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Small non-coding RNAs with regulatory functions in alpha-Proteobacteria: Transcriptome-based analysis of regulatory RNAs in Bradyrhizobium japonicum

α-变形菌中具有调节功能的小非编码 RNA：基于转录组的日本慢生根瘤菌调节 RNA 分析

基本信息

批准号：
5451293
负责人：
Professorin Dr. Elena Evguenieva-Hackenberg
金额：
--
依托单位：
Institut für Mikrobiologie und Molekularbiologie
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2005
资助国家：
德国
起止时间：
2004-12-31 至 2016-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5451293?language=en
关键词：
Small non coding RNAs regulatory

项目摘要

Während die Funktionen der rRNA, tRNA und mRNA in der Proteinbiosynthese seit langem bekannt sind, ist die Bedeutung der kleinen nicht-kodierenden RNAs (ncRNAs) bei der Regulation vieler Prozesse in der Zelle erst in den letzten Jahren deutlich geworden. Trotzdem ist über ncRNAs in anderen Bakterien als E. coli fast nichts bekannt. Da nur ncRNAs aus nah verwandten Bakterien eine Sequenzähnlichkeit zeigen, ist es sehr schwierig, die ncRNA-Gene in entschlüsselten bakteriellen Genomen vorherzusagen. Im Rahmen dieses Projektes werden ncRNAs aus den a-Proteobakterien R. palustris, A. tumefaciens, B. japonicum und S. meliloti untersucht. Bei unterschiedlichen Bedingungen exprimierte ncRNAs werden zusammen mit dem hochkonservierten RNA-Bindeprotein Hfq isoliert. Ihre Identifizierung wird durch cDNA-Klonierung, Sequenzanalyse und Expressionsuntersuchung erfolgen. Vergleich der ncRNAs aus den vier Arten wird Aufschluss über relativ konservierte ncRNAs mit regulatorischen Schlüsselfunktionen sowie über Symbiose- oder Pathogenese- relevante ncRNAs geben. Die physiologische Rolle einiger ncRNAs wird näher untersucht. Zusätzlich werden Protein-Interaktionspartner von Hfq analysiert, die für seine Funktion als globaler Regulator von Bedeutung sein können. Im Rahmen des Projektes werden zum ersten Mal ncRNAs aus a-Proteobakterien, zu denen viele landwirtschaftlich bedeutende und pathogene Arten, sowie wichtige Modellorganismen der Grundlageforschung gehören, systematisch untersucht. Die Ergebnisse des Projektes werden auch zum Verständnis der Rolle von Hfq beitragen.

这些蛋白质生物合成中的功能包括rRNA、tRNA和mRNAs，以及它们的ncRNAs(NcRNAs)，ncRNAs(NcRNAs)是调节蛋白质生物合成的重要因素。新发现的NcRNAs在大肠杆菌中的表达。在Enschlüsselten bakteriellen Genomen vorherzusagen中，dnur ncRNAs Aus nah verwand ten Bakterien eine Sequenzähnlichkeit zeigen，is es es sehr schwierig，die ncRNA-gene.我是Rahman dieses Projektes是ncRNAs Aus den a-Proteobakterien R.palustris，A.tuefaciens，B.Japan onicum and S.Meliloti untersuht.Bedingungen的NcRNAs为同源RNA结合蛋白Hfq异构体。这是一种新的基因序列分析和表达方法。NcRNAs与NcRNAs的关系由Arten wird Aufschlussüber Relativv konserverte ncRNAs MIT调节者与致病相关的ncRNAs共同调节。生理学研究发现，Einiger的ncRNA不存在。ZUSätzlich是蛋白质接口合作伙伴von Hfq Analysiert，Die für seine Funktion ALS全球调节器von Bedeutung sein können。我是Rahman des Projektes zum ersten Mal ncRNAs Aus a-Proteobakterien，zu denen viele landwirtschaftlich bedeutende and病原体Arten，Sowie wichtige modellOrganmen der Grundlageforschung gehören，system atich untersuht。在罗勒·冯·赫克·贝特根的带领下，我们的事业得到了极大的发展。