RNA-Funktionsmodule am Beispiel der Viroide: Pathogenität durch Produktion von siRNAs und Transkription durch Erkennung zellulärer Faktoren

病毒是一种急、慢性、无基因的RNA，在病毒复制和病毒症状的发生中具有自主性。类病毒-RNA韦尔登的功能可以通过稳定的结构或通过亚稳定的结构或通过酶解获得。Polymerase II在极化过程中的转录，包括在Zirkeln、systemischer和intrazellulärer Transport和Variation中的oligomeren介导的作用，以及在Nukleotidaustausche过程中症状的变化。首先，我们可以用一种高分子量的假设韦尔登，在病毒片段中加入“小干扰”RNA（siRNA）。通过生物信息学手段对这些病毒片段进行分析，并通过生物弹性转化实验对病毒复制进行验证。所有这些功能模块都解决了一般的特征值转换韦尔登问题：四环结构的启动，benachbarte碎片复制，G：C盒和其他的Wechselechtung与zellulären Faktoren。因此，需要将病毒分子作为自然激活RNA模块。

Viroide sind kurze, zirkuläre, nicht-kodogene RNAs, die autonom in der Wirtspflanze replizieren und Pflanzenvirus-ähnliche Symptome erzeugen. Die Funktionen der Viroid-RNA werden sowohl durch thermodynamisch stabile als auch durch metastabile Strukturen und deren Wechselwirkungen mit Wirtsfaktoren gewährleistet. Dazu gehören Transkription durch die Polymerase II in beiden Polaritäten, exakte Prozessierung der oligomeren Replikationsintermediären zu Zirkeln, systemischer und intrazellulärer Transport und Variation der Symptome durch wenige Nukleotidaustausche. Erst vor kurzem konnte eine tragfähige molekulare Hypothese aufgestellt werden, in der Viroidfragmente als "small interfering" RNAs (siRNAs) agieren. Im Vorhaben sollen diese Viroidfragmente analysiert werden, mit Voraussagen aus bioinformatischen Untersuchungen verglichen werden und ihre Wirkung getrennt von Viroidreplikation durch biolistische Transformation experimentell verifiziert werden. Als weiteres Funktionsmodul sollen die genauen Eigenschaften postulierter Transkriptionselemente untersucht werden: Tetraloop-Struktur der Startstelle, benachbarte Fragmentduplikation, G:C-Boxen und deren Wechselwirkung mit zellulären Faktoren. Mit den Ergebnissen sollten sich Viroide molekular als Akkumulation natürlicher RNA-Module vollständig beschreiben lassen.