エピジェネティック制御におけるヒストンバリアントH2A.Zアセチル化の機能解析
エピジェネティック制御におけるヒストンバリアントH2A.Zアセチル化の機能解析
批准号:
15J02041
负责人:
日下部 将之
金额:
$1.39万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31
中文摘要
クロマチン構造の変換には、通常のヒストンに代わってヌクレオソーム中に導入されるヒストンバリアントが重要な枠割を果たすことが知られている。ヒストンバリアントH2A.Zは酵母からヒトにまで進化的に高度に保存されたヒストンバリアントであり、生物学的に重要な機能を持つと考えられている。これまでの研究により、H2A.ZのN末端ヒストンテールはアセチル化修飾を受けることが報告されていたが、その機能は不明であった。本研究室ではこれまでに、遺伝子破壊細胞の樹立が可能な培養細胞ニワトリDT40細胞を用いることによって、H2A.Z遺伝子破壊(H2A.Z KO)細胞を樹立した。昨年度の研究によって、H2A.Z KO細胞に対して外来生H2A.Z遺伝子を安定発現させることで、H2A.Z KO細胞の表現型を相補することを利用した「遺伝学的機能相補系」を樹立し、H2A.Zへのアセチル化修飾は転写制御特異的に寄与することを示した。本年度はこの細胞生物学的解析を用いて、H2A.Zアセチル化修飾の転写制御への寄与をさらに詳細に解析した。具体的には、野生型H2A.Z (wtH2A.Z)、アセチル化修飾の起こらないH2A.Z (5KR-H2A.Z)を安定発現するH2A.Z KO細胞を樹立し、細胞外刺激によって転写が誘導されるEGR1遺伝子に着目して解析を行った。クロマチン免疫沈降解析によりEGR1遺伝子領域のアセチル化H2A.Zの存在量を比較したところ、細胞外刺激後にアセチル化H2A.Zの存在量が増加することが示された。重要なことに、EGR1遺伝子の転写誘導はwtH2A.Z発現細胞では観察されたが、5KR-H2A.Z発現細胞では観察されなかった。これらの結果より、H2A.Zアセチル化修飾は転写誘導において重要な機能を持つことが示唆された。
英文摘要
クロマチン構造の変換には、通常のヒストンに代わってヌクレオソーム中に導入されるヒストンバリアントが重要な枠割を果たすことが知られている。ヒストンバリアントH2A.Zは酵母からヒトにまで進化的に高度に保存されたヒストンバリアントであり、生物学的に重要な機能を持つと考えられている。これまでの研究により、H2A.ZのN末端ヒストンテールはアセチル化修飾を受けることが報告されていたが、その機能は不明であった。本研究室ではこれまでに、遺伝子破壊細胞の樹立が可能な培養細胞ニワトリDT40細胞を用いることによって、H2A.Z遺伝子破壊(H2A.Z KO)細胞を樹立した。昨年度の研究によって、H2A.Z KO細胞に対して外来生H2A.Z遺伝子を安定発現させることで、H2A.Z KO細胞の表現型を相補することを利用した「遺伝学的機能相補系」を樹立し、H2A.Zへのアセチル化修飾は転写制御特異的に寄与することを示した。本年度はこの細胞生物学的解析を用いて、H2A.Zアセチル化修飾の転写制御への寄与をさらに詳細に解析した。具体的には、野生型H2A.Z (wtH2A.Z)、アセチル化修飾の起こらないH2A.Z (5KR-H2A.Z)を安定発現するH2A.Z KO細胞を樹立し、細胞外刺激によって転写が誘導されるEGR1遺伝子に着目して解析を行った。クロマチン免疫沈降解析によりEGR1遺伝子領域のアセチル化H2A.Zの存在量を比較したところ、細胞外刺激後にアセチル化H2A.Zの存在量が増加することが示された。重要なことに、EGR1遺伝子の転写誘導はwtH2A.Z発現細胞では観察されたが、5KR-H2A.Z発現細胞では観察されなかった。これらの結果より、H2A.Zアセチル化修飾は転写誘導において重要な機能を持つことが示唆された。
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遺伝学的相補によるヒストンバリアントH2A.Zの機能解析
通过遗传互补对组蛋白变体 H2A.Z 进行功能分析
DOI:
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发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[日下部将之, 奥裕之, 堀越直樹, 堀哲也, 深川竜郎, 胡桃坂仁志, 原田昌彦]
通讯作者:
原田昌彦
遺伝学的相補を用いたヒストンバリアントH2A.Zおよび変異体の機能解析
使用遗传互补对组蛋白变体 H2A.Z 和突变体进行功能分析
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[日下部将之, 堀越直樹, 佐藤浩一, 松田涼, 奥裕之, 堀哲也, 深川竜郎, 木村宏, 胡桃坂仁志, 原田昌彦]
通讯作者:
原田昌彦
Functional analysis of the contribution of acetylation of H2A.Z to epigenetic regulations
H2A.Z 乙酰化对表观遗传调控贡献的功能分析
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masayuki Kusakabe, Ryo Matsuda, Hiroyuki Oku, Tetsuya Hori, Tatsuo Fukagawa, Hitoshi Kurumizaka, Masahiko Harata]
通讯作者:
Masahiko Harata
Evaluation of functional domains of histone variant H2A.Z by complementation analysis
通过互补分析评估组蛋白变体 H2A.Z 的功能域
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masayuki Kusakabe, Ryo Matsuda, Hiroyuki Oku, Tetsuya Hori, Tatsuo Fukagawa, Hitoshi Kurumizaka, Masahiko Harata]
通讯作者:
Masahiko Harata
ヒストンバリアントH2A.Zの分子進化学的保存性解析
组蛋白变体H2A.Z的分子进化保守性分析
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[日下部将之, 奥裕之, 高橋大介, 北川紗帆, 成宮巧, 堀越直樹, 立和名博昭, 胡桃坂仁志, 原田昌彦]
通讯作者:
原田昌彦
共 8 条
ヌクレオチド除去修復の損傷認識を促進する新規機構の解明
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批准号:21K17889
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2021
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负责人:日下部 将之
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依托单位:
海外基金