姉妹染色分体間接着因子コヒーシンによる遺伝子発現制御メカニズムの解明
姉妹染色分体間接着因子コヒーシンによる遺伝子発現制御メカニズムの解明
批准号:
15J10948
负责人:
秋山 和広
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31
中文摘要
前年度に引き続き、in vitro及びin vivoの2種類の実験系を利用・応用することで、姉妹染色分体間接着因子コヒーシンによる遺伝子発現制御メカニズムを解明することを目的として研究を継続した。まず、in vitroの実験系に関しては、前年度に引き続き、遺伝子発現制御を調べる手法として、1980年代から転写研究に利用されてきた「in vitro pre-initiation complex assembly assay」と「in vitro transcriptional activation assay」の確立と実験プロトコルの改善・検討を主として行った。その結果として、実験系の確立・実験結果の安定化が可能となった。また、これにより、コヒーシン及びコヒーシンローダーが複雑な遺伝子発現制御反応の中でも、特にPausingと呼ばれるRNAポリメラーゼⅡの転写一時停止反応~転写再活性化(転写伸長反応)の段階で転写反応に寄与していることが明らかとなった。また、in vivoの実験系に関して、転写伸長阻害剤を加えることで、遺伝子の転写開始点付近にコヒーシンローダーが蓄積することがChIP-seq法により確認された。また、阻害剤を除くと、その蓄積が解消されることも同時に明らかとなった。これにより、in vivoにおいてもin vitroの結果と同様に遺伝子の一時停止反応~転写伸長反応にコヒーシンローダーが寄与する可能性が示唆された。また、コヒーシンローダーが直接的に転写メディエーターや転写伸長複合体と相互作用する可能性を示唆するデータも得られた。以上により、コヒーシン及びコヒーシンローダーがRNAポリメラーゼⅡの転写一時停止反応~転写伸長反応の間で機能し、遺伝子の発現制御に寄与していることが以前よりも明確に示すことが可能になったと考えられる。
英文摘要
前年度に引き続き、in vitro及びin vivoの2種類の実験系を利用・応用することで、姉妹染色分体間接着因子コヒーシンによる遺伝子発現制御メカニズムを解明することを目的として研究を継続した。まず、in vitroの実験系に関しては、前年度に引き続き、遺伝子発現制御を調べる手法として、1980年代から転写研究に利用されてきた「in vitro pre-initiation complex assembly assay」と「in vitro transcriptional activation assay」の確立と実験プロトコルの改善・検討を主として行った。その結果として、実験系の確立・実験結果の安定化が可能となった。また、これにより、コヒーシン及びコヒーシンローダーが複雑な遺伝子発現制御反応の中でも、特にPausingと呼ばれるRNAポリメラーゼⅡの転写一時停止反応~転写再活性化(転写伸長反応)の段階で転写反応に寄与していることが明らかとなった。また、in vivoの実験系に関して、転写伸長阻害剤を加えることで、遺伝子の転写開始点付近にコヒーシンローダーが蓄積することがChIP-seq法により確認された。また、阻害剤を除くと、その蓄積が解消されることも同時に明らかとなった。これにより、in vivoにおいてもin vitroの結果と同様に遺伝子の一時停止反応~転写伸長反応にコヒーシンローダーが寄与する可能性が示唆された。また、コヒーシンローダーが直接的に転写メディエーターや転写伸長複合体と相互作用する可能性を示唆するデータも得られた。以上により、コヒーシン及びコヒーシンローダーがRNAポリメラーゼⅡの転写一時停止反応~転写伸長反応の間で機能し、遺伝子の発現制御に寄与していることが以前よりも明確に示すことが可能になったと考えられる。
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Mechanism of transcriptome abnormalies in Cornelia de Lange syndrome: Disturbance of transcriptional elongation
Cornelia de Lange综合征转录组异常的机制:转录延伸的干扰
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kazuhiro Akiyama, Masashige Bando, Katsuhiko Shirahige]
通讯作者:
Katsuhiko Shirahige
Transcriptional regulation by cohesin and its loader
粘连蛋白及其装载机的转录调节
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[出口貴美子, 久保健一郎, 仲嶋一範, 井上健, Koichi Kawakami, Katsuhiko Shirahige]
通讯作者:
Katsuhiko Shirahige
細胞工学
细胞工程
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[井本逸勢, 稲澤譲治]
通讯作者:
稲澤譲治
セミインビトロ系を用いたコヒーシン及びコヒーシンローダーによる転写制御メカニズムの解析
使用半体外系统分析粘连蛋白和粘连蛋白装载机的转录控制机制
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[秋山和広, 坂東 優篤, 白髭 克彦]
通讯作者:
白髭 克彦
DOI:
10.1016/j.cub.2015.05.017
发表时间:
2015-06-29
期刊:
CURRENT BIOLOGY
影响因子:
9.2
作者:
[Minamino, Masashi, Ishibashi, Mai, Shirahige, Katsuhiko]
通讯作者:
Shirahige, Katsuhiko
共 7 条
神経系発生過程における脱SUMO化酵素の機能解析
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批准号:24H02690
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
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资助金额:$0.29万
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财政年份:2024
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负责人:秋山 和広
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依托单位:
神経発生過程における脱SUMO化酵素の機能解析
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批准号:23H05245
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
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资助金额:$0.31万
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财政年份:2023
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负责人:秋山 和広
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依托单位:
海外基金