Characterizing the physiological and pharmacological roles of SLC22A24

表征 SLC22A24 的生理和药理作用

基本信息

项目摘要

Characterizing the Physiological and Pharmacological Roles of SLC22A24 Membrane transporters in the solute carrier superfamily (SLC) play critical roles in physiology and pharmacology serving in the cellular uptake and removal of endogenous metabolites and many prescription drugs. In spite of their importance, about one-fifth of SLC transporters have no known substrates and are considered “orphan” proteins. Recently, our laboratory de-orphaned one of these proteins, SLC22A24, by applying various methods, which included computational analyses of genomewide association signals, homology modeling, expression profiling, and importantly, isotopic uptake assays in cells stably expressing SLC22A24. Our studies revealed that SLC22A24 is an organic anion transporter with a preference for sulfate and glucuronide conjugates of steroids. Recent preliminary studies suggest that the transporter also plays an important role in drug disposition. The major goals of the proposed research are to determine the physiological and pharmacological roles of SLC22A24 in the disposition of steroid glucuronides and to discover other endogenous metabolites and pharmacologic agents that are substrates of SLC22A24. To achieve our goals, we have designed three specific aims. In aim 1, we will employ studies in cell lines to determine the localization of SLC22A24 to the basolateral or apical membranes. In addition, we will discover prescription drugs and other metabolites that are substrates of SLC22A24. In aim 2, we will use CRISPR/Cas9 methods to create transgenic mice expressing SLC22A24 in the proximal tubule and use the mice to determine its role in the disposition of pharmacologic and physiologic substrates of the transporter. Finally, in aim 3, we will conduct association studies in healthy volunteers to associate functional variants in SLC22A24 with plasma levels and renal clearance of steroid glucuronides. Methods employed will include confocal microscopy, isotopic uptake and flux assays in cells, CRISPR/Cas9 methods in mice, LC/MS/ metabolomic analytical methods, association analyses and clearance determinations in humans. We postulate that this comprehensive genomic, metabolomic and functional studies in cells, mice and in healthy volunteers including deep clinical phenotyping will serve as a blueprint for systematic evaluation of the physiological and pharmacological roles of a newly de-orphaned transporter.
SLC 22 A24的生理和药理作用 溶质载体超家族(SLC)中的膜转运蛋白在生理学和生物学中起着关键作用, 药理学服务于细胞摄取和去除内源性代谢物, 毒品尽管它们很重要,但大约五分之一的SLC转运蛋白没有已知的底物, 被认为是“孤儿”蛋白质。最近,我们的实验室通过以下方法使这些蛋白质之一SLC 22 A24去孤儿化: 应用各种方法,包括全基因组关联信号的计算分析, 同源性建模、表达谱分析,以及重要的是,稳定表达 SLC22A24.我们的研究表明,SLC 22 A24是一种对硫酸盐有偏好的有机阴离子转运蛋白 和类固醇的葡糖苷酸缀合物。最近的初步研究表明,转运蛋白也起着重要的作用。 药物处置的重要作用。拟议研究的主要目标是确定 SLC 22 A24在类固醇葡萄糖醛酸苷处置中的生理学和药理学作用, 发现作为SLC 22 A24底物的其他内源性代谢物和药理学试剂。 为了实现我们的目标,我们制定了三个具体目标。在目标1中,我们将采用细胞系研究, 确定SLC 22 A24在基底膜或顶膜的定位。此外,我们还将发现 处方药和其他代谢物是SLC 22 A24的底物。在目标2中,我们将使用CRISPR/Cas9 建立在近端小管中表达SLC 22 A24的转基因小鼠的方法,并使用小鼠来确定 其在转运蛋白的药理学和生理学底物的处置中的作用。在目标3中,我们 将在健康志愿者中进行关联研究,以将SLC 22 A24中的功能变体与血浆中的 类固醇葡萄糖醛酸苷的水平和肾脏清除率。所采用的方法将包括共焦显微镜, 细胞中的同位素摄取和通量测定,小鼠中的CRISPR/Cas9方法,LC/MS/代谢组学分析 方法、关联分析和人体清除率测定。我们假设, 在细胞、小鼠和健康志愿者中进行的全面基因组学、代谢组学和功能研究,包括 深入的临床表型分析将作为系统评价生理和 新的去孤儿转运蛋白的药理作用。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

