Determination of RNA Structure by Magic Angle Spinning Solid State NMR Spectroscopy

魔角旋转固态核磁共振波谱测定 RNA 结构

• 批准号: 5456681
• 负责人: Dr. Matthias Görlach (†)
• 金额: --
• 依托单位: Forschungsgruppe Biomolekulare NMR-Spektroskopie (aufgelöst)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5456681?language=en
• 关键词: Determination; RNA; Structure; Magic; Angle

Magic angle spinning Festkörper-NMR-Spektroskopie (MAS NMR) hat sich in jüngster Zeit zu einer wichtigen Methode zur Strukturbestimmung von Biomolekülen entwickelt. Zusätzlich sollte sich diese Methode für Systeme einsetzen lassen, deren Untersuchung durch Flüssigphasen-NMR-Spektroskopie oder Röntgenstrukturanalyse auf Grund von Probeneigenschaften (Löslichkeit/ Kristallisierbarkeit) schwierig oder undurchführbar ist. Ziel des vorliegenden Projektes ist es, das Potential von MAS NMR zur Strukturbestimmung von RNA-Molekülen, die in pathogene Prozesse involviert sind, auszuloten und anzuwenden. Diese Arbeiten sollen an einer microsatellite expansion repeat RNA, die die molekulare Grundlage der myotonen Dystrophie (DM1) darstellt, und an RNA-Signalstrukturen, die für die enterovirale Replikation essentiell sind, durchgeführt werden. Experimente zur sequentiellen Resonanz-Zuordnung, zur Charakterisierung von Wasserstoffbrücken Netzwerken und zur Generierung von Abstands- und Torsionswinkel-Einschränkungen sollen an isotopen-markierter RNA entwickelt und eingesetzt werden. Die so gewonnenen strukturellen Informationen sollen dann mittels des Distanzgeometrie-gestützten Ansatzes zur Berechnung der dreidimensionalen Struktur von RNA-Molekülen führen.

魔角自旋Festkörper-NMR-Spektroskopie（MAS NMR）是一种新的生物分子结构测量方法。Zusätzlich sollte sich diese Methode für Systeme einsetzen lassen，deren Untersuchung durch Flüssigphasen-NMR-Spektroskopie or der Röntgenstrukturanalysis auf Grund von Probeneigenschaften（Löslichkeit/ Kristallisierbarkeit）schwierig or der undurchführbar ist.这些研究项目表明，MAS NMR对RNA分子结构的预测潜力，在致病过程中涉及到两个方面：一是对RNA分子结构的预测，二是对RNA分子结构的预测。本文研究了一种微卫星扩增重复RNA，即肌营养不良（DM 1）的分子基础，以及一种RNA信号结构，它是肠道病毒感染的必要条件。通过序列共振实验、水蒸汽桥网络特性实验和Abstands-和Torsionswinkel-Einschränkungen生成实验，可以得到同位素标记的RNA，并使之形成韦尔登。这种结构信息必须由RNA分子三维结构的距离几何测量方法确定。