Regulation of small RNA stability and gene expression in bacteria

细菌中小RNA稳定性和基因表达的调节

基本信息

  • 批准号:
    22K05378
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

本研究の目的は、細菌のsRNAによる新たな遺伝子発現調節機構を明らかにすることである。sRNA CsrB/CはRNA結合タンパク質に結合して機能を阻害するが、環境に応答して分解される。その結果、必要時に瞬時にRNA結合タンパク質が開放され、転写後の発現調節が効率的に行われる。しかし、そのメカニズムは明らかになっていない。キチン分解酵素と分解産物取り込みの遺伝子発現を連動的に制御するアンチセンス型sRNA ChiXは、一方から他方のmRNAに標的を切り替え、それには新たなメカニズムが予測された。これらsRNAが関与するRNA安定性制御と遺伝子発現機構のメカニズム解明とその利用のため、タンパク質結合型とアンチセンス型の2種類のsRNAについて研究を実施した。タンパク質結合型sRNAに関しては、CsrDホモログを有するグラム陰性細菌のAeromonas salmonicidaでcsr遺伝子欠損株を構築した。それらの表現型を確認したところ、特に運動性に影響があった。また、本菌由来のCsrDは大腸菌のCsrDの機能を補完できることを明らかにした。さらに、大腸菌sRNA CsrBのターミネーター直前の一本鎖領域との融合遺伝子を作製し、遺伝子の発現がCsrD依存となる系を構築し、解析を進めた。アンチセンス型sRNAに関しては、RNAシャペロンHfqが結合すると考えられるchiR mRNA 5′UTRの領域に変異を加え解析した結果、ヘアピン構造が遺伝子発現に影響を与えることが示唆された。chiP mRNA 5′UTRのsRNA ChiXとの塩基対形成領域の解析結果から、この領域が他の領域よりも多く存在していることが明らかとなり、さらなる解析を進めることとなった。
The aim of this study was to clarify the regulatory mechanism of gene expression in bacteria. sRNA CsrB/C is a functional inhibitor of RNA binding and environmental degradation. Results, if necessary, transient RNA binding, quality, and post-writing regulatory efficiency.しかし、そのメカニズムは明らかになっていない。The gene expression of the protein is linked to the production of the protein by the enzyme. The study of RNA stability control and gene development mechanism of two types of sRNA was carried out. A strain of Aeromonas salmonicida, a negative bacterium, was constructed from a plasmid containing sRNA. The phenotype was confirmed, and the movement was affected. The origin of CsrD and the function of CsrD in Escherichia coli are complete. In addition, the development of E. coli sRNA CsrB is a key to the construction and analysis of CsrD dependent systems. The results of analysis of chiR mRNA 5′UTR domain differences show that there is a significant difference in the expression of chiR mRNA. ChiP mRNA 5′UTR sRNA ChiX gene analysis results in the formation of domain, domain and other domains exist in many ways, and the analysis results are as follows:

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Serratia plymuthicaにおけるキチン分解利用系に及ぼすRNAシャペロンHfqの影響
RNA伴侣Hfq对普城沙雷菌几丁质降解利用系统的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    石田知輝;小嶋優常;樋口響;高橋柚衣;劉思廷;杉本華幸;鈴木一史
  • 通讯作者:
    鈴木一史
Serratia plymuthicaのキチン分解酵素系とその発現制御機構
普城沙雷氏菌几丁质分解酶系统及其表达调控机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鈴木一史;Iuliia PENTEKHINA;石田知輝;樋口響;杉本華幸
  • 通讯作者:
    杉本華幸
新潟大学農学部 応用微生物学研究室ホームページ
新泻大学农学院应用微生物实验室主页
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

鈴木 一史其他文献

循環器領域におけるスペクトラルCTの臨床的有用性 GE社・キヤノン社Dual-energy CTの使用経験より
能谱CT在心血管领域的临床应用——基于GE和佳能双能CT的使用经验
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    森田 賢;遠藤 健二;鈴木 一史;山本 敬洋;鴨志田 久美;山崎 宙士;坂井 修二;藤井 柊平;森下 健史;丸山 竜平;大谷 淳;正宗 賢;町田治彦
  • 通讯作者:
    町田治彦
日本再生医療学会総会「中高生のためのセッション」の狙い
日本再生医学会总会“中学生会议”的目的
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    川上雅弘;鈴木 一史;石原 研治
  • 通讯作者:
    石原 研治
造影CT検査の読影に役立つポイント -全身の最先端イメージング 胸痛を中心に-
解读增强 CT 检查的要点 - 以胸痛为中心的全身尖端成像 -
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    森田 賢;鈴木 一史;坂井 修二;町田治彦;田中 陽也;町田治彦
  • 通讯作者:
    町田治彦
Small RNA ChiX による 2 種の標的 mRNA の発現制御機構
小 RNA ChiX 调节两个靶标 mRNA 的表达
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    南 晴香;鈴木 一史;佐々木 直美;山岸 拓矢;杉本 華幸;渡邉 剛志
  • 通讯作者:
    渡邉 剛志
Highly Active Anti-Retroviral Therapy (HAART) 併用下で Hyper-CVAD 療法が著効したAIDS関連 Burkitt リンパ腫
采用 Hyper-CVAD 疗法联合高效抗逆转录病毒疗法 (HAART) 治疗艾滋病相关的伯基特淋巴瘤
  • DOI:
    10.11406/rinketsu.51.207
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    鈴木 一史;仲里 朝周;眞田 幸尚;三原 愛;立川 夏夫;倉井 華子;吉村 幸浩;林 宏行;吉田 幸子;柿本 綱之
  • 通讯作者:
    柿本 綱之

