RIBOSOMAL PROTEIN S4 INTERACTIONS WITH MRNA AND RRNA
核糖体蛋白 S4 与 mRNA 和 RRNA 的相互作用
基本信息
- 批准号:2464853
- 负责人:
- 金额:$ 25.84万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:1998
- 资助国家:美国
- 起止时间:1998-01-01 至 2001-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:Bacillus stearothermophilus Escherichia coli RNA binding protein bacterial proteins conformation magnesium ion messenger RNA molecular site nuclear magnetic resonance spectroscopy protein binding protein folding protein structure function ribonucleoproteins ribosomal RNA ribosomal proteins site directed mutagenesis thermodynamics translation factor
项目摘要
Complexes of RNA and protein (RNPs) carry out many essential functions in
the cell, including translation. How proteins within these complexes
recognized specific sites, promote RNA folding, and contribute to function
are important questions. The goal of this project is to explore these
question for a ribosomal protein, S4, that has dual functions: it is a key
protein in ribosome assembly, binding and organizing a approximately 500
nucleotide domain of the small subunit RNA, and also binds a 110
nucleotide pseudoknot structure in the alpha mRNA, where it represses
translation by a novel "entrapment" mechanism. The protein is organized
into at least three regions: an N-terminal segment (42 residues) is not
required for ribosome assembly: a middle domain is highly conserved and
mostly responsible for RNA recognition; a C-terminal domain may contribute
to both RNA and protein interactions. The structure of a fragment
containing the middle and C-terminal regions (159 residues), derived from
Bacillus stearothermophilus S4, will be determined by NMR methods. Site-
directed mutagenesis, selection approaches, and thermodynamic and kinetic
measurements will be used to explore the following aspects of S4-RNA
interactions:
Determination of conserved surface residues involved in mRNA or rRNA
binding;
Comparison of the ways in which S4 binding is linked to folding of the
ribosomal and messenger RNA recognition domains, paying particular
attention to the role of Mg/2+ in promoting RNA folding and protein
binding;
Resolution of the translational repression mechanism by studies of S4 and
30S subunit interactions with the mRNA ribosome binding site;
Studies of the cooperatively between S4 and other ribosomal proteins (S20
and S16) assembling with the 16S rRNA 5' domain.
Results from these studies should contribute to a basic understanding of
protein-RNA recognition mechanisms and RNA folding, as well as elucidation
of specific S4 roles in translational regulation and ribosome assembly.
RNA和蛋白质的复合物(RNP)在生物体内执行许多重要功能。
细胞,包括翻译。这些复合物中的蛋白质
识别特定位点,促进RNA折叠,并有助于功能
都是很重要的问题这个项目的目标是探索这些
核糖体蛋白质S4具有双重功能:它是一个关键,
蛋白质在核糖体组装,结合和组织约500
小亚基RNA的核苷酸结构域,并且还结合110
α mRNA中的核苷酸假结结构,在那里它抑制
一种新颖的“诱捕”机制。蛋白质是有组织的
至少分为三个区域:N-末端片段(42个残基)不
核糖体装配所需的:中间结构域是高度保守的,
主要负责RNA识别; C末端结构域可能有助于
RNA和蛋白质的相互作用。片段的结构
含有中间和C-末端区域(159个残基),来源于
嗜热脂肪芽孢杆菌S4将通过NMR方法测定。研究中心-
定向诱变,选择方法,以及热力学和动力学
测量将用于探索S4-RNA的以下方面
互动:
mRNA或rRNA中涉及的保守表面残基的测定
装订;
比较S4结合与蛋白质折叠的方式,
核糖体和信使RNA识别结构域,特别是
