课题基金 / 基金详情

新規ChIP-seq法及び関連手法の開発による転写制御因子の機能解析

新規ChIP-seq法及び関連手法の開発による転写制御因子の機能解析
开发新的 ChIP-seq 方法及相关方法对转录调控因子进行功能分析
批准号:
17J09723
负责人:
吉田 英樹
金额:
$2.83万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-04-26 至 2020-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
bZIP型転写因子の1つであるOsFD1は花成ホルモン・フロリゲンとして機能する転写制御因子Hd3aと茎頂分裂組織において結合し、下流遺伝子の発現を制御することでvegetative phaseからreproductive phaseへのtransitionを制御していることが知られている。しかしながら、OsFD1の下流遺伝子についての知見は乏しく、花成調節以外の機能についてはほとんど知られていない。本研究では、新たに開発した簡便なChIP-seq法を用いて、イネゲノム上のOsFD1結合領域を網羅的に解析することに成功した。その結果得られた多数の下流遺伝子候補の中には、イネにおいて葉や根など様々な器官のサイズの調節に関わる植物ホルモンであるブラシノステロイドの合成酵素であるD2などの関連遺伝子が見つかり、さらにジャスモン酸合成に関わる遺伝子も下流遺伝子候補として検出されていた。Gene targeting法により作出されたosfd1変異体の表現型を観察した結果、半矮性や穎花の開閉の異常などのブラシノステロイドまたはジャスモン酸シグナル伝達に異常がある変異体に特徴的な表現型が見られた。以上の結果から、イネ植物体内でOsFD1は花成シグナルの制御だけでなく、ブラシノステロイド・ジャスモン酸関連遺伝子の発現を制御することによって、これらの植物ホルモンシグナル伝達の調節を担い、様々な器官の成長制御に関わっていることが示された。
英文摘要
bZIP型転写因子の1つであるOsFD1は花成ホルモン・フロリゲンとして機能する転写制御因子Hd3aと茎頂分裂組織において結合し、下流遺伝子の発現を制御することでvegetative phaseからreproductive phaseへのtransitionを制御していることが知られている。しかしながら、OsFD1の下流遺伝子についての知見は乏しく、花成調節以外の機能についてはほとんど知られていない。本研究では、新たに開発した簡便なChIP-seq法を用いて、イネゲノム上のOsFD1結合領域を網羅的に解析することに成功した。その結果得られた多数の下流遺伝子候補の中には、イネにおいて葉や根など様々な器官のサイズの調節に関わる植物ホルモンであるブラシノステロイドの合成酵素であるD2などの関連遺伝子が見つかり、さらにジャスモン酸合成に関わる遺伝子も下流遺伝子候補として検出されていた。Gene targeting法により作出されたosfd1変異体の表現型を観察した結果、半矮性や穎花の開閉の異常などのブラシノステロイドまたはジャスモン酸シグナル伝達に異常がある変異体に特徴的な表現型が見られた。以上の結果から、イネ植物体内でOsFD1は花成シグナルの制御だけでなく、ブラシノステロイド・ジャスモン酸関連遺伝子の発現を制御することによって、これらの植物ホルモンシグナル伝達の調節を担い、様々な器官の成長制御に関わっていることが示された。
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会议论文
ジベレリン受容体GID1の分子進化 受容システムの最適化と双子葉類における多様化
赤霉素受体GID1的分子进化。双子叶植物受体系统的优化和多样化。
DOI: --
发表时间: 2019
期刊: 化学と生物
影响因子: --
作者: [吉田 英樹, 上口(田中) 美弥子]
通讯作者: 上口(田中) 美弥子
低窒素栽培に適したイネの作出に向けた窒素による成長制御機構の解明
  • 批准号:
    24K01886
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $11.98万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    吉田 英樹
  • 依托单位:
プロリン連続配列の関与する翻訳制御のmRNA局在化に与える影響
  • 批准号:
    24K09437
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $3.0万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    吉田 英樹
  • 依托单位:
本邦ICUでのVAP診療における、BioFire(r)肺炎パネルの有用性評価RCT
  • 批准号:
    23K08451
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $3.0万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    吉田 英樹
  • 依托单位:
イネ種子発芽を温度に応じて制御する転写調節モジュールの解析
  • 批准号:
    21K15120
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 资助金额:
    $3.0万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    吉田 英樹
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
多样本ChIP-Seq数据定量比较的生物信息工具开发
基于ChIP-Seq技术探讨组蛋白修饰在补肾法防治骨质疏松症中的表观遗传机制
  • 批准号:
    81774339
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    王海彬
  • 依托单位:
基因组异质性对减数分裂重组影响的ChIP-seq实验验证
  • 批准号:
    91631104
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    100.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    杨四海
  • 依托单位:
基于ChIP-Seq的CREB介导越鞠丸快速抗抑郁作用分子机制研究
  • 批准号:
    81603497
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    17.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    王薇
  • 依托单位: