Optimization of Neutron Reflectometry for analysis of biological membrane
Optimization of Neutron Reflectometry for analysis of biological membrane
批准号:
22K12672
负责人:
塩田 拓也
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
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英文摘要
本研究課題では、膜タンパク質の動的な変化を解析する手法として、界面解析法の一つ中性子反射率法の適応を目指している。中性子反射率法では、Si-Wafer上に生体膜を再構築し、その上部を液体で見たし、固体ー液体界面として解析することで詳細な解析を行う。初年度は、大腸菌のベータバレル型膜タンパク質輸送装置BAM複合体の再構築を目指した。BAM複合体は、中心因子であるBamAにBamB-Eの4つのタンパク質が会合して複合体を形成する。これまで、BamAに対して、BamCを除くサブユニットの会合には成功していたが、BamCのみはBamAに安定的に結合させることができていなかった。今回、BamCが安定して結合できない問題に対して、BamCを生体膜を再構築する際の脂質を加える前にWaferに固定することで、BAM複合体に安定的に取り込まれることがわかった。その後、BAM複合体の他のサブユニットであるBanmA, B, D, Eを加えることでBamCの構造変化を捉えることができた。構造変化がin vivoでも起こりうる生理的な現象であることを部位特異的光架橋法で確認した。また、その中で、構造解析に必要なプロセスである界面活性剤による可溶化が複合体のダイナミクスに大きな影響を与えており、状態が限定されてしまっていた原因であることを突き止めた。そのほか、再構築する膜の標的として、ヘリコバクターピロリ、インフルエンザ菌のタンパク質の精製を行なった。
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Discovery of conserved rule and role behind the assembly of bacterial beta-barrel membrane proteins
发现细菌β-桶膜蛋白组装背后的保守规则和作用
DOI:
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发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takuya Shiota, Edward Germany, Nakajohn Thewasano, Kenichiro Imai, Yuki Maruno, Rebecca Bamert, Rhys Dunstan, Yue Ding, Yukari Nakajima, XiangFen Lai, Chaille Webb, Christopher Stubenrauch, Kher Shing Tan, Hsin-Hui Shen, Trevor Lithgow]
通讯作者:
Trevor Lithgow
βバレル型膜タンパク質に書き込まれた輸送に必要なシグナルの解明
阐明写入 β-桶膜蛋白的运输所需的信号
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[塩田拓也, Edward Germany, 丸野友希, Nakajohn Thewasano, 中島由香里]
通讯作者:
中島由香里
Categorization of substrate OMPs by dependence on accessory proteins of the BAM complex
根据 BAM 复合物的辅助蛋白对底物 OMP 进行分类
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Nakajohn Thewasano, Takuya Shiota, Yukari Nakajima, Edward Germany]
通讯作者:
Edward Germany
新規スクリーニング法,EBIS法によるグラム陰性菌に対する抗菌薬探索
使用新的筛选方法 EBIS 方法寻找革兰氏阴性菌的抗生素
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[塩田拓也, 中島由香里]
通讯作者:
中島由香里
Optimization of multiple method baced on neutron reflectometry for analysis of biogenesis of Gram-negative bacterial membrane.
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批准号:21KK0126
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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资助金额:$12.15万
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财政年份:2021
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负责人:塩田 拓也
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依托单位:
Analysis of the assembly of the beta-barrel membrane proteins into the E. coli outer membrane by the EMM assembly assay
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批准号:18H06052
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$1.91万
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财政年份:2018
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负责人:塩田 拓也
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依托单位:
in vivo部位特異的光架橋法を用いたミトコンドリア膜透過装置の解析
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批准号:09J08047
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2009
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负责人:塩田 拓也
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依托单位:
海外基金