Development of a novel histopathological examination method for castration-resistant prostate cancer focusing on neutral theory of molecular evolution

以分子进化中性理论为重点，开发去势抵抗性前列腺癌的新型组织病理学检查方法

基本信息

批准号：
22K09444
负责人：
石井健一朗
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Mie University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

本年度は、アンドロゲン受容体依存性ヒト前立腺がんLNCaP細胞から樹立した、アンドロゲン受容体依存性が異なる３つのサブクローンE9, F10, G4を用いて、Agilent社SureSelect Human All Exon V6 (60.5Mb) kitによるエクソーム解析を実施した。次世代シークエンス解析結果については、２種類の代表的なパイプライン（GATKおよびFreebayes）による精度の高い変異検出を行った（ダブルパイプライン解析）。さらに、タンパク質にインパクトを与える変異と、アレル頻度情報による変異の絞り込みを行った。今回、我々は前立腺がん細胞にアンドロゲン受容体依存性の差異を生み出すパッセンジャー遺伝子変異を同定することを目的としているため、遺伝子の抽出には”androgen receptor (AR)”をキーワードに、かつ親株であるLNCaPには変異が見られないものの、E9, F10, G4のいずれかに変異が認められる遺伝子を抽出することとした。これらの条件で解析した結果、E9もしくはG4に特異的な変異が認められる遺伝子は皆無であったものの、F10に特異的な、一塩基変異Single Nucleotide Variant (SNV)が認められる遺伝子が４つ抽出された。今回、我々はエクソーム解析を施行し、アンドロゲン受容体低依存性のサブクローンF10に特異的な一塩基変異を有する遺伝子４つを抽出することに成功した。これらの遺伝子が正常に働かないために、F10がアンドロゲン受容体低依存性である可能性が考えられる。次年度は、これら４つの遺伝子が前立腺がん細胞のアンドロゲン受容体依存性を規定する鍵分子であることを検証する。

今年，使用Agilent Sunelect人类使用三个亚克隆E9，F10和G4进行外显子分析，这些外显子V6（60.5MB）试剂盒在雄激素受体依赖性雄激素受体依赖性人类前列腺癌LNCAP细胞方面有所不同。关于下一代测序分析的结果，使用两个代表性管道（GATK和FREEBAYES）进行高度精确的突变检测（双管道分析）。此外，使用等位基因频率信息对蛋白质和突变产生影响的突变被缩小。在本文中，我们旨在确定在前列腺癌细胞中产生雄激素受体依赖性差异的乘客基因突变，因此我们决定提取在E9，F10或G4中含有突变的基因，尽管在父菌株LNCAP中均未发现突变。由于在这些条件下进行分析的结果，尽管没有发现在E9或G4中具有特异性突变，但提取了四个基因，其中包含单个核苷酸突变，单核苷酸变体（SNV），特定于F10。在这里，我们进行了外显子分析，并成功提取了四个基因，这些基因带有特定于雄激素受体 - 低依赖性亚克隆F10的单基碱基突变。 F10可能较少依赖雄激素受体，因为这些基因无法正常工作。明年，我们将验证这四个基因是定义前列腺癌细胞中雄激素受体依赖性的关键分子。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Drug Repositioning of the Phenylpiperazine Derivative Naftopidil in Prostate Cancer Treatment

苯基哌嗪衍生物萘哌地尔在前列腺癌治疗中的药物重新定位

DOI：
10.1007/978-981-16-9232-1_8
发表时间：
2022
期刊：
Biomedical Translational Research
影响因子：
0
作者：
Ishii Kenichiro;Sugimura Yoshiki;Watanabe Masatoshi
通讯作者：
Watanabe Masatoshi

Fibroblast-derived miRNA regulates NKX3-1 expression in prostate cancer cells having androgen receptor dependency

成纤维细胞来源的 miRNA 调节具有雄激素受体依赖性的前列腺癌细胞中 NKX3-1 的表达

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Chise Matsuda;Kenichiro Ishii;Yasuhisa Nakagawa;Taku Shirai;Yoshifumi Hirokawa;Kazuhiro Iguchi;Masatoshi Watanabe
通讯作者：
Masatoshi Watanabe