Characterising the human epitranscriptome using catalysis-dependent RIP-Seq approaches
使用催化依赖性 RIP-Seq 方法表征人类表观转录组
基本信息
- 批准号:BB/N000749/1
- 负责人:
- 金额:$ 42.83万
- 依托单位:
- 依托单位国家:英国
- 项目类别:Research Grant
- 财政年份:2016
- 资助国家:英国
- 起止时间:2016 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
It has for decades been known that the building blocks, known as bases, within DNA and RNA molecules can be chemically modified. In DNA, the occurrence and biological function of such modifications has been a fundamentally important area of biosciences research with far-reaching impact. In stark contrast, the progress for research into RNA modifications has been very disappointing which is especially unfortunate as these modifications are actually known to be more prevalent and chemically complex than in DNA; and many of the enzymes that catalyse the RNA modifications have been linked with human disease, suggesting important biological roles. The primary reason for this slow progress has been due to the fact that similar detailed studies of RNA modifications have been technically very difficult. However in recent years, major advances in DNA/RNA sequencing techniques have been made that has allowed RNA modifications to be identified in the detail required to elucidate biological function. The first such studies were described in 2012 and indeed we are just now beginning to realise the potential scope offered by such investigations in biosciences research. The research field is however still in its very early stages and a massive concerted effort is required between laboratories in order to provide detailed maps of these RNA modifications, with preferably information regarding which cellular enzymes catalyse the modifications. The studies proposed here will provide major contributions to the field in this regard.
几十年来,人们已经知道,DNA和RNA分子中的基本组成部分,即碱基,可以进行化学修饰。在DNA中,这种修饰的发生和生物学功能一直是生物科学研究的一个重要领域,具有深远的影响。与之形成鲜明对比的是,RNA修饰的研究进展非常令人失望,尤其是不幸的是,这些修饰实际上比DNA更普遍,化学成分也更复杂;许多催化RNA修饰的酶与人类疾病有关,表明它们具有重要的生物学作用。进展缓慢的主要原因是,对RNA修饰进行类似的详细研究在技术上非常困难。然而,近年来,DNA/RNA测序技术取得了重大进展,这使得RNA修饰能够被详细地识别出来,从而阐明生物功能。第一个这样的研究是在2012年描述的,事实上,我们现在才开始意识到这类研究在生物科学研究中提供的潜在范围。然而,该研究领域仍处于非常早期的阶段,为了提供这些RNA修饰的详细地图,以及关于哪些细胞酶催化这些修饰的信息,需要实验室之间进行大量的协同努力。这里提出的研究将在这方面对该领域作出重大贡献。
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Robust long-read native DNA sequencing using the ONT CsgG Nanopore system
使用 ONT CsgG Nanopore 系统进行稳健的长读长天然 DNA 测序
- DOI:10.12688/wellcomeopenres.11246.2
- 发表时间:2017
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Carter J
- 通讯作者:Carter J
Robust long-read native DNA sequencing using the ONT CsgG Nanopore system.
- DOI:10.12688/wellcomeopenres.11246.3
- 发表时间:2017-04-06
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Carter JM;Hussain S
- 通讯作者:Hussain S
Sequence- and structure-specific cytosine-5 mRNA methylation by NSUN6.
- DOI:10.1093/nar/gkaa1193
- 发表时间:2021-01-25
- 期刊:
- 影响因子:14.9
- 作者:Selmi T;Hussain S;Dietmann S;Heiß M;Borland K;Flad S;Carter JM;Dennison R;Huang YL;Kellner S;Bornelöv S;Frye M
- 通讯作者:Frye M
Shaping and Reshaping Transcriptome Plasticity during Evolution.
进化过程中转录组可塑性的塑造和重塑。
- DOI:10.1016/j.tibs.2017.06.009
- 发表时间:2017
- 期刊:
- 影响因子:13.8
- 作者:Hussain S
- 通讯作者:Hussain S
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Shobbir Hussain其他文献
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- 作者:
Shobbir Hussain - 通讯作者:
Shobbir Hussain
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