リボソーム融合型ナノポア技術による1分子タンパク質網羅定量解析
利用核糖体融合纳米孔技术对单分子蛋白质进行全面定量分析
基本信息
- 批准号:21K18232
- 负责人:
- 金额:$ 16.64万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-07-09 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
当該年度においては、ペプチドの1分子ナノポア計測実現を目指し、平面膜上での脂質膜再構成とSecYEGチャネルタンパク質の挿入、及びSecAタンパク質との複合体に対する基質ペプチドの膜通過シグナルの検出を試みた。4つのチャネルを同時計測可能なナニオンテクノロジーズ社のOrbit miniと温度コントローラーを導入し、温度条件を変えながら脂質膜の構築を試した。脂質膜は多重膜にならず、脂質二重膜の単重膜が形成される条件を決めることができた。さらに、SecYEGが膜に挿入されることを印加電圧を可変にした電流応答の変化で複数回確認できたが、導入効率は低いままであったため、ペプチド通過計測には至らなかった。次年度においては、これらを改善するために、PURE systemを用いた無細胞合成系によるSecYEG挿入や脂質膜の組み合わせの改良、さらには平面膜のみならず、液滴接触法を用いて実験系の改良を試みる。これによってペプチドの通過信号を得ることができたら、複数種類のペプチドの通過データをいくつかの印加電圧で取得し、それらに対して機械学習による解析を行う。その後、複数種類のペプチドを分類することを通過電流データのみで行うことを目標とする。さらには、リボソーム分子とSecYEGとの融合を試み、合成過程と新生ペプチドの通過過程の同時測定を試みる。このために、シグナル配列の検討、温度条件検討、及びイオン強度条件検討が必須となる。
When the annual に お い て は, ペ プ チ ド の 1 molecular ナ ノ ポ ア measuring be presently を refers し, plane membrane で の lipid membrane reconstitution と SecYEG チ ャ ネ ル タ ン パ ク qualitative の scions into and び SecA タ ン パ ク qualitative と の complex に す seaborne る matrix ペ プ チ ド の membrane through シ グ ナ ル の 検 try out を み た. 4 つ の チ ャ ネ ル を may at the same time measuring な ナ ニ オ ン テ ク ノ ロ ジ ー ズ club の Orbit mini と temperature コ ン ト ロ ー ラ ー を import し を, temperature conditions - え な が ら lipid membrane の build を try し た. The formation される conditions of lipid membranes にならず multilayer membranes にならず and lipid dilayer membranes 単 heavy membranes が depend on を, める, とがで and た. さ ら に, SecYEG が membrane に scions into さ れ る こ と を Inca electric 圧 を can - に し た current 応 の answer - the で plural back to confirm で き た が, import, low rate of unseen は い ま ま で あ っ た た め, ペ プ チ ド through measuring に は to ら な か っ た. Annual に お い て は, こ れ ら を improve す る た め に, PURE system を い た cell free GeChengXi に よ る SecYEG scions into や lipid membrane の group み close わ せ の improvement, さ ら に は plane membrane の み な ら を ず, droplet contact method with い て be modified を 験 is の try み る. こ れ に よ っ て ペ プ チ ド の based on signal を る こ と が で き た ら, plural kinds の ペ プ チ ド の through デ ー タ を い く つ か の Inca electric 圧 で obtain し, そ れ ら に し seaborne て rote learning に よ る parsing う を line. After そ の, plural kinds の ペ プ チ ド を classification す る こ と を by current デ ー タ の み で line う こ と を target と す る. さ ら に は, リ ボ ソ ー ム molecular と SecYEG と を try み の fusion, synthetic process と freshman ペ プ チ ド の through process の simultaneous determination を try み る. The <s:1> ために, シグナ シグナ configuration of <s:1> 検, temperature conditions 検, and び <s:1> and <s:1> <s:1> intensity conditions 検 must が.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Photothermally enhanced single molecule nanopore sensing
光热增强单分子纳米孔传感
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hirohito Yamazaki;Sotaro Uemura
- 通讯作者:Sotaro Uemura
フォトサーマル効果を活用した一分子ナノポア計測技術の創出
利用光热效应创建单分子纳米孔测量技术
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hisano Masumi;Chen Han Y. H.;山崎洋人 ,上村想太郎
- 通讯作者:山崎洋人 ,上村想太郎
ナノポア計測によるCALHM2チャネルダイナミクスの解明
通过纳米孔测量阐明 CALHM2 通道动力学
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:中村宗太郎;山崎洋人;志甫谷渉;濡木理;上村想太郎
- 通讯作者:上村想太郎
A study on the structural dynamics of the nucleosome containing H2A.B using solid-state nanopores
利用固态纳米孔研究含有H2A.B的核小体的结构动力学
