マルチオミクス解析によるクロマチンドメインレベルのエピジェネティック制御の解明

通过多组学分析阐明染色质结构域水平的表观遗传调控

• 批准号: 13J04821
• 负责人: 野﨑 慎
• 金额: $ 1.92万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13J04821/
• 关键词: クロマチン; ヌクレオソーム; 一分子イメージング; 超解像イメージング; ヒストン修飾; ダイナミクス; イメージング; 一分子顕微鏡; クロマチンドメイン

ヌクレオソームが不規則に折り畳まれることによって生じるクロマチンドメイン内部において，どのようにヌクレオソームがゆらいでいるのか，そしてそれがどのように遺伝子発現やDNA複製などの細胞機能と関連しているのかという問題を解決するために研究を行ってきた．2014年度までに，クロマチンの構造と動態を同時にライブセルで観察することができる1分子ヌクレオソームイメージング法の開発を行ってきた．2015年度は，1分子ヌクレオソームイメージング法を用いることで，生細胞におけるクロマチンの観察に取り組んだ．これまでに，トリコスタチンA (TSA)を用いたヒストンアセチル化の誘導によるクロマチンの変化を既に観察していたが，他にもクロマチン構造タンパク質であるコヒーシンのノックダウンや，核内の塩濃度の変化によっても大きく変化することを観察した．さらに，DRBなどの薬剤によって，細胞内における転写活性を低下させることによって，クロマチン自体の構造は変化しないが，その動態は大きく変化することを観察した．そして，ES細胞の分化過程において，クロマチンの構造と動態が変化することを観察した．これらの結果は，クロマチンの構造と動態の変化が，細胞の分化過程における転写活性などと関連していることを示唆している．1分子ヌクレオソームイメージング法の開発とそれを用いたクロマチンの観察に関する成果について，論文にまとめ，投稿を行った．

Irregular ヌ ク レ オ ソ ー ム が に folding り 畳 ま れ る こ と に よ っ て raw じ る ク ロ マ チ ン ド メ イ ン internal に お い て, ど の よ う に ヌ ク レ オ ソ ー ム が ゆ ら い で い る の か, そ し て そ れ が ど の よ う に posthumous son 伝 発 now や DNA replication な ど の cell function と masato even し て い る の か と い う を solve す る た め に を line っ て き た. 2014 ま で に, ク ロ マ チ ン の tectonic dynamic を と also に ラ イ ブ セ ル で す was 観 る こ と が で き る 1 molecular ヌ ク レ オ ソ ー ム イ メ ー ジ ン グ method の open 発 を line っ て き た. 2015 annual は, 1 molecular ヌ ク レ オ ソ ー ム イ メ ー ジ ン を グ method with い る こ と で, living cells に お け る ク ロ マ チ ン の 観 examine に group take り ん だ. こ れ ま で に, ト リ コ ス タ チ ン A (TSA) を い た ヒ ス ト ン ア セ チ ル change induced に の よ る ク ロ マ チ ン の variations change を both に 観 examine し て い た が, he に も ク ロ マ チ ン tectonic タ ン パ ク qualitative で あ る コ ヒ ー シ ン の ノ ッ ク ダ ウ ン や, intranuclear の の salt concentration variations change に よ っ て も big き く variations change す る こ と を 観 examine し た. さ ら に, DRB な ど の 薬 tonic に よ っ て, intracellular に お け る planning write low active を さ せ る こ と に よ っ て, ク ロ マ チ ン autologous は の structure - the し な い が, そ の dynamic は big き く variations change す る こ と を 観 examine し た. の そ し て, ES cell differentiation process に お い て, ク ロ マ チ ン の tectonic dynamic が と variations change す る こ と を 観 examine し た. こ れ ら の results は ク ロ マ チ ン の tectonic dynamic の と - が, cell differentiation process に の お け る planning write activity な ど と masato even し て い る こ と を in stopping し て い る. 1 molecular ヌ ク レ オ ソ ー ム イ メ ー ジ ン グ method の open 発 と そ れ を with い た ク ロ マ チ ン の 観 examine に masato す る results に つ い て, paper に ま と め, contribute を line っ た.

项目成果

Chromatin as dynamic 10-nm fibers.

• DOI: 10.1007/s00412-014-0460-2
• 发表时间: 2014-06
• 期刊: Chromosoma
• 影响因子: 1.6
• 作者: Maeshima K;Imai R;Tamura S;Nozaki T
• 通讯作者: Nozaki T

Single Nucleosome Imaging in Living Human Cells

人类活细胞中的单核小体成像

• DOI: 10.1508/cytologia.79.1
• 发表时间: 2014
• 期刊: CYTOLOGIA
• 影响因子: 1
• 作者: Tadasu Nozaki;Ryosuke Imai;Sachiko Tamura;Kazuhiro Maeshima.
• 通讯作者: Kazuhiro Maeshima.

Visualization of chromatin structure and dynamics in living eukaryotic cells.

活体真核细胞染色质结构和动态的可视化。

• 发表时间: 2016
• 作者: Nozaki T;Kaizu K;Pack CG;Tamura S;Tani T;Hihara S;Nagai T;Takahashi K;Maeshima K.;野崎慎
• 通讯作者: 野崎慎

細胞のなかの「ゆらく」クロマチン

细胞内染色质的“波动”

• 发表时间: 2013
• 作者: 野崎慎;前島一博
• 通讯作者: 前島一博

Visualization of chromatin dynamics and domains in live mammalian cells.

活哺乳动物细胞中染色质动态和结构域的可视化。

• 发表时间: 2015
• 作者: Nozaki T;Kaizu K;Pack CG;Tamura S;Tani T;Hihara S;Nagai T;Takahashi K;Maeshima K.;野崎慎;野崎慎
• 通讯作者: 野崎慎