Analyses on developmental transition process of mammalian pluripotent cells and its epigenomic regulations using single cell technologies

利用单细胞技术分析哺乳动物多能细胞的发育转变过程及其表观基因组调控

• 批准号: 18H02424
• 负责人: ABE KUNIYA
• 金额: $ 11.23万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-01 至 2021-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H02424/
• 关键词: 細胞分化; 分化遷移; 多能性幹細胞; Ｘ染色体不活性化; シングルセル解析; エピゲノム; DNAメチル化; シングルセル; エピジェネティクス; 多能性細胞; ナイーブープライム変換

项目成果

Single cell transcriptome analyses reveal novel intermediate pluripotent states during transition from naive to primed pluripotent stem cells

单细胞转录组分析揭示了从初始多能干细胞向启动多能干细胞转变过程中新的中间多能状态

• 发表时间: 2019
• 作者: Tada Y;Bottcher M;Kondo M;Ura H;Carninci P;Carninci P;Abe K
• 通讯作者: Abe K

Visualization and quantitative analyses for mouse embryonic stem cell tracking by manipulating hierarchical data structures using time-lapse confocal microscopy images

通过使用延时共焦显微镜图像操作分层数据结构对小鼠胚胎干细胞追踪进行可视化和定量分析

• DOI: 10.1109/embc46164.2021.9629490
• 发表时间: 2021
• 期刊: Annu Int Conf IEEE Eng Med Biol Soc. 2021
• 作者: Yokota Hideo;Abe Kuniya;Chang Yuan-Hsiang;Cho Dooseon;Tsai Ming- Dar;Huang Pin-Han
• 通讯作者: Huang Pin-Han

Human iPS cell-derived cartilaginous tissue spatially and functionally replaces nucleus pulposus

• DOI: 10.1016/j.biomaterials.2022.121491
• 发表时间: 2022-04-05
• 期刊: BIOMATERIALS
• 影响因子: 14
• 作者: Kamatani, Takashi;Hagizawa, Hiroki;Tsumaki, Noriyuki
• 通讯作者: Tsumaki, Noriyuki

Human induced pluripotent stem cell region detection in bright-field microscopy images using convolutional neural networks

使用卷积神经网络在明场显微镜图像中检测人类诱导多能干细胞区域

• DOI: 10.4015/s1016237219500091
• 发表时间: 2019
• 期刊: Biomedical Engineering: applications, basis and communications
• 作者: Chang Y-H;Abe K;Yokota H;Sudo K;Nakamura Y;Tsai M-D
• 通讯作者: Tsai M-D

着床前後のマウス胚におけるトランスクリプトーム動態解析とDNAメチル化の役割 Transcriptome dynamics and DNA methylation in mouse peri-implantation embryos

小鼠植入前后胚胎的转录组动力学和 DNA 甲基化

• 发表时间: 2019
• 作者: 田夛祐喜;志浦寛相;阿部訓也
• 通讯作者: 阿部訓也