Development of biomarkers for lifestyle-related diseases by methylation analysis for SGA children based on the DOHaD theory

基于DOHaD理论对SGA儿童进行甲基化分析，开发生活方式相关疾病的生物标志物

• 批准号: 21K19751
• 负责人: 山澤 一樹
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: 独立行政法人国立病院機構(東京医療センター臨床研究センター)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-09 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19751/
• 关键词: DOHaD; 生活習慣病; SGA; メチル化; インプリンティング疾患; 先制医療

本研究は、Developmental Origins of Health and Disease(DOHaD)説に着目し、生活習慣病発症のat risk集団であるとされるSGA児(出生時の体格が身長、体重がともに在胎週数基準の10%未満の児)の頬粘膜DNAのメチル化レベルと、児のBMIや血圧等との関連を明らかにすることを目的とする。これに基づき、頬粘膜DNAを用いて生活習慣病発症のリスクを判定するバイオマーカーを探索し、リスクに応じた先制医療の実現を目指す挑戦的研究である。令和4年度までに、全国の研究参加施設から310例のSGA児をリクルートした。リクルート時に、両親および祖父母情報、妊娠分娩情報、新生児期情報、乳児期情報、 研究登録時の体重・身長・頭囲、血圧、GH投与量、各種ラボデータについて聴取した。 全症例から研究参加同意を書面で取得後、頬粘膜DNA採取スワブキットを用いて、試料を採取した。頬粘膜試料からゲノムDNAを抽出した後、バイサルファイト処 理を行い、引き続いてパイロシークエンス法によるメチル化解析を実施した。この結果、310例中6例(1.9%)にインプリンティング疾患を同定した。この結果から、 heterogenousな集団であるSGAの中にインプリンティング疾患が一定数含まれていることが明らかとなった。引き続き、DNAメチル化ビーズアレイ(Illumina社 Infinium MethylationEPIC Kit)によるゲノム全領域のCpGサイト85万箇所の網羅的なメチル化プロファイリングを実施中である。本解析により高スループットなメチル化解析が実施でき、全エピゲノム関連解析(Epigenome-wide association study: EWAS)が可能となる。

This study aims to clarify the relationship between Developmental Origins of Health and Disease(DOHaD), lifestyle and disease risk groups, buccal mucosa DNA, body length, body weight at birth, and fetal age. The DNA of the basal and buccal mucosa is used to determine the disease status of living habits, explore the development of advanced medical treatment, and conduct targeted research. In 2004, 310 cases of SGA were reported nationwide. Information on birth, maternal and grandparent information, pregnancy and delivery information, neonatal information, lactation information, body weight, height, blood pressure, GH dosage, and various types of information. All cases of study consent were obtained in writing, buccal mucosa DNA samples were taken After the extraction of the buccal mucosa sample, the treatment of the buccal mucosa sample was carried out, and the analysis of the buccal mucosa sample was carried out 6 of 310 cases (1.9%) were found to have the same disease. The result is a heterogeneous set of problems. DNA methylation kit (Illumina Inc. Infiniium MethylationEPIC Kit) is designed to cover 850,000 CpG sites in the entire field. This analysis is based on Epigenome-wide Association Study (EWAS).

项目成果

A novel pathogenic variant of the FH gene in a family with hereditary leiomyomatosis and renal cell carcinoma.

FH基因的新型致病变异在患有遗传性平滑肌瘤病和肾细胞癌的家族中。

• DOI: 10.1038/s41439-021-00180-8
• 发表时间: 2022-01-17
• 期刊: Human genome variation
• 影响因子: 1.5
• 作者: Yagi Y;Abeto N;Shiraishi J;Miyata C;Inoue S;Murakami H;Nakashima M;Sugano K;Ushiama M;Yoshida T;Yamazawa K
• 通讯作者: Yamazawa K

原因不明のSGA性低身長症140名における(epi)geneticな要因の解明

140 例原因不明的 SGA 身材矮小患者的（表观）遗传因素的阐明

• 发表时间: 2022
• 作者: 原香織;中村明枝;福家智子;井上毅信;川嶋明香;松原圭子;佐野伸一朗;山澤一樹;深見真紀;緒方勤;鏡雅代
• 通讯作者: 鏡雅代

当院におけるBRCA1 /2遺伝学的検査の現状と課題

我院BRCA1/2基因检测现状及问题

• 发表时间: 2021
• 作者: 井上聡美;安齋純子;安達将隆;大木慎也;笹岡綾子;中小路絢子;笹原真奈美;山下博;松井哲;松永達雄;山澤一樹
• 通讯作者: 山澤一樹

Frequency and clinical characteristics of distinct etiologies in patients with Silver-Russell syndrome diagnosed based on the Netchine-Harbison clinical scoring system

• DOI: 10.1038/s10038-022-01048-7
• 发表时间: 2022-05-24
• 期刊: JOURNAL OF HUMAN GENETICS
• 影响因子: 3.5
• 作者: Fuke, Tomoko;Nakamura, Akie;Kagami, Masayo
• 通讯作者: Kagami, Masayo

Pathogenic Copy Number and Sequence Variants in Children Born SGA With Short Stature Without Imprinting Disorders

• DOI: 10.1210/clinem/dgac319
• 发表时间: 2022-05-18
• 期刊: JOURNAL OF CLINICAL ENDOCRINOLOGY & METABOLISM
• 影响因子: 5.8
• 作者: Hara-Isono, Kaori;Nakamura, Akie;Kagami, Masayo
• 通讯作者: Kagami, Masayo