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始原生殖細胞がembryonal carcinoma細胞へと転換する分子機構

原始生殖细胞转化为胚胎癌细胞的分子机制

基本信息

批准号：
22K06040
负责人：
鈴木敦
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Yokohama National University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

2022年度においては、EC細胞の新規マーカーとして同定したCAR4を指標として、CAR4陽性細胞をセルソーターによって回収したのちに、naive ES細胞培地である2i/LIFとprimed EpiLC培地であるAF培地で培養し、コロニーの数を比較した。その結果、AF培地で培養した方が、2i/LIF培地で培養した場合より優位にコロニー数が多く、CAR4陽性のEC細胞はprime型の多能性細胞であることが示唆された。一方で、CAR4の発現を誘導する転写因子を探索するために、CAR4を発現する前の細胞集団を同定することを試みた。そのために、single cell RNA-seqのデータを用いてvelocity解析を行ったところ、CAR4陽性細胞集団へと分化が向かう細胞集団を見出すことができなかった。そこで、single cell ATAC-seqにより、クロマチン状態の解析を行うと、始原生殖細胞からCAR4陽性のEC細胞への遷移状態にある細胞集団を特定することができた。これの意味するところは、EC細胞への転換に際して、クロマチン状態は徐々に変化するが、トランスクリプトームはある段階に達すると急激に変化するということだと考えられる。そこで、このデータをsingle cell RNA-seqのデータと統合することで、EC細胞への遷移状態の細胞集団において高発現する転写因子を4つ同定することができた。

In the year of 2022, the new regulations of EC and EC cells are the same as those of CAR4, CAR4, naive ES, 2i/LIF, primed EpiLC, AF, AF, and so on. The results were as follows: the results of AF culture, the prescription of 2i/LIF culture, the number of cells in the same position of 2i/LIF, and the number of primetype pluripotent cells of CAR4. On the one hand, the CAR4 system will guide you to explore the data collection, and the CAR4 will show that the cell set will be the same as the previous one. In this paper, we use the velocity to analyze the data, and then use the velocity to analyze the data, and then use the velocity to analyze the data from the CAR4 cell set to the cell set. The original reproductive cell, CAR4, sexual EC cell, mobile cell, cell set, specific cell, primary reproductive cell, primary reproductive cell. It means that the situation is different, that is, the EC cell is in a state of emergency, that is, the state of the situation, the situation. The data collection, data collection, and writing factor 4 are the same as those of the single cell RNA-seq data, which is the same as that of the EC.