マルチオミクス単一細胞解析を用いた白血病進展機構の解明
マルチオミクス単一細胞解析を用いた白血病進展機構の解明
批准号:
22K08451
负责人:
中川 正宏
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
中文摘要
我々の開発した、プロテアーゼ処理によりゲノムDNAを効率良く利用することで高感度にドライバー変異を遺伝子発現と同時に解析可能なマルチオミクス単一細胞解析技術を用いて、血液疾患を有さない高齢者のクローン性造血について解析を行った。クローン性造血を有さない高齢者の造血幹前駆細胞の解析では、加齢に伴い炎症性サイトカインに対する反応が亢進しており、高齢者の骨髄は、より若年者の骨髄と比較して、炎症環境下にあることが明らかとなった。同一症例内でのドライバー変異を有する細胞と有しない細胞との比較では、変異細胞は細胞増殖に関わる遺伝子発現が亢進しており、クローン拡大に合致する所見であった。重要なことに、変異細胞では炎症サイトカインに対する反応性の低下が見られ、炎症環境下により適合した特性を有すると考えられた。これらの結果は変異細胞のクローン選択には炎症が重要であることを示唆するものであり、クローン性造血を有する症例の骨髄環境は有しない症例と比較して高炎症の環境にあると考え、クローン性造血陽性症例の変異を有さない野生型細胞を、クローン性造血陰性の野生型細胞と比較した。特にTET2変異を有する高齢者の野生型細胞の造血幹細胞が濃縮された分画で、変異を有さない同年齢帯の対象症例の細胞と比較し、インターフェロン反応と細胞増殖に関する遺伝子群の発現が亢進しており、骨髄環境に異常が生じていることが明らかとなった。現在詳細の解析を継続している。
英文摘要
我々の開発した、プロテアーゼ処理によりゲノムDNAを効率良く利用することで高感度にドライバー変異を遺伝子発現と同時に解析可能なマルチオミクス単一細胞解析技術を用いて、血液疾患を有さない高齢者のクローン性造血について解析を行った。クローン性造血を有さない高齢者の造血幹前駆細胞の解析では、加齢に伴い炎症性サイトカインに対する反応が亢進しており、高齢者の骨髄は、より若年者の骨髄と比較して、炎症環境下にあることが明らかとなった。同一症例内でのドライバー変異を有する細胞と有しない細胞との比較では、変異細胞は細胞増殖に関わる遺伝子発現が亢進しており、クローン拡大に合致する所見であった。重要なことに、変異細胞では炎症サイトカインに対する反応性の低下が見られ、炎症環境下により適合した特性を有すると考えられた。これらの結果は変異細胞のクローン選択には炎症が重要であることを示唆するものであり、クローン性造血を有する症例の骨髄環境は有しない症例と比較して高炎症の環境にあると考え、クローン性造血陽性症例の変異を有さない野生型細胞を、クローン性造血陰性の野生型細胞と比較した。特にTET2変異を有する高齢者の野生型細胞の造血幹細胞が濃縮された分画で、変異を有さない同年齢帯の対象症例の細胞と比較し、インターフェロン反応と細胞増殖に関する遺伝子群の発現が亢進しており、骨髄環境に異常が生じていることが明らかとなった。現在詳細の解析を継続している。
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会议论文
Distinct pathogenesis of clonal hematopoiesis revealed by single-cell multi-omics sequencing.
单细胞多组学测序揭示克隆造血的独特发病机制。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masahiro M Nakagawa, Ryosaku Inagaki, Yutaka Kuroda, Yasuhito Nannya, Ryunosuke Saiki, Yotaro Ochi, June Takeda, Zhao Lanying, Xingxing Qi, Akinori Yoda, Ayana Kon, Nobuyuki Kakiuchi, Hideki Makishima, Shuichi Matsuda and Seishi Ogawa]
通讯作者:
Shuichi Matsuda and Seishi Ogawa
Distinct Pathogenesis of Clonal Hematopoiesis Revealed By Single Cell RNA Sequencing Integrated with Highly Sensitive Genotyping Method
单细胞RNA测序结合高灵敏基因分型方法揭示克隆造血的独特发病机制
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masahiro Marshall Nakagawa, Hideki Makishima et al.]
通讯作者:
Hideki Makishima et al.
血液細胞でのRunx1/AML1による転写制御ネットワークの解明
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批准号:18890057
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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资助金额:$1.69万
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财政年份:2006
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负责人:中川 正宏
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依托单位:
国内基金
海外基金
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急性早幼粒细胞白血病中的NRAS突变通过白介素-8通路介导炎症因子风暴的机制研究
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批准号:82200155
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2022
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负责人:林小晶
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依托单位:
铁过载调控白血病相关巨噬细胞极化影响白血病进展的作用及机制研究
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批准号:82000160
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2020
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负责人:杨斐斐
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依托单位:
树突状细胞中IRF7在白血病微环境形成及白血病进展中的作用机制研究
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批准号:81970155
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项目类别:面上项目
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资助金额:55.0万元
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批准年份:2019
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负责人:郑国光
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依托单位:
BLV下行感染对奶牛乳腺局部天然免疫功能的影响及作用途径
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批准号:31972747
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项目类别:面上项目
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资助金额:59.0万元
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批准年份:2019
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负责人:武瑞
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依托单位:
转座子LINE1激活在衰老相关疾病CMML发生中的作用及机制研究
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批准号:81871116
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项目类别:面上项目
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资助金额:56.0万元
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批准年份:2018
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负责人:王莹
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依托单位:
AID加速BCR-ABL1阳性急性B淋巴细胞白血病进展的机制研究
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批准号:81801581
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:22.0万元
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批准年份:2018
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负责人:董艳迎
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依托单位:
PAX5突变诱导B细胞急淋非T细胞炎症性免疫逃逸?
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批准号:81770164
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.0万元
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批准年份:2017
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负责人:黄伟
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依托单位:
NF-κB介导的炎症调控通路在苦参碱抗白血病作用中的分子机制研究
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批准号:81673644
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项目类别:面上项目
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资助金额:57.0万元
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批准年份:2016
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负责人:马玲娣
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依托单位:
冬凌草甲素诱导TLR4-NLRP3炎症小体-自噬途径吞噬清除白血病细胞凋亡小体调控机制研究
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批准号:81502467
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:18.0万元
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批准年份:2015
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负责人:臧凌鹤
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依托单位:
白血病相关非感染性炎症反应在白血病微环境形成中的作用机制研究
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批准号:81570153
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2015
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负责人:郑国光
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依托单位: