サカナ（胎生発生真骨魚類）にゲノムインプリンティングは存在するか？

鱼类（胎生硬骨鱼）中是否存在基因组印记？

• 批准号: 21K19237
• 负责人: 木下 哲
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-09 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19237/
• 关键词: インプリンティング; 胎生魚; インプリント遺伝子; コンフリクト仮説; 胎生魚類

ゲノムインプリンティングは、対立遺伝子のオス・メスの由来に従って遺伝子発現が決定される現象である。進化の過程で胚への栄養供給を巡るオス・メスのせめぎ合いの結果、片親性の遺伝子発現が獲得されたと考えられている。こうした現象は、母胎中に子を宿す、哺乳動物と被子植物においてその詳細が研究されており、DNAメチル化などのエピジェネティックな制御機構が明らかになっている。進化生態学の分野では、胎生発生する生物は、オス・メスの利益に従ってインプリント遺伝子が進化したというコンフリクト仮説が広く受け入れられているが、胎盤を持つ哺乳類と胚乳を持つ被子植物以外の生物種では殆ど検証されていない。しかしながら胎生は、進化の過程で複数の分類群で独立に出現しており、包括的な理解には、より多くの生物種での解析が必要となる。本研究では、胎生真骨魚類であるカダヤシ目グーデア科に属するハイランドカープに着目した解析を進めきた。今年度までに、孵化した稚魚が母胎内で外敵から守られつつ「栄養リボン」を通じて母体から栄養獲得する本魚類の特徴を生かして、次世代シーケンサーを用いて栄養リボンのトランスクリプトーム解析を行っている。得られたRNA-seqデータをde novoアッセンブリーを行い、最も近縁でゲノム配列が高精度に整備されているグッピーをリファレンスにインフォマ解析を行った。栄養リボンの機能に迫る成果が得られているものの、インプリント遺伝子解析に必須の交配実験準備に時間を要している。

The origin of the virus is determined by the occurrence of the virus. The process of evolution is the evolution of the environment, and the evolution of the environment. This phenomenon is closely related to maternal and fetal development, mammalian and angiosperm development, and DNA control mechanisms. Evolutionary ecology: division of life, viviparous development, biological evolution, placenta, mammalian endosperm, biological species other than angiosperms. The process of birth and evolution of multiple taxa occurs independently of each other, including the understanding of multiple biological species. In this study, the analysis of fetal teleost was carried out. The characteristics of this fish, which are acquired through maternal rearing, are analyzed in this year's development, hatching, and juvenile fish. The RNA-seq sequence is de novo, de novo. The time required for mating preparation is required for the analysis of the mating vector.

项目成果

サカナは消化管から胎盤を作った？ ～グーデア科胎生魚で母子間物質運搬の仕組みを探る～

鱼的胎盘是由消化道产生的吗？