KATHLEEN M GIACOMINI其他文献

KATHLEEN M GIACOMINI的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('KATHLEEN M GIACOMINI', 18)}}的其他基金

Transporter Elucidation Center at the University of California, San Francisco
加州大学旧金山分校转运蛋白阐明中心
  • 批准号:
    10747230
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
Characterizing the physiological and pharmacological roles of SLC22A24
表征 SLC22A24 的生理和药理作用
  • 批准号:
    10095957
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
Characterizing the physiological and pharmacological roles of SLC22A24
表征 SLC22A24 的生理和药理作用
  • 批准号:
    10595085
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
Drug-Vitamin Interactions Mediated by the Thiamine Transporter, SLC19A3
硫胺素转运蛋白 SLC19A3 介导的药物-维生素相互作用
  • 批准号:
    9918359
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
PGRN Administrative Coordination Hub, ACH (PGRN)
PGRN 行政协调中心,ACH (PGRN)
  • 批准号:
    9302796
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
PGRN Administrative Coordination Hub, ACH (PGRN)
PGRN 行政协调中心,ACH (PGRN)
  • 批准号:
    8946851
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
Pharmacogenomics of Membrane Transporters
膜转运蛋白的药物基因组学
  • 批准号:
    8312768
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
AUTOMATED DETECTION OF REGIONS OF INTEREST IN MEMBRANE TRANSPORTERS
自动检测膜转运蛋白感兴趣的区域
  • 批准号:
    8363594
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
GENETIC RESPONSE OF ANTI-DEPRESSANTS
抗抑郁药的遗传反应
  • 批准号:
    8363635
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
GENETIC EFFECTS ON ALLERGIES TO ANTIBIOTICS
抗生素过敏的遗传影响
  • 批准号:
    8363636
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:

相似海外基金

NSF/BIO-DFG: Biological Fe-S intermediates in the synthesis of nitrogenase metalloclusters
NSF/BIO-DFG:固氮酶金属簇合成中的生物 Fe-S 中间体
  • 批准号:
    2335999
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Collaborative Research: Conference: Large Language Models for Biological Discoveries (LLMs4Bio)
合作研究:会议:生物发现的大型语言模型 (LLMs4Bio)
  • 批准号:
    2411529
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Collaborative Research: Conference: Large Language Models for Biological Discoveries (LLMs4Bio)
合作研究:会议:生物发现的大型语言模型 (LLMs4Bio)
  • 批准号:
    2411530
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Collaborative Research: NSF-ANR MCB/PHY: Probing Heterogeneity of Biological Systems by Force Spectroscopy
合作研究:NSF-ANR MCB/PHY:通过力谱探测生物系统的异质性
  • 批准号:
    2412551
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Elucidating mechanisms of biological hydrogen conversion through model metalloenzymes
通过模型金属酶阐明生物氢转化机制
  • 批准号:
    2419343
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Collaborative Research: The Interplay of Water Condensation and Fungal Growth on Biological Surfaces
合作研究:水凝结与生物表面真菌生长的相互作用
  • 批准号:
    2401507
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
DESIGN: Driving Culture Change in a Federation of Biological Societies via Cohort-Based Early-Career Leaders
设计:通过基于队列的早期职业领袖推动生物协会联盟的文化变革
  • 批准号:
    2334679
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
REU Site: Modeling the Dynamics of Biological Systems
REU 网站:生物系统动力学建模
  • 批准号:
    2243955
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Defining the biological boundaries to sustain extant life on Mars
定义维持火星现存生命的生物边界
  • 批准号:
    DP240102658
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Discovery Projects
Advanced Multiscale Biological Imaging using European Infrastructures
利用欧洲基础设施进行先进的多尺度生物成像
  • 批准号:
    EP/Y036654/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.96万
  • 项目类别:
    Research Grant
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了