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RNA-Funktionsmodule am Beispiel der Viroide: Pathogenität durch Produktion von siRNAs und Transkription durch Erkennung zellulärer Faktoren

以类病毒为例的 RNA 功能模块：通过产生 siRNA 产生致病性并通过识别细胞因子进行转录

基本信息

批准号：
5444397
负责人：
Professor Dr. Detlev Riesner
金额：
--
依托单位：
Institut für Physikalische Biologie
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2005
资助国家：
德国
起止时间：
2004-12-31 至 2007-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5444397?language=en
关键词：
RNA Funktionsmodule am Beispiel der

项目摘要

Viroide sind kurze, zirkuläre, nicht-kodogene RNAs, die autonom in der Wirtspflanze replizieren und Pflanzenvirus-ähnliche Symptome erzeugen. Die Funktionen der Viroid-RNA werden sowohl durch thermodynamisch stabile als auch durch metastabile Strukturen und deren Wechselwirkungen mit Wirtsfaktoren gewährleistet. Dazu gehören Transkription durch die Polymerase II in beiden Polaritäten, exakte Prozessierung der oligomeren Replikationsintermediären zu Zirkeln, systemischer und intrazellulärer Transport und Variation der Symptome durch wenige Nukleotidaustausche. Erst vor kurzem konnte eine tragfähige molekulare Hypothese aufgestellt werden, in der Viroidfragmente als "small interfering" RNAs (siRNAs) agieren. Im Vorhaben sollen diese Viroidfragmente analysiert werden, mit Voraussagen aus bioinformatischen Untersuchungen verglichen werden und ihre Wirkung getrennt von Viroidreplikation durch biolistische Transformation experimentell verifiziert werden. Als weiteres Funktionsmodul sollen die genauen Eigenschaften postulierter Transkriptionselemente untersucht werden: Tetraloop-Struktur der Startstelle, benachbarte Fragmentduplikation, G:C-Boxen und deren Wechselwirkung mit zellulären Faktoren. Mit den Ergebnissen sollten sich Viroide molekular als Akkumulation natürlicher RNA-Module vollständig beschreiben lassen.

病毒Sind Kurze，zirkuläre，Nicht-kodogene RNAs，die autonom in der Wirtspflanze Replizieren and PflanzenVirus-ähnliche Symptome erzeugen.病毒-核糖核酸的功能在热力学上是稳定的，但仍存在亚稳定的结构和性质。Dazu gehören在Biden Polaritäten中的转录和聚合酶II，Exexte Prozessierung der齐聚物复制烧结的Zu Zirkeln，系统的运输和内部的运输和变异的症状denige wenige nukletidaustausche。在病毒片段和小干扰RNA(SiRNAs)中发现了这些自体细胞。我是Vorhaben Sollen Diese ViroidFragment e Analysiert，MIT Vorossagen Aus BioInformation schen Untersuhungen Verglichen Widden and Ihre Wirkung Getrennt von Viroid Replikation in Hre Hre Wirkung Getrennt von Viroid Replikation in ch Biolistische Examente Verifiziert.ALS Weiteres Funites Funkites FunktionSmoterer de Sollen die genauen Eigenschafen Enigenschaften Transkristionselemente Untersute：Tetraloop-Strukturder Startstelle，benachbarte Fragment Duplikation，G：C-Boxen and Deren Wechselwirkung MIT zellren Faktoren.MIT den Ergebnissen sollten Sich Viroide Molekular ALS Akkumulation natürlicher RNA-Module vollständig be chreiben lassen.