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The maximum entropy method for accurate charge-density studies, and its application to proteins and other molecules of biological interest

The maximum entropy method for accurate charge-density studies, and its application to proteins and other molecules of biological interest
用于精确电荷密度研究的最大熵方法及其在蛋白质和其他具有生物意义的分子中的应用
批准号:
5449399
负责人:
Professor Dr. Sander van Smaalen
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Priority Programmes
财政年份:
2005
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2004-12-31 至 2014-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
最大内源方法(MEM)解决方案选择zu多极-Verfeineungen(MP Verfeinungen)von Röntgenbeugungsdaten zur Bstimung von genauenElektronendichten von Proteinen and Anderen Molekülen von Biologischem Interesseentwickelt。Im Untersched zur MP Methidet De MEM Net Untersched UnabhänGigenParametern,Ein Problem,Well die UnabhänGige Bstimmung der参数des MPmodells für groçe Moleküle Verhindert.这是一种灵活的方法,也是一种灵活的管理方法,也是一种灵活的方法。他说:“这是一件很重要的事情,我不知道该怎么做。”在我的设计项目中引用了一些参数,包括基本参数、焊接参数、参数名称、参数名称等。方法:Entwicklugen Sollen and Hand von Anwendungen Am Protein Crambin Analysiert.Anwendung der MEM auf Hochauflösende Beugungsdaten des‘防冻’-Proteins Wirddie Chemische Bindung zwitchen Diesem Protein and EIS Charakterisisieren and wird so zueinem Veresserten Verständennis des‘Antrize’-Machismus beitragen.
英文摘要
Die Maximum Entropie Methode (MEM) soll als Alternative zu Multipol-Verfeinerungen(MP Verfeinerungen) von Röntgenbeugungsdaten zur Bestimmung von genauenElektronendichten von Proteinen und anderen Molekülen von biologischem Interesseentwickelt werden. Im Unterschied zur MP Methode leidet die MEM nicht unter abhängigenParametern, ein Problem, welches die unabhängige Bestimmung der Parameter des MPModells für große Moleküle verhindert. Die MEM bestimmt die Elektronendichte in derElementarzelle direkt, und ist demzufolge besser als die MP Methode dazu geeignet, dieElektronendichte sowohl in den flexiblen als auch den geordneten Teilen der Proteine zubeschreiben. Die MEM-Dichten können jedoch Artefakte aufweisen, die spezifisch für dieseMethode sind, und größeres Rauschen als die MP-Dichten zeigen. In diesem Projekt soll eineReferenzdichte (prior) in der MEM eingeführt werden, die auf den MP Parametern basiert,welche der Datenbank übertragbarer MP-Parameter für Peptide entnommen werden wird.Erweiterungen zur MEM sollen entwickelt werden, die zu rauschärmeren Dichtekarten führenund so die Probleme mit dem Rauschen in MEM-Dichten beheben sollen. MethodischeEntwicklungen sollen anhand von Anwendungen am Protein Crambin analysiert werden.Anwendung der MEM auf hochauflösende Beugungsdaten des 'Antifreeze'-Proteins RD1 wirddie chemische Bindung zwischen diesem Protein und Eis charakterisieren und wird so zueinem verbesserten Verständnis des 'Antrifreeze'-Mechanismus beitragen.
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会议论文
Towards understanding high-Z' organic molecular crystals through the superspace method.
  • 批准号:
    389490692
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2017
  • 负责人:
    Professor Dr. Sander van Smaalen
  • 依托单位:
Magnetocrystalline and structural phase transitions of compounds MOCl (M = Ti, V, Cr, Fe) in dependence on pressure and temperature.
  • 批准号:
    386411512
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2017
  • 负责人:
    Professor Dr. Sander van Smaalen
  • 依托单位:
Structural basis for understanding phase transitions in 3-dimensional charge-density-wave compounds
  • 批准号:
    265092781
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2014
  • 负责人:
    Professor Dr. Sander van Smaalen
  • 依托单位:
Experimental characterization of the chemical bonds in boron allotropes and boron-rich compounds
  • 批准号:
    244734497
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2013
  • 负责人:
    Professor Dr. Sander van Smaalen
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
可靠性理论
  • 批准号:
    11422109
  • 项目类别:
    优秀青年科学基金项目
  • 资助金额:
    100万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    赵鹏
  • 依托单位:
微分动力系统的测度和熵
  • 批准号:
    11101447
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    孙鹏
  • 依托单位:
混沌动力系统中的广义熵和维数
  • 批准号:
    10571086
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    23.0万元
  • 批准年份:
    2005
  • 负责人:
    陈二才
  • 依托单位: