RNA-Funktionsmodule am Beispiel der Viroide: Pathogenität durch Produktion von siRNAs und Transkription durch Erkennung zellulärer Faktoren
RNA-Funktionsmodule am Beispiel der Viroide: Pathogenität durch Produktion von siRNAs und Transkription durch Erkennung zellulärer Faktoren
批准号:
5444397
负责人:
Professor Dr. Detlev Riesner
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2005
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2004-12-31 至 2007-12-31
中文摘要
病毒类型:kkurze, zirkuläre,夜间-kodogene rna,在Wirtspflanze和Pflanzenvirus中的死亡自主性-ähnliche症状性erzegen。类病毒rna的Die functionen被认为是热力学稳定的,也被认为是亚稳定的结构,并被认为是wehselwirkungen mit Wirtsfaktoren gewährleistet。大足gehören转录durch die聚合酶II在北京Polaritäten, exakte Prozessierung der oligomeren Replikationsintermediären zu Zirkeln,系统专家和intrazellulärer转运和变异的症状durch wenige核核糖核酸。研究人员认为,在类病毒片段和“小干扰”rna (sirna)之间存在一定的差异。在Vorhaben solendiese病毒片段分析实验室,在Vorhaben bioinformatischen Untersuchungen verglichen实验室,在werwerkung实验室进行了病毒复制、生物转化实验和验证实验。另一种方法是:函数模块sollen die genauen特征schaften后转录元件untersucht werden: tetraloop - strucktur der Startstelle, benachbarte fragmentduplation, G:C-Boxen and deren wehselwirkung mit zellulären Faktoren。麻省理工学院(Mit den Ergebnissen)研究了该病毒类分子的克隆性<s:1>转录因子rna模块vollständig。
英文摘要
Viroide sind kurze, zirkuläre, nicht-kodogene RNAs, die autonom in der Wirtspflanze replizieren und Pflanzenvirus-ähnliche Symptome erzeugen. Die Funktionen der Viroid-RNA werden sowohl durch thermodynamisch stabile als auch durch metastabile Strukturen und deren Wechselwirkungen mit Wirtsfaktoren gewährleistet. Dazu gehören Transkription durch die Polymerase II in beiden Polaritäten, exakte Prozessierung der oligomeren Replikationsintermediären zu Zirkeln, systemischer und intrazellulärer Transport und Variation der Symptome durch wenige Nukleotidaustausche. Erst vor kurzem konnte eine tragfähige molekulare Hypothese aufgestellt werden, in der Viroidfragmente als "small interfering" RNAs (siRNAs) agieren. Im Vorhaben sollen diese Viroidfragmente analysiert werden, mit Voraussagen aus bioinformatischen Untersuchungen verglichen werden und ihre Wirkung getrennt von Viroidreplikation durch biolistische Transformation experimentell verifiziert werden. Als weiteres Funktionsmodul sollen die genauen Eigenschaften postulierter Transkriptionselemente untersucht werden: Tetraloop-Struktur der Startstelle, benachbarte Fragmentduplikation, G:C-Boxen und deren Wechselwirkung mit zellulären Faktoren. Mit den Ergebnissen sollten sich Viroide molekular als Akkumulation natürlicher RNA-Module vollständig beschreiben lassen.
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DOI:
10.4061/2010/495904
发表时间:
2010-09
期刊:
Journal of Nucleic Acids
影响因子:
2.3
作者:
[Jan-Hendrik Teune;G. Steger]
通讯作者:
Jan-Hendrik Teune;G. Steger
DOI:
10.1515/bc.2010.148
发表时间:
2010-12-01
期刊:
BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
3.7
作者:
[Diermann, Natalie, Matousek, Jaroslav, Steger, Gerhard]
通讯作者:
Steger, Gerhard
DOI:
10.1515/bc.2008.096
发表时间:
2008-07-01
期刊:
BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
3.7
作者:
[Matousek, Jaroslav, Orctova, Lidmila, Steger, Gerhard]
通讯作者:
Steger, Gerhard
DOI:
10.1515/bc.2007.001
发表时间:
2007-01-01
期刊:
BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
3.7
作者:
[Matousek, Jaroslav, Kozlova, Petra, Riesner, Detlev]
通讯作者:
Riesner, Detlev
DOI:
10.1128/jvi.01165-07
发表时间:
2007-11-01
期刊:
JOURNAL OF VIROLOGY
影响因子:
5.4
作者:
[Matousek, J., Orctova, L., Riesner, D.]
通讯作者:
Riesner, D.
Prionen: Infektionsprinzip bewiesen - Infektionsmechanismus unbekannt
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批准号:5451668
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2005
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负责人:Professor Dr. Detlev Riesner
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依托单位:
Viroide als außergewöhnliches Beispiel der Natur für optimale Akquisition eukariotischer Erkennungsmotive
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批准号:5253284
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:Professor Dr. Detlev Riesner
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依托单位: