Functional analysis of skin microbiome of fish

鱼类皮肤微生物群的功能分析

• 批准号: 22K05792
• 负责人: 竹内 美緒
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05792/
• 关键词: 魚類体表; 微生物; 付着; 粘液; 魚類微生物; メタゲノム; 体表

本研究では、メタゲノム解析により魚類体表細菌の機能的特徴を推定すると共に、魚類体表への細菌の定着性に関する機能について、飼育実験による評価を予定している。実験の都合により、後半に計画していた内容を前半に実施することになった。22年度は、魚類体表微生物の魚類体表への定着性の評価を実施した。アユの体表粘液から体表常在菌の培養を行なった。数種類の魚類体表細菌を選択し、定着性に関する飼育実験を行なった。魚類体表細菌をアユ稚魚の水槽に添加した。止水にして24時間菌株に暴露した。その後、水替えののち流水飼育を再開、一定期間ののちに魚から体表粘液を取得した。体表粘液からDNAを抽出し、リアルタイムPCRや16S rRNA遺伝子を対象にしたアンプリコン解析を実施した。その結果、菌株Aにおいては、暴露終了後2日後には体表粘液中の微生物叢の17%を占めていた。暴露終了後6日後には全体の２％と減少していたが、体表粘液中に残存していることが確認された。一方で菌株Bにおいては、2日後には0.02%、 6日後には0.2%であり、検出されたものの存在量は少なかった。以上より、魚類体表への定着性の高い株と低い株を得ることができた。今後はこれらについて詳細なゲノム解析を進めていく予定である。またこれらの菌株については魚類への毒性は確認されなかった。近年、魚類体表細菌叢コントロールによる魚類の健康管理技術開発が注目されているが、本研究成果はそのために重要な基礎知見を与えるものになる。

In this study, we analyze the characteristics of bacteria on the surface of fish and estimate the functions of bacteria on the surface of fish. The fixed properties of bacteria on the surface of the body, the functions of the bacteria, and the breeding of bacteria are determined.実験の都合により, the second half of the plan and the content of the first half of the plan. In 2022, a review on the specificity of microorganisms on fish body surfaces and their persistence on fish body surfaces was conducted.アユのBody surface mucus からBody surface is often cultured by bacteria を行なった. Several types of fish surface bacteria are selected and fixed. Bacteria on the surface of fish are added to the water tank of juvenile fish. Shisui に し て 24 time strain に し た. After that, the water replacement and running water breeding were restarted, and the mucus on the body surface of the fish was obtained for a certain period of time. Extraction of DNA from body surface mucus and analysis of 16S rRNA DNA by PCR. As a result, 17% of the microbial flora in the body surface mucus of the strain A was detected 2 days after the end of exposure. Six days after the end of the exposure, a 2% reduction in the total body temperature was confirmed, and the remaining amount in the body surface mucus was confirmed. One strain B is a strain B, a 0.02% strain of a 2-day strain, a 0.2% strain of a 6-day strain, and a strain of a 検出 されたもののは小なかった. The above-mentioned より, fish body surface へのfixed high い strain and low い strain をget る こ と が で き た. From now on, the details of the future analysis will be determined.またこれらの strain については fish へのtoxicity は confirmed されなかった. In recent years, attention has been paid to the development of fish health management technology based on bacteria on the surface of fish. This research result is based on the important basic knowledge and knowledge of this research.

项目成果

体表細菌叢コントロールによる魚類における細菌感染症の抑制技術

通过控制体表菌群抑制鱼类细菌感染的技术

• 发表时间: 2023

バイオコントロールによる冷水病予防の検証

通过生物防治验证冷水疾病预防

• 发表时间: 2023
• 作者: 辻尾匠;永田恵里奈;竹内美緒
• 通讯作者: 竹内美緒