GENETICS DNA CHEMISTRY AND PHAGE PHI X 174

遗传学 DNA 化学和噬菌体 PHI X 174

基本信息

  • 批准号:
    2058961
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 28.12万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    1977
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    1977-03-01 至 1997-02-28
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

This application proposes to devise improved methods for directed mutagenesis, and to apply these methods to define regulatory sequences in DNA. We will exploit a new method for producing "complete mutant libraries", which allows the isolation of all possible single base substitution mutations within a region of DNA. The target sequence is synthesized by a slight modification of the usual automated synthetic procedure, in which chains are built stepwise from the 3' end by the addition of nucleoside phosphoramidite monomeric units. Before synthesis each of the four monomer reservoirs is "doped" with a small amount of each of the other three, to produce a level of contamination sufficient to produce a small number of mutations per molecule synthesized. Following synthesis, the mutagenized sequences are amplified by biological cloning, to produce a mutant library containing all possible point substitution mutations of the original sequence. It is practical to identify mutants directly by sequencing random isolates from the library. We are exploring phenotypes of mutants in three libraries which we have already constructed and characterized: 1) the glucocorticoid response element (GRE) of mouse mammary tumor virus, 2) an enhancer-like element in the Tyl transposon of yeast, and 3) the RNA polymerase III promoter of the VAI gene of adenovirus. We propose to construct and analyze a library of mutations in the alpha I domain of the H-2DP gene from the major histocompatibility complex of the mouse. We propose to construct complete mutant libraries for genes E and J of phage PhiX174. This project will also serve to evaluate the feasibility and usefulness of a complete chemical synthesis of the PhiX174 genome. We propose to use mutations of defined DNA sequences from a prokaryotic source as a "shuttle target" to assay in vivo mutagenesis in mammals. Our objective is to develop a relatively rapid and economical method for measurement of mutation rates in whole animals. The phage PhiX174 genome, carrying mutations of defined sequence, has been stably introduced into mouse L cells in tissue culture, and we are able to rescue it in E. coli by transfection of spheroplasts. We propose to use this system to measure reversion rates of PhiX174 mutations following mutagenic treatment of the L cells. We propose to use DNA microinjection to produce mice carrying integrated copies of the PhiX174 genome, for use in whole animal mutagenesis assays.
本应用建议设计用于定向的改进方法

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Clyde A. Hutchison其他文献

Modelling the Nucleotide Metabolic Network of a Genetically Minimal Cell
  • DOI:
    10.1016/j.bpj.2019.11.2562
  • 发表时间:
    2020-02-07
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    Troy A. Brier;David Bianchi;Zane R. Thornburg;Marcelo Cardoso dos Reis Melo;Marian Breuer;Kim S. Wise;Hamilton O. Smith;Clyde A. Hutchison;John I. Glass;Zaida Luthey-Schulten
  • 通讯作者:
    Zaida Luthey-Schulten
DNA-protein interaction at the replication termini of plasmid R6K.
质粒 R6K 复制末端的 DNA-蛋白质相互作用。
  • DOI:
    10.1101/gad.5.1.74
  • 发表时间:
    1991
  • 期刊:
  • 影响因子:
    10.5
  • 作者:
    Frakash Rao;Clyde A. Hutchison;D. Bastia
  • 通讯作者:
    D. Bastia
Modeling the Lipid Metabolism of a Genetically Minimal Cell
  • DOI:
    10.1016/j.bpj.2019.11.1999
  • 发表时间:
    2020-02-07
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    David M. Bianchi;Marian Breuer;Vinson Lam;Anustup Poddar;Kim S. Wise;Clyde A. Hutchison;Hamilton O. Smith;Elizabeth Villa;Taekjip Ha;John I. Glass;Zaida Luthey-Schulten
  • 通讯作者:
    Zaida Luthey-Schulten
Fundamental cell behavior emerges from whole cell simulations of a minimal cell by integrating experiment and theory
  • DOI:
    10.1016/j.bpj.2021.11.2107
  • 发表时间:
    2022-02-11
  • 期刊:
  • 影响因子:
  • 作者:
    Zane R. Thornburg;David Bianchi;Troy A. Brier;Benjamin R. Gilbert;Tyler M. Earnest;Marcelo Cardoso dos Reis Melo;Andras Cook;Kim S. Wise;Hamilton O. Smith;Clyde A. Hutchison;John I. Glass;Zaida Luthey-Schulten
  • 通讯作者:
    Zaida Luthey-Schulten
The process of infection with bacteriophage FX174X. Mutations in a FX lysis gene
噬菌体FX174X感染的过程。
  • DOI:
  • 发表时间:
    1966
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Clyde A. Hutchison;R. Sinsheimer
  • 通讯作者:
    R. Sinsheimer

Clyde A. Hutchison的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Clyde A. Hutchison', 18)}}的其他基金

