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耐性菌による尿路感染症への治療戦略-trade-offを利用したファージ療法

耐药菌引起的尿路感染的治疗策略——利用权衡的噬菌体疗法

基本信息

批准号：
22K09535
负责人：
花輪智子
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kyorin University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

細菌がファージに対して耐性化するかわりに、その対価として病原性の低下などのコスト（代償）を払う”trade-off”という現象が知られている。本研究では、多剤耐性菌感染症に対するファージ療法の開発を目的としており、中でもファージに耐性化してもtrade-offにより治療を成功に導くことのできるファージを用いた多剤耐性大腸菌による尿路感染症に対するファージ療法の開発を目指している。治療に適したファージを入手するためには感染症を引き起こしている大腸菌について解析を行うことは必須である。そこで杏林大学医学部付属病院の救急科および総合診療科の患者血液から多剤耐性菌の一つであるESBL産生大腸菌60株を用いて遺伝型、病原遺伝子の保有等を調べた。その結果、分離された患者の8割は尿路感染症であり、分離大腸菌は尿路病原性大腸菌（UPEC）に多いphylogroup B2、ST131の遺伝型を示す菌が優勢であった。また、これらは病原遺伝子のうちP線毛、鉄利用タンパク、毒素など、UPECに多く検出される遺伝子を保有していた。さらに機能の不明であるがUPECに高頻度で検出されるuspやmalXホモログ（PAI）の保有率が高かった。都市部下水流入水はファージを単離するための素材として広く利用されている。当研究チームでも昨年までに合計190種のファージを単離している。現在までにファージの保存中の安定性、複製（増殖）のし易さ、臨床分離株を用いて部分的に宿主域を調べた結果などから18種のファージを選出した。しかしながらファージには細菌のような確立された同定法はなく、形態学的またはゲノム配列の決定が必要となる。電子顕微鏡での観察、宿主域の類似性から類似しているファージを削除し、6種のファージのゲノム配列の決定を行なった。現在そのアノテーションなどの解析を行なっている。

The phenomenon of "trade-off" in bacteria is known as "trade-off" in bacteria. This study aims to develop therapy for urinary tract infections caused by multi-resistant coliform bacteria and to guide the development of successful therapy for urinary tract infections caused by multi-resistant coliforms. The treatment of Escherichia coli is necessary. The ESBL produced 60 E. coli strains from the blood of patients in the Emergency Department and General Clinic of Kyorin University School of Medicine, and was used to regulate the transmission and preservation of pathogenic bacteria. The results showed that 8 isolates of patients with urinary tract infections were dominant in isolates of Escherichia coli and uropathogenic Escherichia coli (UPEC). In addition, it is necessary to prevent the occurrence of pathogens, such as hair, iron, toxin, UPEC, etc. UPEC has a high frequency of detection of unknown functions and a high retention rate of PAI. The city's water flow into the city When the study was conducted last year, a total of 190 species were identified. The stability, replication and ease of use of clinical isolates in the preservation of the virus were investigated. It is necessary to establish the identity of bacteria and to determine the arrangement of morphology. The similarity of electron microscope observation and host domain is reduced, and the arrangement of six kinds of electron microscope is determined. Now the system is ready for analysis.