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人工知能を有する自動回折データ収集システムの開発

人工智能自动衍射数据采集系统的开发

基本信息

批准号：
22K06107
负责人：
平田邦生
金额：
$ 2.08万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06107/
关键词：
機械学習結晶学タンパク質結晶構造解析

项目摘要

研究の目的はタンパク質結晶の自動測定へ即時フィードバックが可能な回折強度データのクオリティ判定を実施する人工知能の開発である。システムは自動測定により得られた大量のデータを即時解析し、できるだけ早い段階でのデータクオリティの定量的評価を目指している。このため、まず教師あり機械学習を実施し、指標となりうるデータ評価ポイントの選定を実施する予定であった。今年度は、研究実施計画書にある通り、教師ありの機械学習のために、標準試料結晶であるソーマチン、サーモライシン、計画書に無かったがトリプシンの回折データを大量に収集し、データ処理を実施した。結果として、機械学習に進む前段階にデータをフィルタリングすることの有用性に予期せず気づくことができた。具体的には２点ある。１点目は「明らかに低品質なデータの混在」をフィルタリングすることである。より信頼度の高い機械学習のモデルパラメータを得るためには、できるだけ他のアノーマルデータを排除したほうが良い。この観点から実際に得られたデータの中で分解能が著しく低いデータについては早い段階で検討から除外することが望ましい。当初想定していなかったことだが、このフィルタリングの成績も実験へのフィードバックに非常に有用なステップであることが判明した。２点目はより詳細なフィルタリングとなるが、構造多型に関連するものである。タンパク質結晶は同じもののように見えても含まれる分子の構造が微妙に異なる場合があり、それらは多くの場合軽視され、特に自動測定では気づけ無いことがよくある。今年度、自動データ処理システムを利用した階層的クラスタリング（特に強度のCCを利用するもの）を利用すれば構造の微小な違いを分類することができることを見出し、それについて現在論文化を進めている。

The purpose of this study is to develop artificial knowledge for the automatic determination of crystal quality and the real-time determination of possible bending strength. The system automatically determines whether a large number of data items are analyzed in real time, whether they are in the early stages, or whether they are evaluated quantitatively. This is the first time a teacher has chosen to study mechanically. This year, a large number of data from research implementation plans, mechanical learning for teachers, crystallization of standard test materials, support for equipment, and plans have been collected and data processing has been implemented. The results show that the machine learning is very useful. The specific point is 2:00. 1."Bright and low quality" The high degree of reliability of mechanical learning and the high degree of reliability of mechanical learning. This is the first time I've ever seen a woman who's been in the middle of something. At the beginning, I wanted to determine the results of the survey. 2. The structure of polytype is related to the structure of polytype. The structure of the molecule is subtle and different, and it is automatically determined. This year, the automatic processing system uses the hierarchical classification system (special intensity CC utilization) to construct the micro violation classification system.