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Assoziations-Analyse von SNP-Daten, die mit dem Expectation-Maximization-Algorithmus "In Silico" bestimmt wurden

Assoziations-Analyse von SNP-Daten, die mit dem Expectation-Maximization-Algorithmus "In Silico" bestimmt wurden
使用“In Silico”期望最大化算法确定的 SNP 数据的关联分析
批准号:
81878785
负责人:
Privatdozent Dr. Tim Becker
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2009
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2008-12-31 至 2012-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
Ziel des projects list, In Softwarepaket zu entwickeln, das SNP-Daten auf association testingkann, die zunächst“In Silico”with the hilfe von HapMap-Daten, der Daten aus anderen Quellen bestestimmt werden。Die Software soll speziell augeneweite associationstuden (GWAS) zugeschnitten sein and soll das dazu not endige Datamanagement in iner öffentlich verf<s:1>数据管理平台vereinfachen und untersttzten。Der zugrunde liegende Algorithmus f<e:1>或die bestimung Der“In- silicon”- genotypen solsoline Erweiterung des Expectation-Maximization-(EM-)Algorithmus sein,见FAMHAP实施者。模具参数Die bei der associationsanalyse der“in - silicon - genotypen”autreten sollen basen augebnissen einer groen powersimulationsstudy optimiert werden。新方法与已有的方法相结合,分析了“硅-基因型”的相关性。
英文摘要
Ziel des Projekts ist es, ein Softwarepaket zu entwickeln, das SNP-Daten auf Assoziation testen kann, die zunächst „In Silico“ mithilfe von HapMap-Daten oder Daten aus anderen Quellen bestimmt werden. Die Software soll speziell auf Genomweite Assoziationsstudien (GWAS) zugeschnitten sein und soll das dazu notwendige Datamanagement in einer öffentlich verfügbaren Plattform vereinfachen und unterstützten. Der zugrunde liegende Algorithmus für die Bestimmung der “In- Silico”-Genotypen soll eine Erweiterung des Expectation-Maximization-(EM- )Algorithmus sein, wie er in FAMHAP implementiert ist. Die Parameter die bei der Assoziationsanalyse der “In-Silico-Genotypen” auftreten sollen basierend auf den Ergebnissen einer großen Powersimulationsstudie optimiert werden. Die neue Methode soll mit existierenden Methoden für die Assoziationsanalyse von „In-Silico- Genotypen“ verglichen werden.
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会议论文
Identification of causal genes for nonsyndromic orofacial clefts using Whole Exome Sequencing
  • 批准号:
    267241232
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2015
  • 负责人:
    Privatdozent Dr. Tim Becker
  • 依托单位:
Meta-Analysis of Multiple Regression Models and Rare Variant Gene-Gene Interaction Analysis for Next Generation Sequencing Data
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