なった. Plankton are divided into にお, にお, て, て rivers, と, lakes, で, and bacterial colonies. The composition of these colonies is different なった. Bacterial colonization of のに influence を and える analysis by をすると, soluble deposit の smothering element, リンがの the similar degree of cluster と intentionally な phase masato を shown した. Time に lake, rivers やに specific な bacterial がするのかを検 card するために each OTU を検 out された ratio と frequency を benchmark に classification した. Plankton draw points で検 out された OTU ので, streams and rivers in lake もでも accounted for optimal していたのは Betaproteobacteria class に genus する OTU であった. そして, rivers です of optimal ることのい more bacteria には Betaproteobacteria outline and び Bacteroidetes door に genus する OTU がく more, comparison of lake です of optimal ることのい more bacteria には Actinobacteria doors, and び Alphaproteobac Class teria に genus するOTUが mostly ったった. In the year Heisei 27, に collected <s:1> た bacterial colonies from Lake mashu, にてて analysis of <s:1> た. The bacteria are clustered to form a <s:1> water depth によにに intentional に different な, clustered <s:1> dissimilar <s:1> thermocline <s:1> square が deep water layer に is higher than べてった. Pp.47-53 27 annual に acquisition した national 15 ヶの lake についても bacteria の cluster of finished の analysis はしており, today back to survey した lake では comparison of common すがる bacteria accounted for optimal することが Ming らかとなった.