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Development of a Rapid Processing Pipeline and Graph-based Visualization for the Analysis of Next Generation Sequencing Data

开发用于分析下一代测序数据的快速处理管道和基于图形的可视化

基本信息

批准号：
BB/J019275/1
负责人：
Anton Enright
金额：
$ 24.05万
依托单位：
European Bioinformatics Institute
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2012
资助国家：
英国
起止时间：
2012 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FJ019275%2F1
关键词：
Development Rapid Processing Pipeline Graph

项目摘要

Abstracts are not currently available in GtR for all funded research. This is normally because the abstract was not required at the time of proposal submission, but may be because it included sensitive information such as personal details.

目前GtR中并没有提供所有资助研究的摘要。这通常是因为在提交提案时不需要摘要，但也可能是因为它包含敏感信息，如个人详细信息。

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Exploring regulatory networks of miR-96 in the developing inner ear.

DOI：
10.1038/srep23363
发表时间：
2016-03-18
期刊：
Scientific reports
影响因子：
4.6
作者：
Lewis MA;Buniello A;Hilton JM;Zhu F;Zhang WI;Evans S;van Dongen S;Enright AJ;Steel KP
通讯作者：
Steel KP

Kraken: a set of tools for quality control and analysis of high-throughput sequence data.

DOI：
10.1016/j.ymeth.2013.06.027
发表时间：
2013-09-01
期刊：
METHODS
影响因子：
4.8
作者：
Davis, Matthew P. A.;van Dongen, Stijn;Abreu-Goodger, Cei;Bartonicek, Nenad;Enright, Anton J.
通讯作者：
Enright, Anton J.

Visualisation of BioPAX Networks using BioLayout Express (3D).

DOI：
10.12688/f1000research.5499.1
发表时间：
2014
期刊：
F1000Research
影响因子：
0
作者：
Wright DW;Angus T;Enright AJ;Freeman TC
通讯作者：
Freeman TC

A high-resolution mRNA expression time course of embryonic development in zebrafish.

斑马鱼胚胎发育的高分辨率 mRNA 表达时间过程。

DOI：
10.7554/elife.30860
发表时间：
2017
期刊：
eLife
影响因子：
7.7
作者：
White RJ
通讯作者：
White RJ

An Interferon Regulated MicroRNA Provides Broad Cell-Intrinsic Antiviral Immunity through Multihit Host-Directed Targeting of the Sterol Pathway.

DOI：
10.1371/journal.pbio.1002364
发表时间：
2016-03
期刊：
PLoS biology
影响因子：
9.8
作者：
Robertson KA;Hsieh WY;Forster T;Blanc M;Lu H;Crick PJ;Yutuc E;Watterson S;Martin K;Griffiths SJ;Enright AJ;Yamamoto M;Pradeepa MM;Lennox KA;Behlke MA;Talbot S;Haas J;Dölken L;Griffiths WJ;Wang Y;Angulo A;Ghazal P
通讯作者：
Ghazal P

DOI：
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发表时间：
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期刊：
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影响因子：
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作者：
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通讯作者：
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数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

作者：
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作者：
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作者：
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数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

作者：
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数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

Anton Enright其他文献

Deciphering the role of micrornas in early stages of haematopoiesis

DOI：
10.1016/j.exphem.2013.05.151
发表时间：
2013-08-01
期刊：
Conference abstract
影响因子：
作者：
Camille Malouf;Nenad Bartonicek;Wendi Bacon;Chrysa Kapeni;Anton Enright;Katrin Ottersbach
通讯作者：
Katrin Ottersbach

Extracellular vesicles from neural stem cells transfer the IFN-γ/IFNGR1 complex to activate Stat1-dependent signalling in target cells

DOI：
10.1016/j.jneuroim.2014.08.513
发表时间：
2014-10-15
期刊：
Conference abstract
影响因子：
作者：
Nunzio Iraci;Chiara Cossetti;Tim Mercer;Tommaso Leonardi;Emanuele Alpi;Denise Drago;Clara Alfaro-cervello;Harpreet Saini;Matthew Davis;Julia Schaeffer;Werner Muller;Jose Manuel Garcia-verdugo;Suresh Mathivanan;Angela Bachi;Anton Enright;John Mattick;Stefano Pluchino
通讯作者：
Stefano Pluchino

Let-7 restrains an epigenetic circuit in AT2 cells to prevent fibrogenic intermediates in pulmonary fibrosis

Let-7 抑制 AT2 细胞中的表观遗传回路以防止肺纤维化中的纤维生成中间体

DOI：
10.1038/s41467-025-59641-1
发表时间：
2025-05-10
期刊：
Nature Communications
影响因子：
15.700
作者：
Matthew J. Seasock;Md Shafiquzzaman;Maria E. Ruiz-Echartea;Rupa S. Kanchi;Brandon T. Tran;Lukas M. Simon;Matthew D. Meyer;Phillip A. Erice;Shivani L. Lotlikar;Stephanie C. Wenlock;Scott A. Ochsner;Anton Enright;Alex F. Carisey;Freddy Romero;Ivan O. Rosas;Katherine Y. King;Neil J. McKenna;Cristian Coarfa;Antony Rodriguez
通讯作者：
Antony Rodriguez