安定なβ-シート構造形成能を有する機能性ペプチドの構築

能够形成稳定β-折叠结构的功能性肽的构建

• 批准号: 06858061
• 负责人: 森井 孝
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06858061/
• 关键词: βシート; オリゴペプチド; 分子認識; ホストーゲスト; 二量体; シクロデキストリン; 二次構造; Croタンパク

β-シート構造が関与した多量体形成は天然のタンパク質においてその例が数多く見られるのにもかかわらず、その詳細な分子機構は全くわかっていない。本研究の目的はこれらのタンパク質の二量体形成をになっている部分、特にβ-シート構造による二量体形成部位のモデル化合物を合成して水溶液中での二量体形成機構を探ると共に、それをもとに非共有結合により高次構造を形成する機能性人工タンパク質を構築するための天然には存在しない二量体形成分子を合成することにある。本年度の研究ではすでにその三次元構造がX線結晶解析により明らかになっているファージλCroタンパク質の二量体形成部分をモデル化することを試みた。Croタンパク質二量体とオペレーターDNA複合体で興味深いのはDNA結合能は二量体形成に依存し、二量体形成は各々の単量体のC末端部分での逆平行β-シート形成ならびにフェニルアラニン残基がもう一方の単量体のN末端部分で形成される疎水性ポケットに取り込まれることにより安定化されている事である。この二量体形成機構をもとにして、Croタンパク質のC末端部分のアミノ酸配列を持ち、N末端部分のアミノ酸で形成される疎水性ポケットのかわりにゲスト包接能を持つシロデキストリン分子をもつ14アミノ酸残基からなるオリゴペプチドを合成した。合成したペプチドの二量体形成能の評価は、単量体と二量体の分子量が違うことを利用して、ゲル濾過クロマトグラフィーを用いて行った。現在までの結果では、濃度に依存して二量体と思われるピークが生成することがわかっている。βシート構造をとることによって特徴的な円二色性(CD)スペクトルが観測されると期待されるので、今後、CDスペクトルを用いて構造を明かにする。

There are many examples of beta-sitot structures related to the formation of multibodies in natural materials, and there are many detailed molecular structures. The purpose of this study is to explore the mechanism for the formation of dimers in aqueous solutions, including the formation of functional artificial dimers in aqueous solutions, and the formation of dimers in aqueous solutions. This year's research is aimed at analyzing the three-dimensional structure of X-ray crystals. The DNA binding energy of the Cro-2 complex is dependent on the formation of the C-terminal portion. These two molecules form a mechanism for the formation of a complex molecule, such as a C-terminal portion of the molecule, an N-terminal portion of the molecule, and an N-terminal portion. The synthesis of these molecules can be evaluated in terms of their molecular weight, and the use of these molecules can be evaluated in terms of their molecular weight. The results are now concentration-dependent and the two quantities are thought to be generated. The structure of β is characterized by dichroism (CD), which is expected to be used in the future.

项目成果

Takashi Morii: "Induced Fit of Helical Biphenyl Ligands to the Double-Stranded DNA" Tetrahedron Letters. 35. 1219-1222 (1994)

Takashi Morii：“螺旋联苯配体与双链 DNA 的诱导拟合”四面体字母。

Takashi Morii: "Recognition of Nonpalindromic DNA Sequence by a Peptide Heterodimer with Artificial Dimerization Module" Journal of the American Chemical Society. 116. 11137-11138 (1994)

Takashi Morii：“通过具有人工二聚化模块的肽异二聚体识别非回文 DNA 序列”美国化学会杂志。

Takashi Morii: "Sequence-Specific DNA Binding by Covalently Constrained Peptide Dimers of the Basic Leucine Zipper Protein GCN4" Bioorganic and Medicinal Chemistry. (in press). (1995)

Takashi Morii：“基本亮氨酸拉链蛋白 GCN4 的共价约束肽二聚体的序列特异性 DNA 结合”生物有机和药物化学。

Jacqueline K.Barton: "Correlation of Crystal Structures of DNA Oligonucleotides with Enantioselective Recognition by Rh (phen) _2phi^<3+> : Probes of DNA Propeller Twisting in Solution" Biochemistry. 33. 4130-4139 (1994)

Jacqueline K.Barton：“DNA 寡核苷酸晶体结构与 Rh (phen) _2phi^<3 > 的对映选择性识别的相关性：溶液中 DNA 螺旋桨扭转的探针”生物化学。

Takashi Morii: "Sequence-specific DNA binding of short peptides with an artificial dimerization module" Nucleic Acids Symposium Series. 31. 289-290 (1994)

Takashi Morii：“短肽与人工二聚化模块的序列特异性 DNA 结合”核酸研讨会系列。