都市下水から薬を創り出す：棄てられたヒト免疫細胞由来遺伝子を活用した抗体医薬開発

从城市污水中制造药物：利用废弃的人类免疫细胞衍生基因开发抗体药物

• 批准号: 21K18171
• 负责人: 佐野 大輔
• 金额: $ 16.64万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-09 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K18171/
• 关键词: 都市下水; 感染症; 免疫細胞; ヒト抗体遺伝子; 抗体医薬

本研究は、都市下水から回収した抗体遺伝子を用いて抗体医薬の合成を行う手法の開発に取り組むものである。研究２年度である令和４年度においては、前年度にPCRにより下水から取得することに成功した免疫細胞由来遺伝子の増幅産物について、次世代シーケンス解析を行うためのプロトコル構築に取り組んだ。構築したプロトコルは全部で９ステップから成り、１）下水からの固形物回収、２）遺伝子抽出、３）cDNA合成、４）PCR（１回目）、５）PCR（２回目）、６）電気泳動、７）DNA濃度測定、８）ライブラリ作成用PCR、および９）次世代シーケンシング解析、である。さらに、次世代シーケンシング解析結果の分析方法についても、バイオインフォマティクス用ソフトウェアを用いて、分析シーケンス（パイプライン）を構築した。このパイプラインを適用することで、得られた遺伝子配列解析結果を用いて系統樹を作成することができる。最終的に、実際に下水から得られた遺伝子配列を用いて、PCRに用いるプライマーおよび温度設定を含め、上記の一連の作業をについて最適化を行った。その結果、Vollmersらが2013年に発表したプライマーを用い、アニーリング温度60度でPCRを行うことで、最も効率よくPCR産物を得ることが可能であることが判明した。以上の成果をもとに、研究3年度目である令和5年度においては、新型コロナウイルス感染症が発生していた期間に採取して保管してある下水を対象として、抗体遺伝子の取得を目指す。

This study は, city water か ら back 収 し た antibody heritage 伝 son を with い て antibody medical 薬 line を う の synthesis technique の open 発 に group take り む も の で あ る. Study 2 year で あ る make and 4 year に お い て は, former annual に PCR に よ り launching か ら obtain す る こ と に successful し た immune cell origin heritage 伝 son の raised product picture に つ い て, next generation シ ー ケ ン ス parsing line を う た め の プ ロ ト コ ル build に group take り ん だ. Build し た プ ロ ト コ ル は で all 9 ス テ ッ プ か ら り, 1) launching か ら の solids 収, 2) heritage 伝 extraction, 3) cDNA synthesis, 4) PCR (pa2) 1, 5) PCR (pa2) 2, 6) electric 気 swimming, 7) DNA concentration determination, 8) ラ イ ブ ラ リ made by PCR, お よ び 9) nextgen シ ー ケ ン シ ン Youdaoplaceholder0 analysis, である. さ ら に, next generation シ ー ケ ン シ ン グ analytical results の analysis method に つ い て も, バ イ オ イ ン フ ォ マ テ ィ ク ス with ソ フ ト ウ ェ ア を with い て, analysis シ ー ケ ン ス (パ イ プ ラ イ ン) を build し た. こ の パ イ プ ラ イ ン を applicable す る こ と で, ら れ た heritage 伝 with sequence analytical results を い て system tree を made す る こ と が で き る. Final に, be interstate に launching か ら have ら れ た posthumous son 伝 matched with column を い て, PCR に い る プ ラ イ マ ー お よ び temperature setting を め, written の for の homework を に つ い て line optimization を っ た. そ の results, Vollmers ら が 2013 に 発 table し た プ ラ イ マ ー を い, ア ニ ー リ ン グ temperature 60 degrees で PCR line を う こ と で, most も sharper rate よ を く PCR products have る こ と が may で あ る こ と が.at し た. All above の を も と に, 3 year mesh で あ る make and 5 year に お い て は, new コ ロ ナ ウ イ ル ス adapting just-in-time inventory が 発 raw し て い た に during take し て custody し て あ る を water like と seaborne し て, antibody heritage 伝 child obtain の を refers す.