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hikaru Nozawa;Hirohito Yamazaki;Ryo Iizuka;Rina Hirano;Tomoya Kujirai;Hitoshi Kurumizaka;Sotaro Uemura
- 通讯作者:Sotaro Uemura
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
上村 想太郎其他文献
N-terminal residues of Drosophila Argonaute2 possess the ability to form amyloid fibrils
果蝇Argonaute2的N端残基具有形成淀粉样原纤维的能力
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
成田 晴香;桑原 誠;小森 智貴;村上 僚;島 知弘;塩見 美喜子;上村 想太郎 - 通讯作者:
上村 想太郎
レドックスを介した小胞体恒常性維持機構
氧化还原介导的内质网稳态维持机制
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
成田 晴香; 桑原 誠;小森 智貴; 村上 僚;島 知弘;塩見 美喜子;上村 想太郎;潮田 亮 - 通讯作者:
潮田 亮
N- terminal region of Drosophila Argonaute2 can form amyloid fibrils
果蝇Argonaute2的N端区域可以形成淀粉样原纤维
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
成田 晴香; 桑原 誠;小森 智貴; 村上 僚;島 知弘;塩見 美喜子;上村 想太郎 - 通讯作者:
上村 想太郎
ショウジョウバエアルゴノート 2 の N 末端領域はアミロイド様凝集体を形成する(N-terminal region of Drosophila Argonaute2 can form amyloid-like aggregates)
果蝇Argonaute2的N端区域可以形成淀粉样蛋白样聚集体
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
成田 晴香;島 知弘;飯塚 怜;塩見 美喜子;上村 想太郎 - 通讯作者:
上村 想太郎
電極アレイを用いた高速液滴分取
使用电极阵列高速液滴分离
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
磯崎 瑛宏;中川 悠太;Mun Hong Loo;芝田 悠大;田中 直樹;Dwi Larasati Setyaningrum;Jee-Woong Park;白崎 善隆;三上 秀治;上村 想太郎;Dino Di Carlo;合田圭介 - 通讯作者:
合田圭介
上村 想太郎的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('上村 想太郎', 18)}}的其他基金
リボソームのタンパク質合成メカニズムの1分子機能解析
核糖体蛋白质合成机制的单分子功能分析
- 批准号:
19037009 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
光ピンセット法によるタンパク質翻訳機構の1分子操作
使用光镊方法单分子操纵蛋白质翻译机器
- 批准号:
19042003 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
キネシン・微小管結合様式の1分子顕微解析
驱动蛋白-微管结合模式的单分子显微分析
- 批准号:
02J03387 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
リン脂質膜界面における酵素加水分解反応の分子科学研究
磷脂膜界面酶促水解反应的分子科学研究
- 批准号:
24K08347 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
超音波医療用の脂質膜で覆われた気泡のミクロとマクロを接続する新たな数理モデル
一种新的数学模型,将脂质膜覆盖的气泡的微观和宏观方面联系起来,用于医疗超声应用
- 批准号:
24KJ0501 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
脂質膜上の流れによるペプチドの凝集促進機構を分子動力学シミュレーションで解明する
利用分子动力学模拟阐明脂质膜上的流动促进肽聚集的机制
- 批准号:
24K09409 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
光熱変換色素による脂質膜動態制御と細胞機能解析・操作
使用光热转换染料进行脂质膜动力学控制和细胞功能分析/操作
- 批准号:
24K01307 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
CAREER: Cellular Mechanics at the Nanoscale: Lipid Membrane Elasticity and Force Transduction in Mechanosensitive Proteins
职业:纳米尺度的细胞力学:机械敏感蛋白中的脂质膜弹性和力传导
- 批准号:
2326678 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Standard Grant
「生体膜リン脂質-膜タンパク質連関」から紐解く神経障害性疼痛発症メカニズムの解明
从“生物膜磷脂-膜蛋白关联”阐明神经性疼痛发病机制
- 批准号:
22KJ3239 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Basic technology of lipid membrane immunosensor for detection of pathogenic protein in blood contributing to ultra-early diagnosis of dementia
脂膜免疫传感器检测血液中致病蛋白的基础技术有助于痴呆症超早期诊断
- 批准号:
23K17476 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
Investigating the role of lipid membrane in the cochlear hair cell mechanotransduction
研究脂质膜在耳蜗毛细胞机械转导中的作用
- 批准号:
10652895 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
光感受性物質含有複合脂質膜を用いたがん治療・検出薬の開発に関する研究
利用含光敏剂的复合脂膜开发癌症治疗和检测药物的研究
- 批准号:
22K20516 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
Sensory Lipid Membrane Films with Integrated Inorganic Coordination Complexes
具有集成无机配位络合物的感觉脂质膜
- 批准号:
2714575 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 16.64万 - 项目类别:
Studentship