MD SIMULATIONS OF THE TRANSMEMBRANE REGION OF GOLGI GLYCOSYLTRANSFERASES
高尔基体糖基转移酶跨膜区的 MD 模拟
基本信息
- 批准号:2463834
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:
- 资助国家:美国
- 起止时间:至
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
The beta-1,4-galactosyltransferase (beta-1,4GT) is a Golgi resident
type II integral membrane protein, with a short cytoplasmic N-terminal
domain, a transmembrane domain (TMD) and a large luminal C-terminal
domain which is involved in the terminal glycosylation of secreted
proteins. The TMD in this and in other similar Golgi resident proteins
is largely hydrophobic in character and on the average shorter than the
corresponding TMD in the plasma membrane type II proteins, and has been
shown to be important for Golgi retention. However, the exact
mechanism of its Golgi retention still remains unknown. The molecular
dynamics (MD) simulation of the TMD of beta-1,4GT has been conducted
to investigate whether its dynamic structural variations play any role
in its Golgi retention. The starting structure of the TMD was assumed
to be alpha-helical and the simulations were conducted in a periodic
box of octonal molecules to account for the low dielectric membrane
medium. Simulation of a double mutant in the TMD of beta-1,4GT
(His->Leu, Cys->Ser), which shows lack of Golgi retention, was also
conducted. Preliminary results show that the TMD of the wild type and
double mutant have very similar dynamic behavior. A detailed MD
simulations will aid in the understanding of the structural variations
in TMD and the role it plays in Golgi retention.
β-1,4-半乳糖基转移酶(β-1,4GT)是高尔基体的居民
II型整合膜蛋白,具有短的胞质N-末端
结构域、跨膜结构域(TMD)和大管腔C-末端
结构域,其参与分泌的
proteins. 在这个和其他类似的高尔基体驻留蛋白质中的TMD
在很大程度上是疏水性的,并且平均来说短于
在质膜II型蛋白质中的相应TMD,并且已经被
对高尔基体的保留很重要。 但具体
其高尔基体保留的机制仍不清楚。 分子
对β-1,4涡轮增压器的TMD进行了动力学仿真
来研究它的动态结构变化
在高尔基体的保留。 战区导弹防御系统的初始结构是假定的
是α螺旋的,并且以周期性的方式进行模拟。
用于解释低介电膜的八元分子盒
介质 β-1,4 GT TMD双突变体的模拟
(His->Leu,Cys->Ser),其显示缺乏高尔基体保留,
进行。 初步结果显示,野生型和
双突变体具有非常相似的动力学行为。 详细的MD
模拟将有助于理解结构变化
在TMD中的作用及其在高尔基体保留中的作用。
项目成果
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