マルチオミクス単一細胞解析を用いた白血病進展機構の解明

使用多组学单细胞分析阐明白血病进展机制

• 批准号: 22K08451
• 负责人: 中川 正宏
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08451/
• 关键词: クローン選択; 炎症; 白血病; クローン性造血; 単一細胞解析; 骨髄異形成症候群; クローン造血

我々の開発した、プロテアーゼ処理によりゲノムDNAを効率良く利用することで高感度にドライバー変異を遺伝子発現と同時に解析可能なマルチオミクス単一細胞解析技術を用いて、血液疾患を有さない高齢者のクローン性造血について解析を行った。クローン性造血を有さない高齢者の造血幹前駆細胞の解析では、加齢に伴い炎症性サイトカインに対する反応が亢進しており、高齢者の骨髄は、より若年者の骨髄と比較して、炎症環境下にあることが明らかとなった。同一症例内でのドライバー変異を有する細胞と有しない細胞との比較では、変異細胞は細胞増殖に関わる遺伝子発現が亢進しており、クローン拡大に合致する所見であった。重要なことに、変異細胞では炎症サイトカインに対する反応性の低下が見られ、炎症環境下により適合した特性を有すると考えられた。これらの結果は変異細胞のクローン選択には炎症が重要であることを示唆するものであり、クローン性造血を有する症例の骨髄環境は有しない症例と比較して高炎症の環境にあると考え、クローン性造血陽性症例の変異を有さない野生型細胞を、クローン性造血陰性の野生型細胞と比較した。特にTET2変異を有する高齢者の野生型細胞の造血幹細胞が濃縮された分画で、変異を有さない同年齢帯の対象症例の細胞と比較し、インターフェロン反応と細胞増殖に関する遺伝子群の発現が亢進しており、骨髄環境に異常が生じていることが明らかとなった。現在詳細の解析を継続している。

I 々 の open 発 し た, プ ロ テ ア ー ゼ 処 Richard に よ り ゲ ノ ム DNA を sharper rate good く using す る こ と で Gao Gan degrees に ド ラ イ バ ー - traces of different を 伝 son 発 now と に analytical at the same time may な マ ル チ オ ミ ク ス 単 a cell を parsing technology using い て, blood disorders を さ な い high 齢 の ク ロ ー ン sex hematopoietic に つ い analytical line を っ て た. ク ロ ー ン sex hematopoietic を have さ な い high 齢 の 駆 before hematopoietic stem cells の analytic で は, 齢 に with い inflammatory サ イ ト カ イ ン に す seaborne る anti 応 が hyperthyroidism し て お り, high 齢 の bone marrow は, よ り if years の bone marrow と compare し て, inflammation environment に あ る こ と が Ming ら か と な っ た. Within the same cases で の ド ラ イ バ ー - different を have す る cells と し な い cells と の is で は, - different cells は rights colonization に masato わ る heritage 伝 son 発 now が hyperthyroidism し て お り, ク ロ ー ン company に close to す る seen で あ っ た. Important な こ と に, - different cell で は inflammation サ イ ト カ イ ン に す seaborne る anti 応 low sexual の が see ら れ, inflammation environment に よ り suitable し た features を have す る と exam え ら れ た. こ れ ら の results は - idioblasts の ク ロ ー ン sentaku に は inflammation が important で あ る こ と を in stopping す る も の で あ り, ク ロ ー ン sex hematopoietic を have す る cases の は bone marrow environment with し な い cases と compare し て high inflammation の environment に あ る と え test, ク ロ ー ン sex hematopoietic positive cases の - different を have さ な い を wild-type cells, ク ロ ー ン hematopoietic negative の Wild-type cells と are more apoptotic た. Special に TET2 - different を have す る high 齢 の wild-type の hematopoietic stem cell が enrichment さ れ た points draw で, - different を さ な い in the same year 齢 帯 の cases like a seaborne の cells と し, イ ン タ ー フ ェ ロ ン anti 応 と cells raised colonization に masato す る heritage 伝 subgroup の 発 now が hyperthyroidism し て お り, abnormal bone marrow environment に が じ て い る こ と が Ming ら か と な っ た. Now let 's a detailed analysis of を継続 て て る る.

项目成果

Distinct pathogenesis of clonal hematopoiesis revealed by single-cell multi-omics sequencing.

单细胞多组学测序揭示克隆造血的独特发病机制。

• 发表时间: 2022
• 作者: Masahiro M Nakagawa;Ryosaku Inagaki;Yutaka Kuroda;Yasuhito Nannya;Ryunosuke Saiki;Yotaro Ochi;June Takeda;Zhao Lanying;Xingxing Qi;Akinori Yoda;Ayana Kon;Nobuyuki Kakiuchi;Hideki Makishima;Shuichi Matsuda and Seishi Ogawa
• 通讯作者: Shuichi Matsuda and Seishi Ogawa

Distinct Pathogenesis of Clonal Hematopoiesis Revealed By Single Cell RNA Sequencing Integrated with Highly Sensitive Genotyping Method

单细胞RNA测序结合高灵敏基因分型方法揭示克隆造血的独特发病机制

• 发表时间: 2020
• 作者: Masahiro Marshall Nakagawa;Hideki Makishima et al.
• 通讯作者: Hideki Makishima et al.