Mg/2+在促进RNA折叠和蛋白质合成中的作用
装订;
通过研究S4和S4蛋白解析翻译抑制机制
30 S亚基与mRNA核糖体结合位点的相互作用;
S4与其它核糖体蛋白(S20)的协同作用研究
和S16)与16 S rRNA 5’结构域组装。
这些研究的结果应该有助于对以下问题的基本理解:
蛋白质-RNA识别机制和RNA折叠,以及阐明
S4在翻译调控和核糖体组装中的特殊作用。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
DAVID E. DRAPER其他文献
DAVID E. DRAPER的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('DAVID E. DRAPER', 18)}}的其他基金
相似国自然基金
asr基因调控酸诱导的Escherichia coli O157:H7形成VBNC状态的机制研究
- 批准号:32302245
- 批准年份:2023
- 资助金额:30.00 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
小肠中Escherichia coli分泌细菌毒素诱导肠屏障损伤及细菌易位在炎症性肠病中的机制研究
- 批准号:82371775
- 批准年份:2023
- 资助金额:46 万元
- 项目类别:面上项目
基于Escherichia coli O157:H7亚致死态细胞探究超高压与原儿茶酸协同杀菌机制
- 批准号:31871817
- 批准年份:2018
- 资助金额:60.0 万元
- 项目类别:面上项目
肠肝轴:从临床患者分离的肠道致病菌株Escherichia coli NF73-1对非酒精性脂肪性肝病的作用及机制研究
- 批准号:81873549
- 批准年份:2018
- 资助金额:57.0 万元
- 项目类别:面上项目
高压二氧化碳诱导Escherichia coli O157:H7形成VBNC状态的分子机制
- 批准号:31571933
- 批准年份:2015
- 资助金额:57.0 万元
- 项目类别:面上项目
超高压诱导牛肉中Escherichia coli O157:H7亚致死损伤及其修复研究
- 批准号:31371861
- 批准年份:2013
- 资助金额:15.0 万元
- 项目类别:面上项目
高压二氧化碳诱导Escherichia coli O157:H7形成VBNC状态的机制
- 批准号:31371845
- 批准年份:2013
- 资助金额:15.0 万元
- 项目类别:面上项目
高密度二氧化碳致死Escherichia coli的相关蛋白质确证及其结构变化研究
- 批准号:31171774
- 批准年份:2011
- 资助金额:66.0 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Copper Sensing in Uropathogenic Escherichia coli
尿路致病性大肠杆菌中的铜感应
- 批准号:
10604449 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
Knowledgebase of Escherichia coli Genome and Metabolism
大肠杆菌基因组和代谢知识库
- 批准号:
10716050 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
Investigating metabolism and DNA damage repair in uropathogenic Escherichia coli fluoroquinolone persisters
研究泌尿道致病性大肠杆菌氟喹诺酮类持续存在的代谢和 DNA 损伤修复
- 批准号:
10747651 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
Development of new removal method targeting Escherichia coli causing colorectal cancer
开发针对引起结直肠癌的大肠杆菌的新去除方法
- 批准号:
23K19489 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
Metabolic engineering of Escherichia coli for carbon capture and hydrogen storage.
用于碳捕获和氢储存的大肠杆菌代谢工程。
- 批准号:
2869802 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
Studentship
Inactivation of Escherichia coli using high hydrostatic pressure from viewpoints of cell shrinkage and expansion
从细胞收缩和扩张的角度利用高静水压灭活大肠杆菌
- 批准号:
23K05105 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Structural Determinants of Permeation Barriers in Escherichia coli
大肠杆菌渗透屏障的结构决定因素
- 批准号:
10749251 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
Development of rotavirus-based enterotoxigenic Escherichia coli dual vaccines
基于轮状病毒的产肠毒素大肠杆菌双重疫苗的研制
- 批准号:
10741541 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
A novel genetic switch with an optimal ON/OFF ratio to preserve growth performance prior to Escherichia coli autolysis for enhanced plasmid release
一种具有最佳开/关比的新型基因开关,可在大肠杆菌自溶之前保持生长性能,从而增强质粒释放
- 批准号:
2881246 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别:
Studentship
DEVELOPMENT OF IN VITRO DIAGNOSTICS FOR ANTIMICROBIAL RESISTANCE ESCHERICHIA COLI
大肠杆菌耐药性体外诊断的开发
- 批准号:
10912990 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 25.84万 - 项目类别: