HTLV-1感染細胞を腫瘍化に導く宿主クロマチン環境の解明

阐明导致 HTLV-1 感染的细胞发生肿瘤的宿主染色质环境

• 批准号: 22K07091
• 负责人: 三浦 未知
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kawasaki Medical School
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07091/
• 关键词: RNA FISH; マルチプレックス; インフルエンザウイルス; RNA核外輸送; heterogeneity; HTLV-1; ATL; クロマチン; 蛍光イメージング

研究計画1年目である2022年度は、固定した細胞内のRNAを多重に蛍光染色して多種類のRNA分子を一度に同一細胞で検出する実験系の立ち上げを行った。この実験系を、まずは細胞質が広く観察できる肺がん由来の接着細胞を用いて、インフルエンザウイルスを感染させ、転写されたウイルスmRNAの検出を試みることでテストした。この実験系による検出の結果は、ground truthとしている従来の単一蛍光染色によるsmFISHの結果とよく一致し、今回立ち上げた実験系の正確性を確認することができた。なおspin-offの成果として、ここで行ったインフルエンザウイルスmRNAの検出に基づいて、ウイルスmRNAの細胞内分布のばらつきからmRNAの核外輸送速度を推定する理論モデルを着想して発表した(Miura et al. 2023. bioRxiv 2023.04.07.536075)(eLifeに掲載予定)。

In 2022, the RNA in the cells was detected by multiplex fluorescent staining, and multiple RNA molecules were detected in the same cells. This is the first time that we've ever seen a cell that's been infected with a virus, or that's been infected with a virus. The results of this investigation are consistent with the ground truth and the validity of this investigation is confirmed. The results of spin-off analysis and the theoretical basis for mRNA detection and distribution in cells and the estimation of mRNA extranuclear transport velocity were presented (Miura et al. 2023. bioRxiv 2023.04.07.536075)(specified in eLife).

项目成果

A statistical framework for quantifying the nuclear export rate of influenza viral mRNAs

量化流感病毒 mRNA 核输出率的统计框架

• DOI: 10.1101/2023.04.07.536075
• 发表时间: 2023
• 期刊: bioRxiv
• 作者: Michi Miura;Naho Kiuchi;Siu-Ying Lau;Bobo Wing-Yee Mok;Hiroshi Ushirogawa;Tadasuke Naito;Honglin Chen;Mineki Saito
• 通讯作者: Mineki Saito