KEY INTERACTIONS FOR HIV 1 RT STABILITY AND DIMERIZATION
HIV 1 RT 稳定性和二聚化的关键相互作用
  • 批准号:
    6624517
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
KEY INTERACTIONS FOR HIV 1 RT STABILITY AND DIMERIZATION
HIV 1 RT 稳定性和二聚化的关键相互作用
  • 批准号:
    6475487
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
KEY INTERACTIONS FOR HIV 1 RT STABILITY AND DIMERIZATION
HIV 1 RT 稳定性和二聚化的关键相互作用
  • 批准号:
    6313296
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
KEY INTERACTIONS FOR HIV 1 RT STABILITY AND DIMERIZATION
HIV 1 RT 稳定性和二聚化的关键相互作用
  • 批准号:
    6686359
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
GENETICS, DNA CHEMISTRY AND PHAGE PHI X 174
遗传学、DNA 化学和噬菌体 PHI X 174
  • 批准号:
    3480493
  • 财政年份:
    1977
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
GENETICS AND DNA CHEMISTRY OF PHAGE PHI X-174
噬菌体 PHI X-174 的遗传学和 DNA 化学
  • 批准号:
    3480491
  • 财政年份:
    1977
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
GENETICS DNA CHEMISTRY AND PHAGE PHI X 174
遗传学 DNA 化学和噬菌体 PHI X 174
  • 批准号:
    3480490
  • 财政年份:
    1977
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
GENETICS, DNA CHEMISTRY AND PHAGE PHI X 174
遗传学、DNA 化学和噬菌体 PHI X 174
  • 批准号:
    3480489
  • 财政年份:
    1977
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
GENETICS AND DNA CHEMISTRY OF PHAGE PHI X-174
噬菌体 PHI X-174 的遗传学和 DNA 化学
  • 批准号:
    3124483
  • 财政年份:
    1977
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
MUTATIONAL ANALYSIS OF PROTEIN STRUCTURE/FUNCTION
蛋白质结构/功能的突变分析
  • 批准号:
    2650010
  • 财政年份:
    1977
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:

相似国自然基金

基于仿生非平衡态的DNA纳米机器构建及其对多种霉菌毒素高灵敏同步
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
复制蛋白A小分子抑制剂-HAMNO调控DNA损伤修复的结构及功能研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
基于合金@硼烯的比率型折纸电化学芯片构建及其在多种循环肿瘤DNA的超灵敏检测
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
基于 DNA 编码分子库的新型蛋白抑制剂分子胶水活性评价与机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
HMGCL通过H3K27乙酰化增强RAD52依赖的DNA损伤修复促进宫颈癌放疗抵抗的机制研究
  • 批准号:
    JCZRLH202500546
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
替尼泊苷抑制APEX1驱动DNA损伤在治疗肺癌中的作用及机制研究
  • 批准号:
    JCZRYB202500477
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
NEDD4泛素化调控CREB/miR-132轴诱发精子DNA碎片化在肥胖不育中的作用及机制
  • 批准号:
    QN25H200016
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
高强度DNA杂化纳米机器人在内体膜调控和核酸药物递送中的基础研究
  • 批准号:
    HDMZ25H300006
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
PLOD2的DNA低甲基化模式驱动内质网与线粒体代谢串扰诱导免疫微环境重塑和化疗耐药
  • 批准号:
    KLY25H160008
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
LncRNA SNHG14调控miR-214-3p的DNA甲基化水平在支气管肺发育不良肺泡化阻滞的机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目

相似海外基金

Investigating metabolism and DNA damage repair in uropathogenic Escherichia coli fluoroquinolone persisters
研究泌尿道致病性大肠杆菌氟喹诺酮类持续存在的代谢和 DNA 损伤修复
  • 批准号:
    10747651
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
Revalidation of the origin of DNA molecules by constructing Escherichia coli deficient in the core enzyme of RNA origin theory
构建缺失RNA起源理论核心酶的大肠杆菌重新验证DNA分子起源
  • 批准号:
    20K21274
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Detection of Viable but Non-Culturable Escherichia coli O157:H7 Using DNA Aptamers
使用 DNA 适体检测存活但不可培养的大肠杆菌 O157:H7
  • 批准号:
    554201-2020
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
    University Undergraduate Student Research Awards
DNA Replication fork processing and recovery in living Escherichia coli cells
活大肠杆菌细胞中的 DNA 复制叉处理和恢复
  • 批准号:
    DP110102476
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
    Discovery Projects
Are the nonspecific electrostatic interactions between the a3 loop/helix of Escherichia coli NikR and DNA critical for DNA binding?
大肠杆菌 NikR 的 a3 环/螺旋与 DNA 之间的非特异性静电相互作用对于 DNA 结合是否至关重要?
  • 批准号:
    410327-2011
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
    Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Master's
Recruitment and activation of DnaB helicase in Escherichia coli DNA replication
大肠杆菌 DNA 复制中 DnaB 解旋酶的招募和激活
  • 批准号:
    8328635
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
Recruitment and activation of DnaB helicase in Escherichia coli DNA replication
大肠杆菌 DNA 复制中 DnaB 解旋酶的招募和激活
  • 批准号:
    8042048
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
Recruitment and activation of DnaB helicase in Escherichia coli DNA replication
大肠杆菌 DNA 复制中 DnaB 解旋酶的招募和激活
  • 批准号:
    8690097
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
Recruitment and activation of DnaB helicase in Escherichia coli DNA replication
大肠杆菌 DNA 复制中 DnaB 解旋酶的招募和激活
  • 批准号:
    8492114
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
Escherichia coli pan-genome analysis using next-generation DNA sequencing technologies
使用下一代 DNA 测序技术进行大肠杆菌泛基因组分析
  • 批准号:
    20310116
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 28.12万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了