Correlation of electron density derived molecular properties with biological activity - a new tool in rational ligand design

电子密度衍生的分子特性与生物活性的相关性——合理配体设计的新工具

• 批准号: 5449794
• 负责人: Professorin Dr. Tanja Schirmeister
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Pharmazeutische und Biomedizinische Wissenschaften (IPBW)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Priority Programmes
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2012-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5449794?language=en
• 关键词: Correlation; electron; density; derived; molecular

Den meisten pharmakologischen Wirkungen von Arzneistoffen liegt die Komplex-Bildungeines niedermolekularen Liganden mit seinem makromolekularen Target, z.B. einem Protein,zu Grunde. In diesem Erkennungsprozess spielen die sterischen, elektrostatischen undWasserstoffbrückenbindungs-Eigenschaften der beiden Interaktionspartner die wichtigsteRolle. In einigen Fällen folgt der nicht-kovalenten Wechselwirkung ein zweiter Schritt: einechemische Reaktion zwischen Ligand und Target, die zu einer kovalenten Modifizierung desTargets führt.Im vorliegenden Projekt sollen die Elektronendichten von niedermolekularen Liganden,erhalten durch ultra-hochauflösende Röntgenstrukturanalysen bei ultra-niedrigen Temperaturen,genutzt werden, um beide Schritte der Wirkung kovalent reagierender biologisch aktiverMoleküle genauer beschreiben zu können. Dies soll exemplarisch mit irreversiblen Inhibitorenvon Aspartat- und Cystein-Protease-Inhibitoren durchgeführt werden, die eine elektrophileKopfgruppe enthalten, die mit einem azapeptidischen oder peptidischen Fragment verknüpftist. Die Ergebnisse der experimentellen Elektronendichte-Bestimmung bzgl. der molekularenEigenschaften der niedermolekularen Protease- Inhibitoren (z.B. elektrostatisches Potential,Eigenschaften von Wasserstoffbrückenbindungen) sollen mit den biologischen Aktivitäten, denEnzymaffinitäten, den Inhibitions-Mechanismen und den chemischen Reaktivitäten verglichenund korreliert werden.

最好的药物制剂是具有最大分子靶点的复合型培养物。一种蛋白质。在这一工作过程中，静电和水蒸气的作用是最重要的。在一个非共价Wechselenkung的Fällen folgt中，有两个Schritt：一个配体和靶的发射反应，一个用于靶的共价修饰反应。Im vorliegenden Projekt sollen die Elektronenketen von niedermolekularen Liganden，erhalten durch ultra-hochauflösende Röntgenstrukturanalysen bei ultra-niedrigen Temperaturen，genutzt韦尔登，um beide Schritte der Wirkung kovalent reagierender biologisch aktiverMoleküle genauer beschreiben zu knnen。这是一个用不可逆的天冬氨酸和半胱氨酸蛋白酶抑制剂在韦尔登中的例子，一个嗜电的Kopfppe组，一个氮杂肽或肽片段。电子测量实验的成果。der molekularenEigenschaften der niedermolekularen Protease-Inhibitoren（z.B. elektrostatisches Potential，Eigenschaften von Wasserstoffbrückenbindungen）sollen mit den biologischen Aktivitäten，denEnzymaffinitäten，den Inhibitions-Mechanismen und den chemischen Reaktivitäten verglichenund korreliert韦尔登.