Development of a novel histopathological examination method for castration-resistant prostate cancer focusing on neutral theory of molecular evolution

以分子进化中性理论为重点,开发去势抵抗性前列腺癌的新型组织病理学检查方法

基本信息

  • 批准号:
    22K09444
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

本年度は、アンドロゲン受容体依存性ヒト前立腺がんLNCaP細胞から樹立した、アンドロゲン受容体依存性が異なる3つのサブクローンE9, F10, G4を用いて、Agilent社SureSelect Human All Exon V6 (60.5Mb) kitによるエクソーム解析を実施した。次世代シークエンス解析結果については、2種類の代表的なパイプライン(GATKおよびFreebayes)による精度の高い変異検出を行った(ダブルパイプライン解析)。さらに、タンパク質にインパクトを与える変異と、アレル頻度情報による変異の絞り込みを行った。今回、我々は前立腺がん細胞にアンドロゲン受容体依存性の差異を生み出すパッセンジャー遺伝子変異を同定することを目的としているため、遺伝子の抽出には”androgen receptor (AR)”をキーワードに、かつ親株であるLNCaPには変異が見られないものの、E9, F10, G4のいずれかに変異が認められる遺伝子を抽出することとした。これらの条件で解析した結果、E9もしくはG4に特異的な変異が認められる遺伝子は皆無であったものの、F10に特異的な、一塩基変異Single Nucleotide Variant (SNV)が認められる遺伝子が4つ抽出された。今回、我々はエクソーム解析を施行し、アンドロゲン受容体低依存性のサブクローンF10に特異的な一塩基変異を有する遺伝子4つを抽出することに成功した。これらの遺伝子が正常に働かないために、F10がアンドロゲン受容体低依存性である可能性が考えられる。次年度は、これら4つの遺伝子が前立腺がん細胞のアンドロゲン受容体依存性を規定する鍵分子であることを検証する。
This year, SureSelect Human All Exon V6 (60.5Mb) kit

项目成果

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会议论文数量(0)
专利数量(0)
Drug Repositioning of the Phenylpiperazine Derivative Naftopidil in Prostate Cancer Treatment
苯基哌嗪衍生物萘哌地尔在前列腺癌治疗中的药物重新定位
  • DOI:
    10.1007/978-981-16-9232-1_8
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ishii Kenichiro;Sugimura Yoshiki;Watanabe Masatoshi
  • 通讯作者:
    Watanabe Masatoshi
Fibroblast-derived miRNA regulates NKX3-1 expression in prostate cancer cells having androgen receptor dependency
成纤维细胞来源的 miRNA 调节具有雄激素受体依赖性的前列腺癌细胞中 NKX3-1 的表达
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Chise Matsuda;Kenichiro Ishii;Yasuhisa Nakagawa;Taku Shirai;Yoshifumi Hirokawa;Kazuhiro Iguchi;Masatoshi Watanabe
  • 通讯作者:
    Masatoshi Watanabe
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
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  • 影响因子:
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    堀 靖英;石井 健一朗;神田 英輝;西川 晃平;吉尾 裕子;曽我 倫久人;木瀬 英明;有馬 公伸;杉村 芳樹;宮田康好,神田 滋,Peter A. Greer,酒井英樹;宮田康好,渡邉慎一,松尾朋博,林 徳真吉,J im W. Xuan,Peter A. Greer,神 田 滋,金武 洋,酒井英樹
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    $ 2.66万
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    2011
  • 资助金额:
    $ 2.66万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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  • 批准号:
    19590384
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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