Simplifying complexity and diversity of circadian clocks
Simplifying complexity and diversity of circadian clocks
批准号:
22H04984
负责人:
秋山 修志
金额:
$122.3万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-27 至 2027-03-31
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英文摘要
野生型KaiC、単一リン酸化型KaiC変異体、現生型KaiCホモログ、祖先型KaiCを対象としたクライオ電子顕微鏡による単粒子解析およびX線結晶構造解析に着手した。野生型KaiC、単一リン酸化型KaiC変異体の溶液条件(緩衝液、濃度等)の最適化、グリッド凍結条件の検討により電子顕微鏡像を取得し、新規なKaiC六量体の構造多型を検出した。現生型KaiCホモログ、祖先型KaiCを対象とした広範囲の結晶化剤探索の末、新規な結晶化条件を見出した。KaiCに結合したヌクレオチドの種類を特定し、それらの量を正確に決定するための手法開発を行った。一連の改良により、各種ヌクレオチド(ADPやATPなど)の識別・検出感度が飛躍的に向上し、各種ヌクレオチドの寿命の温度依存性や、変異導入に伴う寿命変化を定量的に議論できるようになった。概日時計の同調機能とKaiCのATPase活性との関連を明らかにするため、温度刺激に対するATPase活性リズムの応答を調べた。ATPase活性リズムの高精度測定中に温度を急激に変化させる独自の技術を用いることで、KaiCのATPase活性が温度変化後、位相応答曲線と相関して直ちに変化することを発見した。一方、KaiCのリン酸化状態は温度変化後すぐには変化しないことから、ATPase活性の急激な変化が位相変化を引き起こす可能性を見出した。蛋白質ダイナミクスのより詳細な特徴づけを可能とする中性子準弾性散乱スペクトルの新しい解析法を検討した。また、今後の構造解析で重水素化KaiCを利用する可能性に鑑み、安定的な蛋白質重水素化法を確立した。これらの手法は今後の測定・解析の基盤となる。
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溶液のpHがシアノバクテリアの時計タンパク質KaiCのリン酸化リズムに与える影響
溶液pH值对蓝藻时钟蛋白KaiC磷酸化节律的影响
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[伊藤久美子, 尾上靖宏, 近藤孝男, 寺内一姫]
通讯作者:
寺内一姫
KaiCの2つのATP加水分解サイトを捉える構造解析
捕获 KaiC 的两个 ATP 水解位点的结构分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[古池美彦, 向山厚, 山下栄樹, 近藤孝男, 秋山修志, 古池美彦]
通讯作者:
古池美彦
シアノバクテリア概日時計のアロステリー機構
蓝藻生物钟的变构机制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[古池美彦, 向山厚, 山下栄樹, 近藤孝男, 秋山修志]
通讯作者:
秋山修志
概日時計システムに夜明けを告げる時計タンパク質の自律的な複合体解離
时钟蛋白的自主复杂解离预示着生物钟系统的黎明
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Chatake Toshiyuki, Tanaka Ichiro, Kusaka Katsuhiro, Fujiwara Satoru, 秋山修志]
通讯作者:
秋山修志
Exploring ancient origins of the circadian clock system through molecular evolution
通过分子进化探索生物钟系统的古代起源
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mukaiyama A, Furuike Y, Akiyama S]
通讯作者:
Akiyama S
共 24 条
月面閉鎖生態系の構築を目指した改変型シアノバクテリアの設計
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批准号:22K19279
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2022
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负责人:秋山 修志
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依托单位:
生物時計システムの周期と温度補償制御ロジックの構造化学的解明
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批准号:17H01422
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.29万
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财政年份:2017
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负责人:秋山 修志
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依托单位:
サブマイクロ秒時分割X線小角散乱による蛋白質の折り畳み運動の観察
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批准号:17770100
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2005
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负责人:秋山 修志
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依托单位:
高速液体混合技術を利用した蛋白質の折れ畳み初期過程の観察
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批准号:01J03435
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2001
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负责人:秋山 修志
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依托单位:
海外基金