鈴木 一史的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('鈴木 一史', 18)}}的其他基金

国語科教育における学習者の音声言語の分析と学習指導の開発
日语教育中学习者口语分析与学习指导的开展
  • 批准号:
    24K06019
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Planning and design of pedestrian crossing facilities at basic road sections improving the yielding behavior of drivers
基本路段人行横道设施规划设计改善驾驶员让行行为
  • 批准号:
    21K04295
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
教科書コーパスを用いた言語活動を引き起こす教材開発と授業プログラム
使用教科书语料库开发激发语言活动的教材和课堂计划
  • 批准号:
    23908019
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
大規模均衡日本語コーパスの活用による効果的授業プログラムの開発
使用大规模平衡日语语料库开发有效的教学计划
  • 批准号:
    19902012
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
音声言語教育におけるAV機器使用に伴う学習活動の多様化とその評価方法の開発
口语教育中与AV设备的使用相关的学习活动的多样化和评价方法的开发
  • 批准号:
    15902007
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
回転同値類による形状特徴量を利用した3次元物体モデルの検索
使用旋转等价类使用形状特征搜索 3D 对象模型
  • 批准号:
    15700115
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
セラチア・マルセッセンスのキチン分解利用機構及び新規キチン結合蛋白質に関する研究
粘质沙雷氏菌几丁质降解利用机制及新型几丁质结合蛋白研究
  • 批准号:
    98J08460
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
唾液腺疾患,特にシェーグレン症候群を中心とした唾液腺シンチの改良と定量化の研究
改善和量化唾液腺闪烁扫描的研究,重点关注唾液腺疾病,特别是干燥综合征
  • 批准号:
    01771709
  • 财政年份:
    1989
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

骨芽細胞核におけるRunx2-Lamin Aの遺伝子発現制御機構の解明
成骨细胞核中 Runx2-Lamin A 基因表达控制机制的阐明
  • 批准号:
    24K12878
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
立体的ヒストンコードによる新たな遺伝子発現制御機構
基于空间组蛋白密码的新型基因表达控制机制
  • 批准号:
    24K02227
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
マラリア原虫のRNA結合性の転写因子PREBPによる高次ゲノム構造を介した遺伝子発現制御
疟疾寄生虫的 RNA 结合转录因子 PREBP 通过高阶基因组结构调节基因表达
  • 批准号:
    24K10197
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
酸性土壌への適応進化から読み解くアルミニウム耐性の遺伝子発現制御ネットワーク
从适应酸性土壤的进化中破译耐铝基因表达调控网络
  • 批准号:
    23K23494
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
イントロンの改変による遺伝子発現制御系の確立と糖尿病関連遺伝子機能解析への応用
修饰内含子建立基因表达调控系统及其在糖尿病相关基因功能分析中的应用
  • 批准号:
    23K21286
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
シグナル依存的な遺伝子発現制御機構の特異性と多様性を担う長鎖ncRNAの同定
鉴定负责信号依赖性基因表达控制机制的特异性和多样性的长链 ncRNA
  • 批准号:
    24K10283
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ウマヘルペスウイルス1型感染神経細胞におけるウイルス遺伝子発現制御機構の解明
阐明马疱疹病毒1型感染神经元中病毒基因表达的调控机制
  • 批准号:
    23K23773
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
嗅上皮オルガノイドを用いた嗅受容体遺伝子発現制御機構の解明
利用嗅上皮类器官阐明嗅觉受体基因表达的调控机制
  • 批准号:
    23K27180
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
疾患機序解明に向けた時系列多因子摂動データを用いた遺伝子発現制御ネットワーク解析
使用时间序列多因素扰动数据进行基因表达控制网络分析以阐明疾病机制
  • 批准号:
    24K18099
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
PIMキナーゼのタイプ特異的な遺伝子発現制御によるHIV粒子産生抑制機構の解析
PIM激酶类型特异性基因表达调控抑制HIV颗粒产生的机制分析
  • 批准号:
    24K11655
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了