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The molecular basis of gene expression regulation by a super-long range cis-regulatory element

超长程顺式调控元件基因表达调控的分子基础

基本信息

批准号：
22K06426
负责人：
岩田哲郎
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

ClassⅠタイプ嗅覚受容体は、動物の進化の過程ですべての遺伝子が染色体上の1カ所に留まり、長大な遺伝子クラスターを形成している。これまでの研究により、この遺伝子クラスターを制御するエンハンサーであるJ-elementは、「制御する遺伝子数」と「ゲノム上の作用範囲」の2点において他に類を見ない規模で遺伝子発現を制御していることが明らかになった。本研究では、このエンハンサー中の特徴的な配列や、ClassⅠ嗅覚受容体遺伝子クラスターのゲノム構造に着目し、“超”長距離発現制御を可能にする分子基盤の解明を目的とする。J-elementにおいて新たに見出されたコンセンサスモチーフの機能を明らかにするためノックアウトマウスを作出した。網羅的遺伝子発現解析をおこなったところ、ClassⅠ遺伝子の一部で発現変化が認められたため現在詳しく解析を進めている。また、ClassⅠ発現嗅神経細胞をFACSにより分取し、網羅的オープンクロマチン（ATAC-sequencing）解析を実施した。また、ClassⅠ遺伝子クラスターのシンテニーに着目し、本研究では最近作出に成功した嗅神経細胞特異的または神経前駆細胞特異的にCreを発現させることができる２つの系統を用いて、ClassⅠ遺伝子クラスターの中央部に保存されるβグロビン遺伝子クラスターのコンディショナルノックアウトマウスを作出した。しかし、いずれのマウスでもClassⅠ遺伝子発現への影響は認められなかったことから、βグロビン遺伝子クラスターの存在はClassⅠ遺伝子発現に影響しないことが明らかとなった。

ClassⅠタイプolfactory receptor は, animal evolution process ですべての伝子がchromosome の1カにstay まり, grown up な伝子クラスターを formation している.これまでの Research により, この缝子クラスターをcontrol するエンハンサーであるJ-elementは, 「control する缝子Number"と「ゲノム上の Effect Fan囲」の2点においてhisにkindを见なThe size of the scale is the same as the size of the scale. In this study, the special configuration of the では, このエンハンサー, and the Class Ⅰ olfactory receptor residue クラスタThe purpose of "super" long-distance control is the possibility of "super" long-distance control and the purpose of explaining the molecular basis. J-elementにおいて新たに见出されたコンセンサスモチーフの function を明らかにするためノックアウトマウスを为した. The remaining parts of the net are now analyzed and analyzed.また, Class I olfactory nerve cell をFACS により extraction, and net オープンクロマチン (ATAC-sequencing) analysis を実时した.また、ClassⅠ伝子クラスターのシンテニーに出目し、This research was recently madeにSuccessしたOlfaction God 経 cell-specific または神経前槆 cell-specific にCre 発appear させることができる２つの System を Use いて, Class Ⅰ 伝子クラスターのcentral part に Save されるβグロビン缝子クラスターのコンディショナルノックアウトマウスをした.しかし、いずれのマウスでもClassⅠ伝子発appearsへのeffectはcognizeめられなかったことから、βグロビン缝子クラスターのexistent はClassⅠ伝子発appears にeffect しないことが明らかとなった.