Development of a novel histopathological examination method for castration-resistant prostate cancer focusing on neutral theory of molecular evolution

以分子进化中性理论为重点，开发去势抵抗性前列腺癌的新型组织病理学检查方法

• 批准号: 22K09444
• 负责人: 石井 健一朗
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Mie University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K09444/
• 关键词: 去勢抵抗性前立腺がん; 病理組織学的検査法; 中立進化; アンドロゲン受容体依存性; パッセンジャー遺伝子変異

本年度は、アンドロゲン受容体依存性ヒト前立腺がんLNCaP細胞から樹立した、アンドロゲン受容体依存性が異なる３つのサブクローンE9, F10, G4を用いて、Agilent社SureSelect Human All Exon V6 (60.5Mb) kitによるエクソーム解析を実施した。次世代シークエンス解析結果については、２種類の代表的なパイプライン（GATKおよびFreebayes）による精度の高い変異検出を行った（ダブルパイプライン解析）。さらに、タンパク質にインパクトを与える変異と、アレル頻度情報による変異の絞り込みを行った。今回、我々は前立腺がん細胞にアンドロゲン受容体依存性の差異を生み出すパッセンジャー遺伝子変異を同定することを目的としているため、遺伝子の抽出には”androgen receptor (AR)”をキーワードに、かつ親株であるLNCaPには変異が見られないものの、E9, F10, G4のいずれかに変異が認められる遺伝子を抽出することとした。これらの条件で解析した結果、E9もしくはG4に特異的な変異が認められる遺伝子は皆無であったものの、F10に特異的な、一塩基変異Single Nucleotide Variant (SNV)が認められる遺伝子が４つ抽出された。今回、我々はエクソーム解析を施行し、アンドロゲン受容体低依存性のサブクローンF10に特異的な一塩基変異を有する遺伝子４つを抽出することに成功した。これらの遺伝子が正常に働かないために、F10がアンドロゲン受容体低依存性である可能性が考えられる。次年度は、これら４つの遺伝子が前立腺がん細胞のアンドロゲン受容体依存性を規定する鍵分子であることを検証する。

This year, the Agilent SureSelect Human All Exon V6 (60.5Mb) kit was implemented to resolve the differences in receptor-dependent cell growth and receptor-dependent cell growth in LNCaP cells. Next generation analysis results: 2 kinds of representative GATK (Freebayes), high precision and high variance analysis For example, if you want to change the color of the image, you can change the color of the image. In the present study, we found that the differences in receptor dependencies between the former LNCaP cells and the parent LNCaP cells were different, and that the differences in receptor (AR) were different. The analysis results of these conditions, E9, G4, F10, SNV, G9, G9, F10, F10, F10, In this paper, we analyze the problem of low dependency on the receptor, and extract the specific base variable from the receptor 4 successfully. The probability of a change from normal to low is F10. In the next year, the four genes of the first cell have been identified as the key molecules of the receptor dependency.

项目成果

Drug Repositioning of the Phenylpiperazine Derivative Naftopidil in Prostate Cancer Treatment

苯基哌嗪衍生物萘哌地尔在前列腺癌治疗中的药物重新定位

• DOI: 10.1007/978-981-16-9232-1_8
• 发表时间: 2022
• 期刊: Biomedical Translational Research
• 作者: Ishii Kenichiro;Sugimura Yoshiki;Watanabe Masatoshi
• 通讯作者: Watanabe Masatoshi

Fibroblast-derived miRNA regulates NKX3-1 expression in prostate cancer cells having androgen receptor dependency

成纤维细胞来源的 miRNA 调节具有雄激素受体依赖性的前列腺癌细胞中 NKX3-1 的表达

• 发表时间: 2022
• 作者: Chise Matsuda;Kenichiro Ishii;Yasuhisa Nakagawa;Taku Shirai;Yoshifumi Hirokawa;Kazuhiro Iguchi;Masatoshi Watanabe
• 通讯作者: Masatoshi Watanabe