新規ＣｈＩＰ－ｓｅｑ法及び関連手法の開発による転写制御因子の機能解析

开发新的 ChIP-seq 方法及相关方法对转录调控因子进行功能分析

• 批准号: 17J09723
• 负责人: 吉田 英樹
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Nagoya University (2019)Yokohama City University (2017-2018)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2017
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2017-04-26 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17J09723/
• 关键词: 転写制御因子; ChIP-seq; プロトプラスト

bZIP型転写因子の1つであるOsFD1は花成ホルモン・フロリゲンとして機能する転写制御因子Hd3aと茎頂分裂組織において結合し、下流遺伝子の発現を制御することでvegetative phaseからreproductive phaseへのtransitionを制御していることが知られている。しかしながら、OsFD1の下流遺伝子についての知見は乏しく、花成調節以外の機能についてはほとんど知られていない。本研究では、新たに開発した簡便なChIP-seq法を用いて、イネゲノム上のOsFD1結合領域を網羅的に解析することに成功した。その結果得られた多数の下流遺伝子候補の中には、イネにおいて葉や根など様々な器官のサイズの調節に関わる植物ホルモンであるブラシノステロイドの合成酵素であるD2などの関連遺伝子が見つかり、さらにジャスモン酸合成に関わる遺伝子も下流遺伝子候補として検出されていた。Gene targeting法により作出されたosfd1変異体の表現型を観察した結果、半矮性や穎花の開閉の異常などのブラシノステロイドまたはジャスモン酸シグナル伝達に異常がある変異体に特徴的な表現型が見られた。以上の結果から、イネ植物体内でOsFD1は花成シグナルの制御だけでなく、ブラシノステロイド・ジャスモン酸関連遺伝子の発現を制御することによって、これらの植物ホルモンシグナル伝達の調節を担い、様々な器官の成長制御に関わっていることが示された。

BZIP type planning write factor の 1 つ で あ る OsFD1 は flowers into ホ ル モ ン · フ ロ リ ゲ ン と し て function す る planning write suppression factor Hd3a と stem top separatist group に お い て combining し, dirty but 伝 の 発 now を suppression す る こ と で vegetative phase か ら reproductive The phaseへ <s:1> transitionを controls the て る る <s:1> とが とが とが and the られて る る. し か し な が ら, OsFD1 の dirty legacy 伝 son に つ い て の knowledge は spent し outside の く, flowers into regulating function に つ い て は ほ と ん ど know ら れ て い な い. This study で は, new た に open 発 し た simple な を ChIP - seq method with い て, イ ネ ゲ ノ ム on の OsFD1 combining field を snare に parsing す る こ と に successful し た. そ の results have ら れ た most の dirty legacy 伝 child alternate の に は, イ ネ に お い て leaf や root な ど others 々 な organ の サ イ ズ の adjust に masato わ る plant ホ ル モ ン で あ る ブ ラ シ ノ ス テ ロ イ ド の synthetic enzyme で あ る D2 な ど の masato even heritage 伝 が son see つ か り, さ ら に ジ ャ ス モ ン acid synthesis に masato わ る heritage 伝 も dirty but 伝 son alternate と し Youdaoplaceholder0 gives されて た た. Gene targeting method に よ り make さ れ た osfd1 - variant の phenotype を 観 examine し た results, and a half short や new の open closed の abnormal な ど の ブ ラ シ ノ ス テ ロ イ ド ま た は ジ ャ ス モ ン acid シ グ ナ ル 伝 に exception が あ る - variant に な phenotype of 徴 が see ら れ た. の above results か ら, イ ネ plants で OsFD1 は flowers into シ グ ナ ル の suppression だ け で な く, ブ ラ シ ノ ス テ ロ イ ド · ジ ャ ス モ ン acid masato even heritage 伝 son の 発 now を suppression す る こ と に よ っ て, こ れ ら の plant ホ ル モ ン シ グ ナ ル 伝 の adjust を bear い, others 々 な organ の growth suppression に masato わ っ て い る こ と が shown さ れ た.

项目成果

ジベレリン受容体GID1の分子進化 受容システムの最適化と双子葉類における多様化

赤霉素受体GID1的分子进化。双子叶植物受体系统的优化和多样化。

• 发表时间: 2019
• 期刊: 化学と生物
• 作者: 吉田 英樹;上口（田中） 美弥子
• 通讯作者: 上口（田中） 美弥子