放射線によるゲノムDNA二重鎖切断の定量的解析技術の開発と数理モデルの構築
放射線によるゲノムDNA二重鎖切断の定量的解析技術の開発と数理モデルの構築
批准号:
13J01270
负责人:
下林 俊典
金额:
$1.98万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2016-03-31
中文摘要
本年度は以下の二つに関して研究を進めた。(1) 細胞サイズの脂質二重膜小胞にDNAを内包する新規な手法に関する実験を昨年度に引き続き行った。2014年度に国際学術論文として発表した蛍光顕微鏡観察に加えて、ナノスケールでのメカニズムを明らかにする為、X線小角散乱実験を昨年度に引き続き行った。結果、脂質膜の水和ダイナミクスが、乾燥脂質膜に添加されたDNAとイオンによって促進されることが明らかとなった。これらの成果は現在学術論文として纏めており、近々投稿予定である。(2) 研究遂行過程において発見した脂質二重膜小胞における相分離転移現象の研究を発展させた。マクロ相分離状態からミクロ相分離状態への相分離構造の転移ダイナミクスを実験的に明らかにし、数値計算においてもおよそこの転移現象を確認した。これらの転移現象は、二重膜において脂質組成が非対称である事に起因する自発曲率によって駆動されることが示唆された。更に上記の結果から期待した通りに、脂質組成が非対称になるほどドメインサイズが小さくなることを実験的に明らかにした。これは多成分脂質二重膜における相分離ドメインのサイズが脂質組成が非対称である事に起因する自発曲率によって制御されることを強く示唆している。以上の成果は、生体膜と再構成膜におけるラフトと呼ばれるドメインのサイズ不一致問題を解決する上での重要な知見といえる。
英文摘要
本年度は以下の二つに関して研究を進めた。(1) 細胞サイズの脂質二重膜小胞にDNAを内包する新規な手法に関する実験を昨年度に引き続き行った。2014年度に国際学術論文として発表した蛍光顕微鏡観察に加えて、ナノスケールでのメカニズムを明らかにする為、X線小角散乱実験を昨年度に引き続き行った。結果、脂質膜の水和ダイナミクスが、乾燥脂質膜に添加されたDNAとイオンによって促進されることが明らかとなった。これらの成果は現在学術論文として纏めており、近々投稿予定である。(2) 研究遂行過程において発見した脂質二重膜小胞における相分離転移現象の研究を発展させた。マクロ相分離状態からミクロ相分離状態への相分離構造の転移ダイナミクスを実験的に明らかにし、数値計算においてもおよそこの転移現象を確認した。これらの転移現象は、二重膜において脂質組成が非対称である事に起因する自発曲率によって駆動されることが示唆された。更に上記の結果から期待した通りに、脂質組成が非対称になるほどドメインサイズが小さくなることを実験的に明らかにした。これは多成分脂質二重膜における相分離ドメインのサイズが脂質組成が非対称である事に起因する自発曲率によって制御されることを強く示唆している。以上の成果は、生体膜と再構成膜におけるラフトと呼ばれるドメインのサイズ不一致問題を解決する上での重要な知見といえる。
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Micro phase separation of a lipid-DNA binary mixture in a dried film
干膜中脂质-DNA 二元混合物的微相分离
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sanemtcni takahashi, Shu-intro Inutsuka, Kentaro Tohma, Shunsuke F Shimobayashi]
通讯作者:
Shunsuke F Shimobayashi
組成非対称な相分離膜面上における相分離転移現象:実験と数値計算
成分不对称相分离膜表面的相分离转变现象:实验和数值计算
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[S. Komura, T. Tanimori, H. Kubo, A. Takada, J. Parker, T. Mizumoto, Y. Mizumura, S. Sonoda, D. Tomono, T. Sawano, K. Naka mura, Y. Matsuoka, Y. Sato, S. Nakamura, K. Miuchi, S. Kabuki, Y. Kishimoto, S. Kurosawa, S. Iwaki, M. Tanaka, M. Ikeno and T. Uchida, 福居直哉,保原麗,高山あかり,秋山了太,長谷川修司, 下林俊典]
通讯作者:
下林俊典
Emergence of DNA-encapsulating liposome from DNA-lipid blend film
DNA-脂质混合膜中包裹 DNA 的脂质体的出现
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[N. Fukui, T. Hirahara, and S. Hasegawa, Shunsuke F Shimobayashi]
通讯作者:
Shunsuke F Shimobayashi
Direct observations of transition dynamics from macro- to micro-phase separation in asymmetric lipid bilayers induced by externally added glycolipids
直接观察外部添加糖脂诱导的不对称脂质双层中从宏观相分离到微观相分离的转变动力学
DOI:
10.1209/0295-5075/113/56005
发表时间:
2016
期刊:
Europhysics Letters
影响因子:
--
作者:
[Shunsuke F. Shimobayashi, Masatoshi Ichikawa and Takashi Taniguchi]
通讯作者:
Masatoshi Ichikawa and Takashi Taniguchi
組成非対称な脂質二重膜面上における相分離転移現象:実験と数値計算
成分不对称脂质双层表面的相分离和转变现象:实验和数值计算
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tohma K, Saito M, Demetria CS, Manalo DL, Quiambao BP, Kamigaki T, and Oshitani H, 石原大嵩,福居直哉,保原麗,高山あかり,秋山了太,平原徹,長谷川修司, 下林俊典]
通讯作者:
下林俊典
共 18 条
界面揺らぎから迫る非膜型オルガネラの物性と機能
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批准号:23K13072
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:下林 俊典
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依托单位:
国内基金
海外基金
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猪白细胞介素2和6基因DNA改组与表达研究
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批准号:30170703
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项目类别:面上项目
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资助金额:18.0万元
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批准年份:2001
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负责人:高荣
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依托单位:
香菇交配型基因的DNA多态性研究
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批准号:39870540
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项目类别:面上项目
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资助金额:8.5万元
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批准年份:1998
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负责人:潘迎捷
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依托单位:
用河豚鱼DNA转基因技术分离鉴定Peg1印迹控制顺序
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批准号:39870428
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项目类别:面上项目
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资助金额:12.0万元
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批准年份:1998
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负责人:胡兰靛
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依托单位:
嵌入调控型DNA杂交测序萘系杂环荧光染料及构效关系
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批准号:29876009
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项目类别:面上项目
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资助金额:22.0万元
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批准年份:1998
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负责人:钱旭红
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依托单位:
DNA与电活性分子相互作用的研究及其应用
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批准号:29773034
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项目类别:面上项目
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资助金额:12.0万元
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批准年份:1997
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负责人:庞代文
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依托单位:
质粒DNA特殊拓朴结构实体的研究
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批准号:39770171
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项目类别:面上项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:1997
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负责人:黄熙泰
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依托单位:
肺癌发病中DNA修复缺陷作用的研究
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批准号:39500065
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:8.0万元
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批准年份:1995
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负责人:陈国安
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依托单位:
新一类DNA嵌入型呋喃并苯并香豆素荧光染料的研究
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批准号:29476230
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项目类别:面上项目
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资助金额:7.0万元
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批准年份:1994
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负责人:钱旭红
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依托单位:
离子注入法导入棉花外源DNA的研究
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批准号:39100080
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:4.5万元
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批准年份:1991
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负责人:程备久
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依托单位: