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ペプチドループ配座と配位結合を利用したウイルス状巨大有限集合体の構築

ペプチドループ配座と配位結合を利用したウイルス状巨大有限集合体の構築
使用肽环构象和配位键构建病毒样巨型有限聚集体
批准号:
17J07449
负责人:
山上 樹也
金额:
$1.6万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-04-26 至 2020-03-31

项目摘要

项目成果

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平成31年度には人工βバレル構造の構築を単結晶X線構造解析によって明らかにしたが、種々の溶媒への溶解性が著しく低く、その溶液構造の解析には至らなかった。これは、細胞膜中に存在する天然のβバレルタンパク質と同様の挙動であった。そこで、令和元年度は、人口βバレル構造の有機溶媒への可溶化を目指した。まずは、前年度から引き続き、核磁気共鳴分光法(NMR)によって溶液構造を検証することとした。人工βバレル構造を構成するオクタペプチド配位子にジエチレングリコール鎖を1あるいは2つ導入することで、バレル構造を可溶化できることを見出した。このβバレル構造は、クロロホルム/アルコールという比較的低極性の有機溶媒に可溶であり、溶液中でのNMR測定によって構造解析を行うことができた。NMR測定の結果、可溶化したβバレル構造は、溶液中で2種類の構造の混合物として存在していることが明らかとなった。また、これら2つの構造間で、可逆的に構造変換していることも明らかとなった。さらに、2つのバレル構造の組成は、それぞれ6本及び8本のペプチド配位子から構成されるβバレル構造であることを単結晶X線構造解析によって明らかにした。一般にβバレルタンパク質の溶液構造をNMR及び単結晶X線構造解析法を用いて解明することは困難であり、今回、2つのバレル構造間での構造変換という動的挙動を解明することは、化学的のみならず、生物学的にも極めて重要な知見といえる。
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会议论文
Porous Peptide Complexes by a Folding-and-Assembly Strategy
通过折叠和组装策略制备多孔肽复合物
DOI: 10.1002/asia.201700458
发表时间: 2017
期刊: Chem. Asian J.
影响因子: --
作者: [Tomohisa Sawada, Motoya Yamagami, Shuji Akinaga, Tatsuki Miyaji, Makoto Fujita]
通讯作者: Makoto Fujita
A synthetic β-barrel made of zinc and a short peptide
由锌和短肽制成的合成 β-桶
DOI: --
发表时间: 2018
期刊:
影响因子: --
作者: [Motoya Yamagami, Tomohisa Sawada, Makoto Fujita]
通讯作者: Makoto Fujita
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [Motoya Yamagami, Tomohisa Sawada, Makoto Fujita, 山上 樹也・澤田 知久・藤田 誠, 山上 樹也・猪俣祐貴・澤田 知久・藤田 誠]
通讯作者: 山上 樹也・猪俣祐貴・澤田 知久・藤田 誠
配位結合を用いた人工βバレルの構築と機能化
利用配位键构建人工β-桶并进行功能化
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Tomohisa Sawada, Yuuki Inomata, Motoya Yamagami, Makoto Fujita, 山上 樹也・澤田 知久・藤田 誠, 山上 樹也・澤田 知久・藤田 誠]
通讯作者: 山上 樹也・澤田 知久・藤田 誠
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